RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.47□□□□□ -1.53
FCHO1-235ENST00000601247 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.47□□□□□ -1.53
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.46□□□□□ -1.54
FCHO1-235ENST00000601247 SVIPQ8NHG7 77 aa5.46□□□□□ -1.54
FCHO1-235ENST00000601247 MT1LQ93083 61 aa5.45□□□□□ -1.54
FCHO1-235ENST00000601247 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.44□□□□□ -1.54
FCHO1-235ENST00000601247 MT1GP13640 62 aa5.41□□□□□ -1.54
FCHO1-235ENST00000601247 MDN1Q9NU22 5596 aa5.39□□□□□ -1.55
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.38□□□□□ -1.55
FCHO1-235ENST00000601247 SPRR2DP22532 72 aa5.36□□□□□ -1.55
FCHO1-235ENST00000601247 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.36□□□□□ -1.55
FCHO1-235ENST00000601247 NEBP20929 6669 aa5.33□□□□□ -1.56
FCHO1-235ENST00000601247 MT1MQ8N339 61 aa5.3□□□□□ -1.56
FCHO1-235ENST00000601247 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.25□□□□□ -1.57
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.22□□□□□ -1.57
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.19□□□□□ -1.58
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.15□□□□□ -1.59
FCHO1-235ENST00000601247 LCE3BQ5TA77 95 aa5.15□□□□□ -1.59
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.15□□□□□ -1.59
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.13□□□□□ -1.59
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.01□□□□□ -1.61
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.01□□□□□ -1.61
FCHO1-235ENST00000601247 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.9□□□□□ -1.63
FCHO1-235ENST00000601247 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.89□□□□□ -1.63
FCHO1-235ENST00000601247 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.85□□□□□ -1.63
FCHO1-235ENST00000601247 LUZP6Q538Z0 58 aa4.78□□□□□ -1.64
FCHO1-235ENST00000601247 LCE4AQ5TA78 99 aa4.76□□□□□ -1.65
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.69□□□□□ -1.66
FCHO1-235ENST00000601247 MT1AP04731 61 aa4.66□□□□□ -1.66
FCHO1-235ENST00000601247 MT4P47944 62 aa4.63□□□□□ -1.67
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP12-4P60329 112 aa4.62□□□□□ -1.67
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.62□□□□□ -1.67
FCHO1-235ENST00000601247 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.61□□□□□ -1.67
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.57□□□□□ -1.68
FCHO1-235ENST00000601247 LCE1DQ5T752 114 aa4.57□□□□□ -1.68
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.5□□□□□ -1.69
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.44□□□□□ -1.7
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.43□□□□□ -1.7
FCHO1-235ENST00000601247 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
FCHO1-235ENST00000601247 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.42□□□□□ -1.7
FCHO1-235ENST00000601247 NDUFAF8A1L188 74 aa4.36□□□□□ -1.71
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.29□□□□□ -1.72
FCHO1-235ENST00000601247 MT3P25713 68 aa4.28□□□□□ -1.72
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.23□□□□□ -1.73
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.2□□□□□ -1.74
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.09□□□□□ -1.75
FCHO1-235ENST00000601247 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.08□□□□□ -1.76
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.99□□□□□ -1.77
FCHO1-235ENST00000601247 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.92□□□□□ -1.78
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.91□□□□□ -1.78
FCHO1-235ENST00000601247 A0A0A0MQY5 61 aa3.85□□□□□ -1.79
FCHO1-235ENST00000601247 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.78□□□□□ -1.8
FCHO1-235ENST00000601247 LCE1EQ5T753 118 aa3.75□□□□□ -1.81
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP5-8O75690 187 aa3.73□□□□□ -1.81
FCHO1-235ENST00000601247 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.72□□□□□ -1.81
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.66□□□□□ -1.82
FCHO1-235ENST00000601247 INE1O15225 51 aa3.63□□□□□ -1.83
FCHO1-235ENST00000601247 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.55□□□□□ -1.84
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.53□□□□□ -1.84
FCHO1-235ENST00000601247 MUC5ACP98088 5654 aa3.49□□□□□ -1.85
FCHO1-235ENST00000601247 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
FCHO1-235ENST00000601247 LCE1CQ5T751 118 aa3.47□□□□□ -1.85
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.45□□□□□ -1.86
FCHO1-235ENST00000601247 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
FCHO1-235ENST00000601247 H3BS24 57 aa3.31□□□□□ -1.88
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
FCHO1-235ENST00000601247 PRM1P04553 51 aa3.15□□□□□ -1.91
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.09□□□□□ -1.91
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.98□□□□□ -1.93
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.97□□□□□ -1.93
FCHO1-235ENST00000601247 LCE1FQ5T754 118 aa2.9□□□□□ -1.95
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.69□□□□□ -1.98
FCHO1-235ENST00000601247 PHGR1C9JFL3 82 aa2.64□□□□□ -1.99
FCHO1-235ENST00000601247 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.24□□□□□ -2.05
FCHO1-235ENST00000601247 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.84□□□□□ -2.11
FCHO1-235ENST00000601247 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.67□□□□□ -2.14
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