RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.15	□□□□□ -1.59
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.12	□□□□□ -1.59
FCHO1-231	ENST00000600201	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
FCHO1-231	ENST00000600201	TMEM258	P61165	79 aa		5.11	□□□□□ -1.59
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A1B0GU69	56 aa		5.07	□□□□□ -1.6
FCHO1-231	ENST00000600201	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.06	□□□□□ -1.6
FCHO1-231	ENST00000600201	TNP1	P09430	55 aa		5.04	□□□□□ -1.6
FCHO1-231	ENST00000600201	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.94	□□□□□ -1.62
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FCHO1-231	ENST00000600201	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FCHO1-231	ENST00000600201	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FCHO1-231	ENST00000600201	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FCHO1-231	ENST00000600201	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.8	□□□□□ -1.64
FCHO1-231	ENST00000600201		V9GYY9	64 aa		4.79	□□□□□ -1.64
FCHO1-231	ENST00000600201	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.78	□□□□□ -1.64
FCHO1-231	ENST00000600201	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FCHO1-231	ENST00000600201		Q1T7F1	81 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FCHO1-231	ENST00000600201	UQCR11	O14957	56 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FCHO1-231	ENST00000600201	PSPHP1	O15172	72 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FCHO1-231	ENST00000600201	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.59	□□□□□ -1.67
FCHO1-231	ENST00000600201		A6NED7	52 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FCHO1-231	ENST00000600201	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.49	□□□□□ -1.69
FCHO1-231	ENST00000600201	MT1A	P04731	61 aa		4.47	□□□□□ -1.69
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.47	□□□□□ -1.69
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.43	□□□□□ -1.7
FCHO1-231	ENST00000600201	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.43	□□□□□ -1.7
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.42	□□□□□ -1.7
FCHO1-231	ENST00000600201	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.42	□□□□□ -1.7
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FCHO1-231	ENST00000600201		K7ERS5	55 aa		4.4	□□□□□ -1.71
FCHO1-231	ENST00000600201	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.39	□□□□□ -1.71
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.37	□□□□□ -1.71
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.33	□□□□□ -1.72
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.32	□□□□□ -1.72
FCHO1-231	ENST00000600201	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.32	□□□□□ -1.72
FCHO1-231	ENST00000600201	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.29	□□□□□ -1.72
FCHO1-231	ENST00000600201	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.29	□□□□□ -1.72
FCHO1-231	ENST00000600201	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.28	□□□□□ -1.73
FCHO1-231	ENST00000600201	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.2	□□□□□ -1.74
FCHO1-231	ENST00000600201	ROMO1	P60602	79 aa		4.19	□□□□□ -1.74
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.08	□□□□□ -1.76
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.07	□□□□□ -1.76
FCHO1-231	ENST00000600201	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.06	□□□□□ -1.76
FCHO1-231	ENST00000600201	MT3	P25713	68 aa		4.03	□□□□□ -1.76
FCHO1-231	ENST00000600201	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.86	□□□□□ -1.79
FCHO1-231	ENST00000600201	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.72	□□□□□ -1.81
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.66	□□□□□ -1.82
FCHO1-231	ENST00000600201	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.62	□□□□□ -1.83
FCHO1-231	ENST00000600201	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.48	□□□□□ -1.85
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.42	□□□□□ -1.86
FCHO1-231	ENST00000600201		H3BS24	57 aa		3.37	□□□□□ -1.87
FCHO1-231	ENST00000600201	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.26	□□□□□ -1.89
FCHO1-231	ENST00000600201	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.2	□□□□□ -1.9
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.19	□□□□□ -1.9
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FCHO1-231	ENST00000600201	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.11	□□□□□ -1.91
FCHO1-231	ENST00000600201	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.07	□□□□□ -1.92
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FCHO1-231	ENST00000600201	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.97	□□□□□ -1.93
FCHO1-231	ENST00000600201	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.94	□□□□□ -1.94
FCHO1-231	ENST00000600201		A0A0A0MQY5	61 aa		2.89	□□□□□ -1.95
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.82	□□□□□ -1.96
FCHO1-231	ENST00000600201	INE1	O15225	51 aa		2.68	□□□□□ -1.98
FCHO1-231	ENST00000600201	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.67	□□□□□ -1.98
FCHO1-231	ENST00000600201	PRM1	P04553	51 aa		2.2	□□□□□ -2.06
FCHO1-231	ENST00000600201	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.17	□□□□□ -2.06
FCHO1-231	ENST00000600201	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.91	□□□□□ -2.1

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