RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599733.5

TIMM50-212, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM50, Length 669 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-212ENST00000599733 SPRR2DP22532 72 aa5.6□□□□□ -1.51
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
TIMM50-212ENST00000599733 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.59□□□□□ -1.51
TIMM50-212ENST00000599733 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.57□□□□□ -1.52
TIMM50-212ENST00000599733 A6NED7 52 aa5.53□□□□□ -1.52
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP10-12P60413 245 aa5.53□□□□□ -1.52
TIMM50-212ENST00000599733 K7ERS5 55 aa5.51□□□□□ -1.53
TIMM50-212ENST00000599733 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.43□□□□□ -1.54
TIMM50-212ENST00000599733 TNP1P09430 55 aa5.4□□□□□ -1.54
TIMM50-212ENST00000599733 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.4□□□□□ -1.54
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.37□□□□□ -1.55
TIMM50-212ENST00000599733 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.28□□□□□ -1.56
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.26□□□□□ -1.57
TIMM50-212ENST00000599733 LCE3AQ5TA76 89 aa5.23□□□□□ -1.57
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.21□□□□□ -1.58
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.19□□□□□ -1.58
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.19□□□□□ -1.58
TIMM50-212ENST00000599733 MT1EP04732 61 aa5.16□□□□□ -1.58
TIMM50-212ENST00000599733 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.15□□□□□ -1.59
TIMM50-212ENST00000599733 ROMO1P60602 79 aa5.12□□□□□ -1.59
TIMM50-212ENST00000599733 BRK1Q8WUW1 75 aa5.09□□□□□ -1.59
TIMM50-212ENST00000599733 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.09□□□□□ -1.6
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.07□□□□□ -1.6
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP12-3P60328 96 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMM50-212ENST00000599733 SVIPQ8NHG7 77 aa5.01□□□□□ -1.61
TIMM50-212ENST00000599733 PP632Q6XCG6 107 aa5□□□□□ -1.61
TIMM50-212ENST00000599733 MT1LQ93083 61 aa4.98□□□□□ -1.61
TIMM50-212ENST00000599733 MT1GP13640 62 aa4.97□□□□□ -1.61
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.94□□□□□ -1.62
TIMM50-212ENST00000599733 MT4P47944 62 aa4.93□□□□□ -1.62
TIMM50-212ENST00000599733 MT1MQ8N339 61 aa4.9□□□□□ -1.63
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.85□□□□□ -1.63
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.79□□□□□ -1.64
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.78□□□□□ -1.64
TIMM50-212ENST00000599733 PMAIP1Q13794 54 aa4.77□□□□□ -1.65
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.72□□□□□ -1.65
TIMM50-212ENST00000599733 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.65□□□□□ -1.67
TIMM50-212ENST00000599733 PRO0628Q9UI54 55 aa4.64□□□□□ -1.67
TIMM50-212ENST00000599733 A0A0A0MQY5 61 aa4.58□□□□□ -1.68
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.57□□□□□ -1.68
TIMM50-212ENST00000599733 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TIMM50-212ENST00000599733 PRAC1Q96KF2 57 aa4.52□□□□□ -1.69
TIMM50-212ENST00000599733 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.5□□□□□ -1.69
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TIMM50-212ENST00000599733 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.39□□□□□ -1.71
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP12-4P60329 112 aa4.37□□□□□ -1.71
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.32□□□□□ -1.72
TIMM50-212ENST00000599733 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
TIMM50-212ENST00000599733 MUC5ACP98088 5654 aa4.26□□□□□ -1.73
TIMM50-212ENST00000599733 MT1AP04731 61 aa4.25□□□□□ -1.73
TIMM50-212ENST00000599733 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.2□□□□□ -1.74
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.19□□□□□ -1.74
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP5-8O75690 187 aa4.16□□□□□ -1.74
TIMM50-212ENST00000599733 MT3P25713 68 aa4.1□□□□□ -1.75
TIMM50-212ENST00000599733 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.09□□□□□ -1.75
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.98□□□□□ -1.77
TIMM50-212ENST00000599733 LUZP6Q538Z0 58 aa3.85□□□□□ -1.79
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.82□□□□□ -1.8
TIMM50-212ENST00000599733 LCE1EQ5T753 118 aa3.72□□□□□ -1.81
TIMM50-212ENST00000599733 LCE1FQ5T754 118 aa3.7□□□□□ -1.82
TIMM50-212ENST00000599733 NDUFAF8A1L188 74 aa3.69□□□□□ -1.82
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.66□□□□□ -1.82
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
TIMM50-212ENST00000599733 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.43□□□□□ -1.86
TIMM50-212ENST00000599733 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.33□□□□□ -1.88
TIMM50-212ENST00000599733 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.28□□□□□ -1.88
TIMM50-212ENST00000599733 LCE1CQ5T751 118 aa3.24□□□□□ -1.89
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.92□□□□□ -1.94
TIMM50-212ENST00000599733 PHGR1C9JFL3 82 aa2.85□□□□□ -1.95
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.72□□□□□ -1.97
TIMM50-212ENST00000599733 INE1O15225 51 aa2.71□□□□□ -1.98
TIMM50-212ENST00000599733 PRM1P04553 51 aa2.65□□□□□ -1.99
TIMM50-212ENST00000599733 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.58□□□□□ -2
TIMM50-212ENST00000599733 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.16□□□□□ -2.06
TIMM50-212ENST00000599733 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.8 ms