RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597474.5

FCHO1-220, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-220ENST00000597474 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.57□□□□□ -1.68
FCHO1-220ENST00000597474 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
FCHO1-220ENST00000597474 A0A1B0GU69 56 aa4.55□□□□□ -1.68
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP12-1P59990 96 aa4.53□□□□□ -1.68
FCHO1-220ENST00000597474 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.48□□□□□ -1.69
FCHO1-220ENST00000597474 A8MU10 97 aa4.48□□□□□ -1.69
FCHO1-220ENST00000597474 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
FCHO1-220ENST00000597474 SVIPQ8NHG7 77 aa4.47□□□□□ -1.69
FCHO1-220ENST00000597474 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.45□□□□□ -1.7
FCHO1-220ENST00000597474 LCE3AQ5TA76 89 aa4.43□□□□□ -1.7
FCHO1-220ENST00000597474 MUC5ACP98088 5654 aa4.42□□□□□ -1.7
FCHO1-220ENST00000597474 PRR15LQ9BU68 103 aa4.41□□□□□ -1.7
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.4□□□□□ -1.71
FCHO1-220ENST00000597474 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.39□□□□□ -1.71
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.38□□□□□ -1.71
FCHO1-220ENST00000597474 TMEM258P61165 79 aa4.37□□□□□ -1.71
FCHO1-220ENST00000597474 TNP1P09430 55 aa4.3□□□□□ -1.72
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
FCHO1-220ENST00000597474 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
FCHO1-220ENST00000597474 UQCR11O14957 56 aa4.28□□□□□ -1.72
FCHO1-220ENST00000597474 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
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FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP12-4P60329 112 aa4.21□□□□□ -1.74
FCHO1-220ENST00000597474 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.19□□□□□ -1.74
FCHO1-220ENST00000597474 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.17□□□□□ -1.74
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FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.13□□□□□ -1.75
FCHO1-220ENST00000597474 V9GYY9 64 aa4.13□□□□□ -1.75
FCHO1-220ENST00000597474 Q1T7F1 81 aa4.11□□□□□ -1.75
FCHO1-220ENST00000597474 K7ERS5 55 aa4.09□□□□□ -1.75
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FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP5-8O75690 187 aa4.06□□□□□ -1.76
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.02□□□□□ -1.77
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4□□□□□ -1.77
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FCHO1-220ENST00000597474 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
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FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.9□□□□□ -1.79
FCHO1-220ENST00000597474 MT1AP04731 61 aa3.89□□□□□ -1.79
FCHO1-220ENST00000597474 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.89□□□□□ -1.79
FCHO1-220ENST00000597474 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.87□□□□□ -1.79
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.85□□□□□ -1.79
FCHO1-220ENST00000597474 ROMO1P60602 79 aa3.83□□□□□ -1.8
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.79□□□□□ -1.8
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.79□□□□□ -1.8
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.72□□□□□ -1.81
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.65□□□□□ -1.83
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FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.23□□□□□ -1.89
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FCHO1-220ENST00000597474 A0A0A0MQY5 61 aa3.18□□□□□ -1.9
FCHO1-220ENST00000597474 H3BS24 57 aa3.17□□□□□ -1.9
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FCHO1-220ENST00000597474 PRO0628Q9UI54 55 aa3.15□□□□□ -1.91
FCHO1-220ENST00000597474 LCE1CQ5T751 118 aa3.1□□□□□ -1.91
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.04□□□□□ -1.92
FCHO1-220ENST00000597474 PHGR1C9JFL3 82 aa3.02□□□□□ -1.93
FCHO1-220ENST00000597474 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.98□□□□□ -1.93
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.89□□□□□ -1.95
FCHO1-220ENST00000597474 LCE1FQ5T754 118 aa2.84□□□□□ -1.95
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
FCHO1-220ENST00000597474 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.74□□□□□ -1.97
FCHO1-220ENST00000597474 LUZP6Q538Z0 58 aa2.63□□□□□ -1.99
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.58□□□□□ -2
FCHO1-220ENST00000597474 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.58□□□□□ -2
FCHO1-220ENST00000597474 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.44□□□□□ -2.02
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.43□□□□□ -2.02
FCHO1-220ENST00000597474 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.33□□□□□ -2.04
FCHO1-220ENST00000597474 NDUFAF8A1L188 74 aa2.22□□□□□ -2.05
FCHO1-220ENST00000597474 PRM1P04553 51 aa1.97□□□□□ -2.09
FCHO1-220ENST00000597474 INE1O15225 51 aa1.86□□□□□ -2.11
FCHO1-220ENST00000597474 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.73□□□□□ -2.13
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