RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596951.5

FCHO1-218, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.06□□□□□ -1.76
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.06□□□□□ -1.76
FCHO1-218ENST00000596951 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.06□□□□□ -1.76
FCHO1-218ENST00000596951 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.05□□□□□ -1.76
FCHO1-218ENST00000596951 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
FCHO1-218ENST00000596951 MT1EP04732 61 aa3.93□□□□□ -1.78
FCHO1-218ENST00000596951 MT1LQ93083 61 aa3.93□□□□□ -1.78
FCHO1-218ENST00000596951 MDN1Q9NU22 5596 aa3.92□□□□□ -1.78
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.9□□□□□ -1.79
FCHO1-218ENST00000596951 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.87□□□□□ -1.79
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.84□□□□□ -1.79
FCHO1-218ENST00000596951 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.84□□□□□ -1.8
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.78□□□□□ -1.8
FCHO1-218ENST00000596951 MT1GP13640 62 aa3.78□□□□□ -1.81
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.75□□□□□ -1.81
FCHO1-218ENST00000596951 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.69□□□□□ -1.82
FCHO1-218ENST00000596951 MT1MQ8N339 61 aa3.67□□□□□ -1.82
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP5-9P26371 169 aa3.67□□□□□ -1.82
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP12-4P60329 112 aa3.67□□□□□ -1.82
FCHO1-218ENST00000596951 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.62□□□□□ -1.83
FCHO1-218ENST00000596951 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.62□□□□□ -1.83
FCHO1-218ENST00000596951 SPRR2EP22531 72 aa3.6□□□□□ -1.83
FCHO1-218ENST00000596951 SPRR2BP35325 72 aa3.6□□□□□ -1.83
FCHO1-218ENST00000596951 SPRR2AP35326 72 aa3.6□□□□□ -1.83
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.59□□□□□ -1.84
FCHO1-218ENST00000596951 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.55□□□□□ -1.84
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.54□□□□□ -1.84
FCHO1-218ENST00000596951 NEBP20929 6669 aa3.52□□□□□ -1.85
FCHO1-218ENST00000596951 LCE3BQ5TA77 95 aa3.51□□□□□ -1.85
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.51□□□□□ -1.85
FCHO1-218ENST00000596951 SPRR2DP22532 72 aa3.45□□□□□ -1.86
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.39□□□□□ -1.87
FCHO1-218ENST00000596951 MT1AP04731 61 aa3.33□□□□□ -1.88
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
FCHO1-218ENST00000596951 PRM1P04553 51 aa3.29□□□□□ -1.88
FCHO1-218ENST00000596951 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.29□□□□□ -1.88
FCHO1-218ENST00000596951 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.27□□□□□ -1.89
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.11□□□□□ -1.91
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.1□□□□□ -1.91
FCHO1-218ENST00000596951 MT4P47944 62 aa3.09□□□□□ -1.91
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.08□□□□□ -1.92
FCHO1-218ENST00000596951 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.08□□□□□ -1.92
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.07□□□□□ -1.92
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.06□□□□□ -1.92
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.06□□□□□ -1.92
FCHO1-218ENST00000596951 LCE1DQ5T752 114 aa2.98□□□□□ -1.93
FCHO1-218ENST00000596951 LCE4AQ5TA78 99 aa2.95□□□□□ -1.94
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.91□□□□□ -1.94
FCHO1-218ENST00000596951 MT3P25713 68 aa2.91□□□□□ -1.94
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.79□□□□□ -1.96
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.77□□□□□ -1.97
FCHO1-218ENST00000596951 LCE1EQ5T753 118 aa2.71□□□□□ -1.98
FCHO1-218ENST00000596951 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.65□□□□□ -1.98
FCHO1-218ENST00000596951 MUC5ACP98088 5654 aa2.62□□□□□ -1.99
FCHO1-218ENST00000596951 LCE1FQ5T754 118 aa2.58□□□□□ -2
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.53□□□□□ -2
FCHO1-218ENST00000596951 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.52□□□□□ -2.01
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.45□□□□□ -2.02
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP5-8O75690 187 aa2.43□□□□□ -2.02
FCHO1-218ENST00000596951 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.43□□□□□ -2.02
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.41□□□□□ -2.02
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.36□□□□□ -2.03
FCHO1-218ENST00000596951 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.04
FCHO1-218ENST00000596951 LCE1CQ5T751 118 aa2.29□□□□□ -2.04
FCHO1-218ENST00000596951 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.27□□□□□ -2.05
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.25□□□□□ -2.05
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.23□□□□□ -2.05
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.15□□□□□ -2.07
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.14□□□□□ -2.07
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.09□□□□□ -2.07
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.08□□□□□ -2.08
FCHO1-218ENST00000596951 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.01□□□□□ -2.09
FCHO1-218ENST00000596951 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
FCHO1-218ENST00000596951 PHGR1C9JFL3 82 aa1.76□□□□□ -2.13
FCHO1-218ENST00000596951 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.14□□□□□ -2.23
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.5 ms