RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.73□□□□□ -1.65
CTIF-211ENST00000592658 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.69□□□□□ -1.66
CTIF-211ENST00000592658 A0A0D9SG42 100 aa4.68□□□□□ -1.66
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.67□□□□□ -1.66
CTIF-211ENST00000592658 MT1LQ93083 61 aa4.66□□□□□ -1.66
CTIF-211ENST00000592658 CCDC179H3BU77 68 aa4.64□□□□□ -1.67
CTIF-211ENST00000592658 SEC61GP60059 68 aa4.62□□□□□ -1.67
CTIF-211ENST00000592658 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.62□□□□□ -1.67
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.6□□□□□ -1.67
CTIF-211ENST00000592658 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.6□□□□□ -1.67
CTIF-211ENST00000592658 A0A1B0GU33 70 aa4.57□□□□□ -1.68
CTIF-211ENST00000592658 A0A1B0GU69 56 aa4.52□□□□□ -1.69
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP12-1P59990 96 aa4.5□□□□□ -1.69
CTIF-211ENST00000592658 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.5□□□□□ -1.69
CTIF-211ENST00000592658 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
CTIF-211ENST00000592658 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
CTIF-211ENST00000592658 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.47□□□□□ -1.69
CTIF-211ENST00000592658 A8MU10 97 aa4.46□□□□□ -1.7
CTIF-211ENST00000592658 LCE3AQ5TA76 89 aa4.44□□□□□ -1.7
CTIF-211ENST00000592658 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.43□□□□□ -1.7
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
CTIF-211ENST00000592658 TMEM258P61165 79 aa4.42□□□□□ -1.7
CTIF-211ENST00000592658 MUC5ACP98088 5654 aa4.4□□□□□ -1.7
CTIF-211ENST00000592658 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
CTIF-211ENST00000592658 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.39□□□□□ -1.71
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP12-4P60329 112 aa4.38□□□□□ -1.71
CTIF-211ENST00000592658 PRR15LQ9BU68 103 aa4.38□□□□□ -1.71
CTIF-211ENST00000592658 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
CTIF-211ENST00000592658 TNP1P09430 55 aa4.29□□□□□ -1.72
CTIF-211ENST00000592658 UQCR11O14957 56 aa4.25□□□□□ -1.73
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP12-3P60328 96 aa4.24□□□□□ -1.73
CTIF-211ENST00000592658 H3BS24 57 aa4.22□□□□□ -1.73
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP5-8O75690 187 aa4.22□□□□□ -1.73
CTIF-211ENST00000592658 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
CTIF-211ENST00000592658 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.18□□□□□ -1.74
CTIF-211ENST00000592658 PSPHP1O15172 72 aa4.17□□□□□ -1.74
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.16□□□□□ -1.74
CTIF-211ENST00000592658 Q1T7F1 81 aa4.15□□□□□ -1.75
CTIF-211ENST00000592658 V9GYY9 64 aa4.13□□□□□ -1.75
CTIF-211ENST00000592658 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.04□□□□□ -1.76
CTIF-211ENST00000592658 K7ERS5 55 aa4.04□□□□□ -1.76
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.02□□□□□ -1.77
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CTIF-211ENST00000592658 A6NED7 52 aa4□□□□□ -1.77
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.97□□□□□ -1.77
CTIF-211ENST00000592658 MT1AP04731 61 aa3.95□□□□□ -1.78
CTIF-211ENST00000592658 PRO0628Q9UI54 55 aa3.89□□□□□ -1.79
CTIF-211ENST00000592658 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.87□□□□□ -1.79
CTIF-211ENST00000592658 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.87□□□□□ -1.79
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.86□□□□□ -1.79
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.85□□□□□ -1.79
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.84□□□□□ -1.79
CTIF-211ENST00000592658 ROMO1P60602 79 aa3.82□□□□□ -1.8
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.82□□□□□ -1.8
CTIF-211ENST00000592658 BRK1Q8WUW1 75 aa3.81□□□□□ -1.8
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.76□□□□□ -1.81
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.7□□□□□ -1.82
CTIF-211ENST00000592658 PMAIP1Q13794 54 aa3.63□□□□□ -1.83
CTIF-211ENST00000592658 MT3P25713 68 aa3.62□□□□□ -1.83
CTIF-211ENST00000592658 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.56□□□□□ -1.84
CTIF-211ENST00000592658 LCE1EQ5T753 118 aa3.45□□□□□ -1.86
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.35□□□□□ -1.87
CTIF-211ENST00000592658 A0A0A0MQY5 61 aa3.32□□□□□ -1.88
CTIF-211ENST00000592658 PRAC1Q96KF2 57 aa3.3□□□□□ -1.88
CTIF-211ENST00000592658 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.26□□□□□ -1.89
CTIF-211ENST00000592658 LCE1CQ5T751 118 aa3.21□□□□□ -1.9
CTIF-211ENST00000592658 LCE1FQ5T754 118 aa2.99□□□□□ -1.93
CTIF-211ENST00000592658 PHGR1C9JFL3 82 aa2.96□□□□□ -1.94
CTIF-211ENST00000592658 NDUFAF8A1L188 74 aa2.8□□□□□ -1.96
CTIF-211ENST00000592658 LUZP6Q538Z0 58 aa2.76□□□□□ -1.97
CTIF-211ENST00000592658 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.69□□□□□ -1.98
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.62□□□□□ -1.99
CTIF-211ENST00000592658 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.55□□□□□ -2
CTIF-211ENST00000592658 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.53□□□□□ -2
CTIF-211ENST00000592658 INE1O15225 51 aa2.39□□□□□ -2.03
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.26□□□□□ -2.05
CTIF-211ENST00000592658 PRM1P04553 51 aa1.98□□□□□ -2.09
CTIF-211ENST00000592658 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.85□□□□□ -2.11
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