RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591387.5

CTIF-209, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 859 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-209ENST00000591387 UQCR11O14957 56 aa6.26□□□□□ -1.41
CTIF-209ENST00000591387 TMEM258P61165 79 aa6.26□□□□□ -1.41
CTIF-209ENST00000591387 LCE1DQ5T752 114 aa6.26□□□□□ -1.41
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.19□□□□□ -1.42
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP12-3P60328 96 aa6.18□□□□□ -1.42
CTIF-209ENST00000591387 MT4P47944 62 aa6.17□□□□□ -1.42
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.15□□□□□ -1.42
CTIF-209ENST00000591387 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.09□□□□□ -1.43
CTIF-209ENST00000591387 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.09□□□□□ -1.43
CTIF-209ENST00000591387 SVIPQ8NHG7 77 aa6.08□□□□□ -1.44
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.07□□□□□ -1.44
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.04□□□□□ -1.44
CTIF-209ENST00000591387 K7ERS5 55 aa6.03□□□□□ -1.44
CTIF-209ENST00000591387 H3BS24 57 aa6□□□□□ -1.45
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6□□□□□ -1.45
CTIF-209ENST00000591387 V9GYY9 64 aa5.99□□□□□ -1.45
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.94□□□□□ -1.46
CTIF-209ENST00000591387 PSPHP1O15172 72 aa5.9□□□□□ -1.46
CTIF-209ENST00000591387 Q1T7F1 81 aa5.9□□□□□ -1.46
CTIF-209ENST00000591387 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.88□□□□□ -1.47
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.88□□□□□ -1.47
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.86□□□□□ -1.47
CTIF-209ENST00000591387 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.81□□□□□ -1.48
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.79□□□□□ -1.48
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP12-4P60329 112 aa5.78□□□□□ -1.48
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.76□□□□□ -1.49
CTIF-209ENST00000591387 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.72□□□□□ -1.49
CTIF-209ENST00000591387 A6NED7 52 aa5.72□□□□□ -1.49
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.72□□□□□ -1.49
CTIF-209ENST00000591387 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.68□□□□□ -1.5
CTIF-209ENST00000591387 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.67□□□□□ -1.5
CTIF-209ENST00000591387 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.66□□□□□ -1.5
CTIF-209ENST00000591387 ROMO1P60602 79 aa5.57□□□□□ -1.52
CTIF-209ENST00000591387 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CTIF-209ENST00000591387 PCP4P48539 62 aa5.51□□□□□ -1.53
CTIF-209ENST00000591387 MT1AP04731 61 aa5.47□□□□□ -1.53
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.41□□□□□ -1.54
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.38□□□□□ -1.55
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.32□□□□□ -1.56
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.32□□□□□ -1.56
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.3□□□□□ -1.56
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.18□□□□□ -1.58
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP5-8O75690 187 aa5.13□□□□□ -1.59
CTIF-209ENST00000591387 MT3P25713 68 aa5.02□□□□□ -1.61
CTIF-209ENST00000591387 OBSCNQ5VST9 7968 aa5□□□□□ -1.61
CTIF-209ENST00000591387 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CTIF-209ENST00000591387 MUC5ACP98088 5654 aa4.91□□□□□ -1.62
CTIF-209ENST00000591387 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.9□□□□□ -1.63
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.82□□□□□ -1.64
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.79□□□□□ -1.64
CTIF-209ENST00000591387 BRK1Q8WUW1 75 aa4.78□□□□□ -1.64
CTIF-209ENST00000591387 LCE1EQ5T753 118 aa4.65□□□□□ -1.67
CTIF-209ENST00000591387 PRO0628Q9UI54 55 aa4.6□□□□□ -1.67
CTIF-209ENST00000591387 PMAIP1Q13794 54 aa4.51□□□□□ -1.69
CTIF-209ENST00000591387 A0A0A0MQY5 61 aa4.5□□□□□ -1.69
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.35□□□□□ -1.71
CTIF-209ENST00000591387 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.32□□□□□ -1.72
CTIF-209ENST00000591387 PRAC1Q96KF2 57 aa4.32□□□□□ -1.72
CTIF-209ENST00000591387 LCE1CQ5T751 118 aa4.3□□□□□ -1.72
CTIF-209ENST00000591387 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.13□□□□□ -1.75
CTIF-209ENST00000591387 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.09□□□□□ -1.75
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.89□□□□□ -1.79
CTIF-209ENST00000591387 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.85□□□□□ -1.79
CTIF-209ENST00000591387 LCE1FQ5T754 118 aa3.83□□□□□ -1.8
CTIF-209ENST00000591387 LUZP6Q538Z0 58 aa3.76□□□□□ -1.81
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.57□□□□□ -1.84
CTIF-209ENST00000591387 NDUFAF8A1L188 74 aa3.45□□□□□ -1.86
CTIF-209ENST00000591387 PHGR1C9JFL3 82 aa3.41□□□□□ -1.86
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.24□□□□□ -1.89
CTIF-209ENST00000591387 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.1□□□□□ -1.91
CTIF-209ENST00000591387 INE1O15225 51 aa2.92□□□□□ -1.94
CTIF-209ENST00000591387 PRM1P04553 51 aa2.81□□□□□ -1.96
CTIF-209ENST00000591387 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.62□□□□□ -1.99
CTIF-209ENST00000591387 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.22□□□□□ -2.05
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