RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 ACYP2P14621 99 aa3.3□□□□□ -1.88
EFTUD2-216ENST00000590105 DMAC1Q96GE9 116 aa3.3□□□□□ -1.88
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
EFTUD2-216ENST00000590105 C20orf197Q8N268 126 aa3.26□□□□□ -1.89
EFTUD2-216ENST00000590105 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
EFTUD2-216ENST00000590105 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.24□□□□□ -1.89
EFTUD2-216ENST00000590105 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.24□□□□□ -1.89
EFTUD2-216ENST00000590105 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
EFTUD2-216ENST00000590105 INE1O15225 51 aa3.23□□□□□ -1.89
EFTUD2-216ENST00000590105 SERP2Q8N6R1 65 aa3.23□□□□□ -1.89
EFTUD2-216ENST00000590105 SNURFQ9Y675 71 aa3.23□□□□□ -1.89
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.22□□□□□ -1.89
EFTUD2-216ENST00000590105 PLAC4Q8WY50 150 aa3.22□□□□□ -1.89
EFTUD2-216ENST00000590105 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.21□□□□□ -1.9
EFTUD2-216ENST00000590105 M0QZ58 72 aa3.19□□□□□ -1.9
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.18□□□□□ -1.9
EFTUD2-216ENST00000590105 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.16□□□□□ -1.9
EFTUD2-216ENST00000590105 MT1XP80297 61 aa3.1□□□□□ -1.91
EFTUD2-216ENST00000590105 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.08□□□□□ -1.92
EFTUD2-216ENST00000590105 H7BZZ5 65 aa3.07□□□□□ -1.92
EFTUD2-216ENST00000590105 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
EFTUD2-216ENST00000590105 LCE1CQ5T751 118 aa3.06□□□□□ -1.92
EFTUD2-216ENST00000590105 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.06□□□□□ -1.92
EFTUD2-216ENST00000590105 NEBP20929 6669 aa3.06□□□□□ -1.92
EFTUD2-216ENST00000590105 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.02□□□□□ -1.93
EFTUD2-216ENST00000590105 PP632Q6XCG6 107 aa3.01□□□□□ -1.93
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3□□□□□ -1.93
EFTUD2-216ENST00000590105 KMT2DO14686 5537 aa3□□□□□ -1.93
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.99□□□□□ -1.93
EFTUD2-216ENST00000590105 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.98□□□□□ -1.93
EFTUD2-216ENST00000590105 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.96□□□□□ -1.94
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A0D9SG42 100 aa2.95□□□□□ -1.94
EFTUD2-216ENST00000590105 A0A1B0GU69 56 aa2.95□□□□□ -1.94
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP12-1P59990 96 aa2.94□□□□□ -1.94
EFTUD2-216ENST00000590105 MDN1Q9NU22 5596 aa2.93□□□□□ -1.94
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.92□□□□□ -1.94
EFTUD2-216ENST00000590105 SPRR2EP22531 72 aa2.92□□□□□ -1.94
EFTUD2-216ENST00000590105 SPRR2BP35325 72 aa2.92□□□□□ -1.94
EFTUD2-216ENST00000590105 SPRR2AP35326 72 aa2.92□□□□□ -1.94
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.92□□□□□ -1.94
EFTUD2-216ENST00000590105 PRR15LQ9BU68 103 aa2.9□□□□□ -1.95
EFTUD2-216ENST00000590105 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.88□□□□□ -1.95
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP5-8O75690 187 aa2.84□□□□□ -1.95
EFTUD2-216ENST00000590105 SPRR2DP22532 72 aa2.83□□□□□ -1.96
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.82□□□□□ -1.96
EFTUD2-216ENST00000590105 UQCR11O14957 56 aa2.8□□□□□ -1.96
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.78□□□□□ -1.96
EFTUD2-216ENST00000590105 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.78□□□□□ -1.96
EFTUD2-216ENST00000590105 TNP1P09430 55 aa2.77□□□□□ -1.97
EFTUD2-216ENST00000590105 MT1EP04732 61 aa2.75□□□□□ -1.97
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.73□□□□□ -1.97
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.73□□□□□ -1.97
EFTUD2-216ENST00000590105 MT1GP13640 62 aa2.71□□□□□ -1.98
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP12-4P60329 112 aa2.67□□□□□ -1.98
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP12-3P60328 96 aa2.65□□□□□ -1.99
EFTUD2-216ENST00000590105 MT1LQ93083 61 aa2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-216ENST00000590105 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-216ENST00000590105 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.62□□□□□ -1.99
EFTUD2-216ENST00000590105 MT1MQ8N339 61 aa2.62□□□□□ -1.99
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.57□□□□□ -2
EFTUD2-216ENST00000590105 MT4P47944 62 aa2.46□□□□□ -2.02
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.4□□□□□ -2.03
EFTUD2-216ENST00000590105 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.38□□□□□ -2.03
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.32□□□□□ -2.04
EFTUD2-216ENST00000590105 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.31□□□□□ -2.04
EFTUD2-216ENST00000590105 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.31□□□□□ -2.04
EFTUD2-216ENST00000590105 MT1AP04731 61 aa2.26□□□□□ -2.05
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.25□□□□□ -2.05
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.23□□□□□ -2.05
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.12□□□□□ -2.07
EFTUD2-216ENST00000590105 MUC5ACP98088 5654 aa1.93□□□□□ -2.1
EFTUD2-216ENST00000590105 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
EFTUD2-216ENST00000590105 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.89□□□□□ -2.11
EFTUD2-216ENST00000590105 PHGR1C9JFL3 82 aa1.37□□□□□ -2.19
EFTUD2-216ENST00000590105 PRM1P04553 51 aa1.26□□□□□ -2.21
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.07□□□□□ -2.24
EFTUD2-216ENST00000590105 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.05□□□□□ -2.24
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms