RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583983.1

GPS1-222, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 5

Gene GPS1, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-222	ENST00000583983	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	7.93	□□□□□ -1.14
GPS1-222	ENST00000583983	MT1G	P13640	62 aa		7.89	□□□□□ -1.15
GPS1-222	ENST00000583983		A6NED7	52 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GPS1-222	ENST00000583983	MT1L	Q93083	61 aa		7.85	□□□□□ -1.15
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		7.81	□□□□□ -1.16
GPS1-222	ENST00000583983	PP632	Q6XCG6	107 aa		7.8	□□□□□ -1.16
GPS1-222	ENST00000583983	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
GPS1-222	ENST00000583983	MT1M	Q8N339	61 aa		7.76	□□□□□ -1.17
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP12-3	P60328	96 aa		7.73	□□□□□ -1.17
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		7.58	□□□□□ -1.2
GPS1-222	ENST00000583983	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		7.56	□□□□□ -1.2
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		7.53	□□□□□ -1.2
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		7.48	□□□□□ -1.21
GPS1-222	ENST00000583983	ROMO1	P60602	79 aa		7.46	□□□□□ -1.22
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		7.42	□□□□□ -1.22
GPS1-222	ENST00000583983	LCE4A	Q5TA78	99 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		7.31	□□□□□ -1.24
GPS1-222	ENST00000583983	LCE1D	Q5T752	114 aa		7.28	□□□□□ -1.24
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		7.27	□□□□□ -1.25
GPS1-222	ENST00000583983	MT4	P47944	62 aa		7.22	□□□□□ -1.25
GPS1-222	ENST00000583983	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		7.21	□□□□□ -1.25
GPS1-222	ENST00000583983	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		7.15	□□□□□ -1.26
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
GPS1-222	ENST00000583983	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.07	□□□□□ -1.28
GPS1-222	ENST00000583983	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		7.06	□□□□□ -1.28
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.06	□□□□□ -1.28
GPS1-222	ENST00000583983	BRK1	Q8WUW1	75 aa		6.98	□□□□□ -1.29
GPS1-222	ENST00000583983	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.84	□□□□□ -1.31
GPS1-222	ENST00000583983	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.83	□□□□□ -1.32
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.83	□□□□□ -1.32
GPS1-222	ENST00000583983	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.75	□□□□□ -1.33
GPS1-222	ENST00000583983	MT1A	P04731	61 aa		6.68	□□□□□ -1.34
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.64	□□□□□ -1.35
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.63	□□□□□ -1.35
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.63	□□□□□ -1.35
GPS1-222	ENST00000583983	PMAIP1	Q13794	54 aa		6.57	□□□□□ -1.36
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.44	□□□□□ -1.38
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		6.41	□□□□□ -1.38
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.35	□□□□□ -1.39
GPS1-222	ENST00000583983	PRAC1	Q96KF2	57 aa		6.3	□□□□□ -1.4
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		6.29	□□□□□ -1.4
GPS1-222	ENST00000583983	PRO0628	Q9UI54	55 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.18	□□□□□ -1.42
GPS1-222	ENST00000583983	MT3	P25713	68 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.97	□□□□□ -1.45
GPS1-222	ENST00000583983	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.94	□□□□□ -1.46
GPS1-222	ENST00000583983	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.93	□□□□□ -1.46
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.7	□□□□□ -1.5
GPS1-222	ENST00000583983	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.66	□□□□□ -1.5
GPS1-222	ENST00000583983	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.63	□□□□□ -1.51
GPS1-222	ENST00000583983	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
GPS1-222	ENST00000583983	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.61	□□□□□ -1.51
GPS1-222	ENST00000583983	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.55	□□□□□ -1.52
GPS1-222	ENST00000583983	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GPS1-222	ENST00000583983	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPS1-222	ENST00000583983	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GPS1-222	ENST00000583983	LCE1C	Q5T751	118 aa		5.15	□□□□□ -1.59
GPS1-222	ENST00000583983	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.92	□□□□□ -1.62
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPS1-222	ENST00000583983	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.45	□□□□□ -1.7
GPS1-222	ENST00000583983	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.41	□□□□□ -1.7
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.37	□□□□□ -1.71
GPS1-222	ENST00000583983	PHGR1	C9JFL3	82 aa		4	□□□□□ -1.77
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.96	□□□□□ -1.78
GPS1-222	ENST00000583983	PRM1	P04553	51 aa		3.83	□□□□□ -1.8
GPS1-222	ENST00000583983	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.64	□□□□□ -1.83
GPS1-222	ENST00000583983	INE1	O15225	51 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GPS1-222	ENST00000583983		A0A0A0MQY5	61 aa		3.54	□□□□□ -1.84
GPS1-222	ENST00000583983	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.92	□□□□□ -1.94
GPS1-222	ENST00000583983	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.62	□□□□□ -1.99
GPS1-222	ENST00000583983		H3BS24	57 aa		2.18	□□□□□ -2.06

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