RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579837.1

NAT9-208, Transcript of N-acetyltransferase 9 (putative), human

TSL 3

Gene NAT9, Length 418 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAT9-208	ENST00000579837	MT1M	Q8N339	61 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NAT9-208	ENST00000579837	MT1L	Q93083	61 aa		5.13	□□□□□ -1.59
NAT9-208	ENST00000579837	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.04	□□□□□ -1.6
NAT9-208	ENST00000579837		K7ERS5	55 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.01	□□□□□ -1.61
NAT9-208	ENST00000579837	MT4	P47944	62 aa		5	□□□□□ -1.61
NAT9-208	ENST00000579837	LCE1D	Q5T752	114 aa		5	□□□□□ -1.61
NAT9-208	ENST00000579837	PSPHP1	O15172	72 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NAT9-208	ENST00000579837	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NAT9-208	ENST00000579837		V9GYY9	64 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NAT9-208	ENST00000579837	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.93	□□□□□ -1.62
NAT9-208	ENST00000579837	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NAT9-208	ENST00000579837		Q1T7F1	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NAT9-208	ENST00000579837		A6NED7	52 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.82	□□□□□ -1.64
NAT9-208	ENST00000579837	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.71	□□□□□ -1.66
NAT9-208	ENST00000579837	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NAT9-208	ENST00000579837	PCP4	P48539	62 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NAT9-208	ENST00000579837	ROMO1	P60602	79 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NAT9-208	ENST00000579837	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NAT9-208	ENST00000579837	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
NAT9-208	ENST00000579837	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NAT9-208	ENST00000579837	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.44	□□□□□ -1.7
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.41	□□□□□ -1.7
NAT9-208	ENST00000579837	MT1A	P04731	61 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.29	□□□□□ -1.72
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.26	□□□□□ -1.73
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NAT9-208	ENST00000579837	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NAT9-208	ENST00000579837	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NAT9-208	ENST00000579837	MT3	P25713	68 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NAT9-208	ENST00000579837	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.86	□□□□□ -1.79
NAT9-208	ENST00000579837	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.85	□□□□□ -1.79
NAT9-208	ENST00000579837	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
NAT9-208	ENST00000579837	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.84	□□□□□ -1.8
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.8	□□□□□ -1.8
NAT9-208	ENST00000579837	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NAT9-208	ENST00000579837	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.63	□□□□□ -1.83
NAT9-208	ENST00000579837	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NAT9-208	ENST00000579837	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
NAT9-208	ENST00000579837	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NAT9-208	ENST00000579837	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.38	□□□□□ -1.87
NAT9-208	ENST00000579837	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NAT9-208	ENST00000579837	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.34	□□□□□ -1.87
NAT9-208	ENST00000579837	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.2	□□□□□ -1.9
NAT9-208	ENST00000579837	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.13	□□□□□ -1.91
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.05	□□□□□ -1.92
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
NAT9-208	ENST00000579837	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.97	□□□□□ -1.93
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.84	□□□□□ -1.95
NAT9-208	ENST00000579837	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.74	□□□□□ -1.97
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.69	□□□□□ -1.98
NAT9-208	ENST00000579837	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.58	□□□□□ -2
NAT9-208	ENST00000579837	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.5	□□□□□ -2.01
NAT9-208	ENST00000579837	PRM1	P04553	51 aa		2.38	□□□□□ -2.03
NAT9-208	ENST00000579837		A0A0A0MQY5	61 aa		2.15	□□□□□ -2.07
NAT9-208	ENST00000579837	INE1	O15225	51 aa		2.09	□□□□□ -2.07
NAT9-208	ENST00000579837	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.05	□□□□□ -2.08
NAT9-208	ENST00000579837		H3BS24	57 aa		1.77	□□□□□ -2.13
NAT9-208	ENST00000579837	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.74	□□□□□ -2.13

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms