RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572680.1

NEURL4-208, Transcript of neuralized E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene NEURL4, Length 819 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEURL4-208	ENST00000572680	MT1G	P13640	62 aa		5.48	□□□□□ -1.53
NEURL4-208	ENST00000572680	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
NEURL4-208	ENST00000572680		A6NED7	52 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NEURL4-208	ENST00000572680	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.45	□□□□□ -1.54
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NEURL4-208	ENST00000572680	MT1L	Q93083	61 aa		5.42	□□□□□ -1.54
NEURL4-208	ENST00000572680	MT1M	Q8N339	61 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.35	□□□□□ -1.55
NEURL4-208	ENST00000572680	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.56
NEURL4-208	ENST00000572680	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NEURL4-208	ENST00000572680	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NEURL4-208	ENST00000572680	ROMO1	P60602	79 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.17	□□□□□ -1.58
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.15	□□□□□ -1.59
NEURL4-208	ENST00000572680	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.11	□□□□□ -1.59
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.1	□□□□□ -1.59
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NEURL4-208	ENST00000572680	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
NEURL4-208	ENST00000572680	MT4	P47944	62 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.02	□□□□□ -1.61
NEURL4-208	ENST00000572680	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NEURL4-208	ENST00000572680	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NEURL4-208	ENST00000572680	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NEURL4-208	ENST00000572680	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.83	□□□□□ -1.64
NEURL4-208	ENST00000572680	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.79	□□□□□ -1.64
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.77	□□□□□ -1.65
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.75	□□□□□ -1.65
NEURL4-208	ENST00000572680	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.74	□□□□□ -1.65
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.73	□□□□□ -1.65
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEURL4-208	ENST00000572680	MT1A	P04731	61 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NEURL4-208	ENST00000572680	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NEURL4-208	ENST00000572680	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.46	□□□□□ -1.7
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.43	□□□□□ -1.7
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NEURL4-208	ENST00000572680	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.32	□□□□□ -1.72
NEURL4-208	ENST00000572680	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.31	□□□□□ -1.72
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.28	□□□□□ -1.72
NEURL4-208	ENST00000572680	MT3	P25713	68 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NEURL4-208	ENST00000572680	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NEURL4-208	ENST00000572680	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NEURL4-208	ENST00000572680	MUC5AC	P98088	5654 aa		4	□□□□□ -1.77
NEURL4-208	ENST00000572680	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
NEURL4-208	ENST00000572680	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.94	□□□□□ -1.78
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.93	□□□□□ -1.78
NEURL4-208	ENST00000572680	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.93	□□□□□ -1.78
NEURL4-208	ENST00000572680	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.85	□□□□□ -1.79
NEURL4-208	ENST00000572680	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.69	□□□□□ -1.82
NEURL4-208	ENST00000572680	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.61	□□□□□ -1.83
NEURL4-208	ENST00000572680	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.6	□□□□□ -1.83
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEURL4-208	ENST00000572680	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEURL4-208	ENST00000572680	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.42	□□□□□ -1.86
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.26	□□□□□ -1.89
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.21	□□□□□ -1.9
NEURL4-208	ENST00000572680	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEURL4-208	ENST00000572680	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.03	□□□□□ -1.92
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3	□□□□□ -1.93
NEURL4-208	ENST00000572680	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.79	□□□□□ -1.96
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.73	□□□□□ -1.97
NEURL4-208	ENST00000572680	PRM1	P04553	51 aa		2.64	□□□□□ -1.99
NEURL4-208	ENST00000572680		A0A0A0MQY5	61 aa		2.48	□□□□□ -2.01
NEURL4-208	ENST00000572680	INE1	O15225	51 aa		2.48	□□□□□ -2.01
NEURL4-208	ENST00000572680	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.47	□□□□□ -2.01
NEURL4-208	ENST00000572680	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.12	□□□□□ -2.07
NEURL4-208	ENST00000572680		H3BS24	57 aa		2.03	□□□□□ -2.08
NEURL4-208	ENST00000572680	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.83	□□□□□ -2.12

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