RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567271.1

NME3-210, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-210ENST00000567271 K7ERS5 55 aa7.86□□□□□ -1.15
NME3-210ENST00000567271 A6NED7 52 aa7.8□□□□□ -1.16
NME3-210ENST00000567271 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
NME3-210ENST00000567271 MT1GP13640 62 aa7.76□□□□□ -1.17
NME3-210ENST00000567271 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.72□□□□□ -1.17
NME3-210ENST00000567271 MT1LQ93083 61 aa7.72□□□□□ -1.17
NME3-210ENST00000567271 PP632Q6XCG6 107 aa7.68□□□□□ -1.18
NME3-210ENST00000567271 MT1MQ8N339 61 aa7.63□□□□□ -1.19
NME3-210ENST00000567271 KRTAP12-3P60328 96 aa7.62□□□□□ -1.19
NME3-210ENST00000567271 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.49□□□□□ -1.21
NME3-210ENST00000567271 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.46□□□□□ -1.22
NME3-210ENST00000567271 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.45□□□□□ -1.22
NME3-210ENST00000567271 ROMO1P60602 79 aa7.4□□□□□ -1.22
NME3-210ENST00000567271 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.36□□□□□ -1.23
NME3-210ENST00000567271 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.27□□□□□ -1.25
NME3-210ENST00000567271 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.22□□□□□ -1.25
NME3-210ENST00000567271 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.21□□□□□ -1.26
NME3-210ENST00000567271 LCE4AQ5TA78 99 aa7.21□□□□□ -1.26
NME3-210ENST00000567271 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.15□□□□□ -1.27
NME3-210ENST00000567271 LCE1DQ5T752 114 aa7.13□□□□□ -1.27
NME3-210ENST00000567271 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.13□□□□□ -1.27
NME3-210ENST00000567271 MT4P47944 62 aa7.08□□□□□ -1.28
NME3-210ENST00000567271 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.06□□□□□ -1.28
NME3-210ENST00000567271 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.05□□□□□ -1.28
NME3-210ENST00000567271 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
NME3-210ENST00000567271 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.96□□□□□ -1.3
NME3-210ENST00000567271 BRK1Q8WUW1 75 aa6.95□□□□□ -1.3
NME3-210ENST00000567271 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.93□□□□□ -1.3
NME3-210ENST00000567271 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.83□□□□□ -1.32
NME3-210ENST00000567271 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
NME3-210ENST00000567271 KRTAP12-4P60329 112 aa6.72□□□□□ -1.33
NME3-210ENST00000567271 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.71□□□□□ -1.34
NME3-210ENST00000567271 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.7□□□□□ -1.34
NME3-210ENST00000567271 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.65□□□□□ -1.34
NME3-210ENST00000567271 MT1AP04731 61 aa6.57□□□□□ -1.36
NME3-210ENST00000567271 PMAIP1Q13794 54 aa6.55□□□□□ -1.36
NME3-210ENST00000567271 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.52□□□□□ -1.37
NME3-210ENST00000567271 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.51□□□□□ -1.37
NME3-210ENST00000567271 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.49□□□□□ -1.37
NME3-210ENST00000567271 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.34□□□□□ -1.39
NME3-210ENST00000567271 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.3□□□□□ -1.4
NME3-210ENST00000567271 PRAC1Q96KF2 57 aa6.26□□□□□ -1.41
NME3-210ENST00000567271 PRO0628Q9UI54 55 aa6.26□□□□□ -1.41
NME3-210ENST00000567271 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.21□□□□□ -1.42
NME3-210ENST00000567271 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.18□□□□□ -1.42
NME3-210ENST00000567271 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.06□□□□□ -1.44
NME3-210ENST00000567271 MT3P25713 68 aa6.01□□□□□ -1.45
NME3-210ENST00000567271 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.93□□□□□ -1.46
NME3-210ENST00000567271 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.92□□□□□ -1.46
NME3-210ENST00000567271 KRTAP5-8O75690 187 aa5.85□□□□□ -1.47
NME3-210ENST00000567271 MUC5ACP98088 5654 aa5.65□□□□□ -1.5
NME3-210ENST00000567271 SVIPQ8NHG7 77 aa5.64□□□□□ -1.51
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NME3-210ENST00000567271 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
NME3-210ENST00000567271 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.59□□□□□ -1.51
NME3-210ENST00000567271 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.49□□□□□ -1.53
NME3-210ENST00000567271 LCE1EQ5T753 118 aa5.46□□□□□ -1.54
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NME3-210ENST00000567271 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.13□□□□□ -1.59
NME3-210ENST00000567271 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.13□□□□□ -1.59
NME3-210ENST00000567271 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.1□□□□□ -1.59
NME3-210ENST00000567271 LCE1CQ5T751 118 aa5.07□□□□□ -1.6
NME3-210ENST00000567271 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.87□□□□□ -1.63
NME3-210ENST00000567271 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
NME3-210ENST00000567271 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.55□□□□□ -1.68
NME3-210ENST00000567271 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.55□□□□□ -1.68
NME3-210ENST00000567271 NDUFAF8A1L188 74 aa4.41□□□□□ -1.7
NME3-210ENST00000567271 LCE1FQ5T754 118 aa4.38□□□□□ -1.71
NME3-210ENST00000567271 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.3□□□□□ -1.72
NME3-210ENST00000567271 PHGR1C9JFL3 82 aa3.93□□□□□ -1.78
NME3-210ENST00000567271 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.89□□□□□ -1.79
NME3-210ENST00000567271 A0A0A0MQY5 61 aa3.79□□□□□ -1.8
NME3-210ENST00000567271 PRM1P04553 51 aa3.79□□□□□ -1.8
NME3-210ENST00000567271 H3BS24 57 aa3.77□□□□□ -1.81
NME3-210ENST00000567271 INE1O15225 51 aa3.69□□□□□ -1.82
NME3-210ENST00000567271 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.62□□□□□ -1.83
NME3-210ENST00000567271 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.85□□□□□ -1.95
NME3-210ENST00000567271 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.53□□□□□ -2
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