RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567123.1

CSK-208, Transcript of C-terminal Src kinase, human

TSL 4

Gene CSK, Length 556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CSK-208	ENST00000567123	COA5	Q86WW8	74 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
CSK-208	ENST00000567123	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CSK-208	ENST00000567123	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CSK-208	ENST00000567123	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CSK-208	ENST00000567123	TNP1	P09430	55 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CSK-208	ENST00000567123	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSK-208	ENST00000567123	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSK-208	ENST00000567123		A8MU10	97 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSK-208	ENST00000567123	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSK-208	ENST00000567123	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CSK-208	ENST00000567123	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CSK-208	ENST00000567123	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSK-208	ENST00000567123	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSK-208	ENST00000567123		A0A1B0GU69	56 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSK-208	ENST00000567123	COX7C	P15954	63 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CSK-208	ENST00000567123	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CSK-208	ENST00000567123		H7BZZ5	65 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CSK-208	ENST00000567123	TMEM258	P61165	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CSK-208	ENST00000567123	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CSK-208	ENST00000567123	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSK-208	ENST00000567123	MT1A	P04731	61 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSK-208	ENST00000567123	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CSK-208	ENST00000567123	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CSK-208	ENST00000567123	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSK-208	ENST00000567123	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSK-208	ENST00000567123	UQCR11	O14957	56 aa		4.42	□□□□□ -1.7
CSK-208	ENST00000567123		V9GYY9	64 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.37	□□□□□ -1.71
CSK-208	ENST00000567123		Q1T7F1	81 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CSK-208	ENST00000567123	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.34	□□□□□ -1.71
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.32	□□□□□ -1.72
CSK-208	ENST00000567123	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.3	□□□□□ -1.72
CSK-208	ENST00000567123		K7ERS5	55 aa		4.23	□□□□□ -1.73
CSK-208	ENST00000567123	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CSK-208	ENST00000567123	PSPHP1	O15172	72 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CSK-208	ENST00000567123	MT3	P25713	68 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CSK-208	ENST00000567123		A6NED7	52 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSK-208	ENST00000567123	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CSK-208	ENST00000567123	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CSK-208	ENST00000567123	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSK-208	ENST00000567123	ROMO1	P60602	79 aa		3.92	□□□□□ -1.78
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CSK-208	ENST00000567123	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CSK-208	ENST00000567123	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.74	□□□□□ -1.81
CSK-208	ENST00000567123	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CSK-208	ENST00000567123		H3BS24	57 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CSK-208	ENST00000567123	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.38	□□□□□ -1.87
CSK-208	ENST00000567123	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.36	□□□□□ -1.87
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.27	□□□□□ -1.89
CSK-208	ENST00000567123	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.23	□□□□□ -1.89
CSK-208	ENST00000567123	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CSK-208	ENST00000567123	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSK-208	ENST00000567123		A0A0A0MQY5	61 aa		3.07	□□□□□ -1.92
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSK-208	ENST00000567123	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.92	□□□□□ -1.94
CSK-208	ENST00000567123	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.88	□□□□□ -1.95
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.87	□□□□□ -1.95
CSK-208	ENST00000567123	INE1	O15225	51 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CSK-208	ENST00000567123	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.54	□□□□□ -2
CSK-208	ENST00000567123	PRM1	P04553	51 aa		1.99	□□□□□ -2.09
CSK-208	ENST00000567123	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.99	□□□□□ -2.09

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