RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC33-211ENST00000563951 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC33-211ENST00000563951 LCE1FQ5T754 118 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC33-211ENST00000563951 A8MU10 97 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC33-211ENST00000563951 PRR15LQ9BU68 103 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC33-211ENST00000563951 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CCDC33-211ENST00000563951 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC33-211ENST00000563951 Q1T7F1 81 aa3.25□□□□□ -1.89
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.23□□□□□ -1.89
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.22□□□□□ -1.89
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.22□□□□□ -1.89
CCDC33-211ENST00000563951 K7ERS5 55 aa3.21□□□□□ -1.9
CCDC33-211ENST00000563951 SPRR2DP22532 72 aa3.21□□□□□ -1.9
CCDC33-211ENST00000563951 UQCR11O14957 56 aa3.19□□□□□ -1.9
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CCDC33-211ENST00000563951 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.19□□□□□ -1.9
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CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.15□□□□□ -1.91
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.13□□□□□ -1.91
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CCDC33-211ENST00000563951 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.12□□□□□ -1.91
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CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC33-211ENST00000563951 TNP1P09430 55 aa3.08□□□□□ -1.92
CCDC33-211ENST00000563951 MT1LQ93083 61 aa3.06□□□□□ -1.92
CCDC33-211ENST00000563951 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
CCDC33-211ENST00000563951 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.04□□□□□ -1.92
CCDC33-211ENST00000563951 MT1GP13640 62 aa3.03□□□□□ -1.92
CCDC33-211ENST00000563951 MT1MQ8N339 61 aa3.03□□□□□ -1.92
CCDC33-211ENST00000563951 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.02□□□□□ -1.93
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.98□□□□□ -1.93
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP12-3P60328 96 aa2.97□□□□□ -1.93
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC33-211ENST00000563951 PP632Q6XCG6 107 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC33-211ENST00000563951 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.88□□□□□ -1.95
CCDC33-211ENST00000563951 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.88□□□□□ -1.95
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CCDC33-211ENST00000563951 ROMO1P60602 79 aa2.86□□□□□ -1.95
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.85□□□□□ -1.95
CCDC33-211ENST00000563951 MT4P47944 62 aa2.81□□□□□ -1.96
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.81□□□□□ -1.96
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
CCDC33-211ENST00000563951 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.8□□□□□ -1.96
CCDC33-211ENST00000563951 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
CCDC33-211ENST00000563951 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.78□□□□□ -1.96
CCDC33-211ENST00000563951 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.77□□□□□ -1.97
CCDC33-211ENST00000563951 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.69□□□□□ -1.98
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.67□□□□□ -1.98
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.66□□□□□ -1.98
CCDC33-211ENST00000563951 LCE1EQ5T753 118 aa2.63□□□□□ -1.99
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.62□□□□□ -1.99
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CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP12-4P60329 112 aa2.6□□□□□ -1.99
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.59□□□□□ -1.99
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.53□□□□□ -2
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.49□□□□□ -2.01
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.44□□□□□ -2.02
CCDC33-211ENST00000563951 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.43□□□□□ -2.02
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP5-8O75690 187 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC33-211ENST00000563951 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.35□□□□□ -2.03
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.34□□□□□ -2.03
CCDC33-211ENST00000563951 MUC5ACP98088 5654 aa2.28□□□□□ -2.04
CCDC33-211ENST00000563951 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
CCDC33-211ENST00000563951 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.25□□□□□ -2.05
CCDC33-211ENST00000563951 INE1O15225 51 aa2.16□□□□□ -2.06
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.01□□□□□ -2.09
CCDC33-211ENST00000563951 LCE1BQ5T7P3 118 aa2□□□□□ -2.09
CCDC33-211ENST00000563951 LCE1CQ5T751 118 aa1.98□□□□□ -2.09
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.71□□□□□ -2.14
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.67□□□□□ -2.14
CCDC33-211ENST00000563951 PHGR1C9JFL3 82 aa1.56□□□□□ -2.16
CCDC33-211ENST00000563951 PRM1P04553 51 aa1.47□□□□□ -2.17
CCDC33-211ENST00000563951 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.46□□□□□ -2.18
CCDC33-211ENST00000563951 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.12□□□□□ -2.23
CCDC33-211ENST00000563951 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.08□□□□□ -2.24
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