RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561256.5

USP3-AS1-210, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.22□□□□□ -1.41
USP3-AS1-210ENST00000561256 V9GYY9 64 aa6.22□□□□□ -1.41
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.2□□□□□ -1.42
USP3-AS1-210ENST00000561256 MT1MQ8N339 61 aa6.18□□□□□ -1.42
USP3-AS1-210ENST00000561256 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.18□□□□□ -1.42
USP3-AS1-210ENST00000561256 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.18□□□□□ -1.42
USP3-AS1-210ENST00000561256 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.17□□□□□ -1.42
USP3-AS1-210ENST00000561256 K7ERS5 55 aa6.13□□□□□ -1.43
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.12□□□□□ -1.43
USP3-AS1-210ENST00000561256 Q1T7F1 81 aa6.1□□□□□ -1.43
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.1□□□□□ -1.43
USP3-AS1-210ENST00000561256 PSPHP1O15172 72 aa6.09□□□□□ -1.43
USP3-AS1-210ENST00000561256 MT1LQ93083 61 aa6.09□□□□□ -1.43
USP3-AS1-210ENST00000561256 LCE3AQ5TA76 89 aa6.07□□□□□ -1.44
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.05□□□□□ -1.44
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.02□□□□□ -1.45
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.97□□□□□ -1.45
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.95□□□□□ -1.46
USP3-AS1-210ENST00000561256 A6NED7 52 aa5.94□□□□□ -1.46
USP3-AS1-210ENST00000561256 PCP4P48539 62 aa5.91□□□□□ -1.46
USP3-AS1-210ENST00000561256 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP12-3P60328 96 aa5.88□□□□□ -1.47
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.83□□□□□ -1.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.8□□□□□ -1.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.79□□□□□ -1.48
USP3-AS1-210ENST00000561256 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.76□□□□□ -1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.73□□□□□ -1.49
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP12-4P60329 112 aa5.68□□□□□ -1.5
USP3-AS1-210ENST00000561256 ROMO1P60602 79 aa5.64□□□□□ -1.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.64□□□□□ -1.51
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.55□□□□□ -1.52
USP3-AS1-210ENST00000561256 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.5□□□□□ -1.53
USP3-AS1-210ENST00000561256 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.43□□□□□ -1.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.42□□□□□ -1.54
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.29□□□□□ -1.56
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP5-8O75690 187 aa5.25□□□□□ -1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 BRK1Q8WUW1 75 aa5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-210ENST00000561256 MUC5ACP98088 5654 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 MT1AP04731 61 aa5.18□□□□□ -1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.18□□□□□ -1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
USP3-AS1-210ENST00000561256 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.07□□□□□ -1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.05□□□□□ -1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.05□□□□□ -1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.04□□□□□ -1.6
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.01□□□□□ -1.61
USP3-AS1-210ENST00000561256 PMAIP1Q13794 54 aa4.93□□□□□ -1.62
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.82□□□□□ -1.64
USP3-AS1-210ENST00000561256 MT3P25713 68 aa4.77□□□□□ -1.65
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRAC1Q96KF2 57 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRO0628Q9UI54 55 aa4.63□□□□□ -1.67
USP3-AS1-210ENST00000561256 LCE1EQ5T753 118 aa4.46□□□□□ -1.7
USP3-AS1-210ENST00000561256 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.39□□□□□ -1.71
USP3-AS1-210ENST00000561256 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.28□□□□□ -1.72
USP3-AS1-210ENST00000561256 SVIPQ8NHG7 77 aa4.27□□□□□ -1.73
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.26□□□□□ -1.73
USP3-AS1-210ENST00000561256 LCE1CQ5T751 118 aa4.14□□□□□ -1.75
USP3-AS1-210ENST00000561256 LUZP6Q538Z0 58 aa4.06□□□□□ -1.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.04□□□□□ -1.76
USP3-AS1-210ENST00000561256 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.97□□□□□ -1.77
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.81□□□□□ -1.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 LCE1FQ5T754 118 aa3.79□□□□□ -1.8
USP3-AS1-210ENST00000561256 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.75□□□□□ -1.81
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 PHGR1C9JFL3 82 aa3.66□□□□□ -1.82
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.41□□□□□ -1.86
USP3-AS1-210ENST00000561256 NDUFAF8A1L188 74 aa3.25□□□□□ -1.89
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.21□□□□□ -1.9
USP3-AS1-210ENST00000561256 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.13□□□□□ -1.91
USP3-AS1-210ENST00000561256 PRM1P04553 51 aa2.86□□□□□ -1.95
USP3-AS1-210ENST00000561256 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.77□□□□□ -1.97
USP3-AS1-210ENST00000561256 A0A0A0MQY5 61 aa2.69□□□□□ -1.98
USP3-AS1-210ENST00000561256 INE1O15225 51 aa2.68□□□□□ -1.98
USP3-AS1-210ENST00000561256 H3BS24 57 aa2.34□□□□□ -2.03
USP3-AS1-210ENST00000561256 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.2□□□□□ -2.06
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