RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 MUC5ACP98088 5654 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-230ENST00000551968 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-230ENST00000551968 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CS-230ENST00000551968 COA5Q86WW8 74 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-230ENST00000551968 A0A0D9SG42 100 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-230ENST00000551968 Q1T7F1 81 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-230ENST00000551968 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-230ENST00000551968 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CS-230ENST00000551968 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-230ENST00000551968 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CS-230ENST00000551968 PRR15LQ9BU68 103 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-230ENST00000551968 SEC61GP60059 68 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-230ENST00000551968 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-230ENST00000551968 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-230ENST00000551968 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-230ENST00000551968 KRTAP12-4P60329 112 aa4.53□□□□□ -1.68
CS-230ENST00000551968 A0A1B0GU69 56 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-230ENST00000551968 KRTAP5-8O75690 187 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-230ENST00000551968 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.46□□□□□ -1.7
CS-230ENST00000551968 PSPHP1O15172 72 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-230ENST00000551968 UQCR11O14957 56 aa4.42□□□□□ -1.7
CS-230ENST00000551968 LCE3AQ5TA76 89 aa4.4□□□□□ -1.71
CS-230ENST00000551968 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.39□□□□□ -1.71
CS-230ENST00000551968 A6NED7 52 aa4.39□□□□□ -1.71
CS-230ENST00000551968 A0A1B0GU33 70 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-230ENST00000551968 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-230ENST00000551968 BRK1Q8WUW1 75 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-230ENST00000551968 PRO0628Q9UI54 55 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-230ENST00000551968 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.34□□□□□ -1.71
CS-230ENST00000551968 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.34□□□□□ -1.71
CS-230ENST00000551968 KRTAP12-1P59990 96 aa4.31□□□□□ -1.72
CS-230ENST00000551968 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.31□□□□□ -1.72
CS-230ENST00000551968 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.29□□□□□ -1.72
CS-230ENST00000551968 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.28□□□□□ -1.72
CS-230ENST00000551968 K7ERS5 55 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-230ENST00000551968 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-230ENST00000551968 SVIPQ8NHG7 77 aa4.22□□□□□ -1.73
CS-230ENST00000551968 A8MU10 97 aa4.17□□□□□ -1.74
CS-230ENST00000551968 KRTAP12-3P60328 96 aa4.17□□□□□ -1.74
CS-230ENST00000551968 PMAIP1Q13794 54 aa4.17□□□□□ -1.74
CS-230ENST00000551968 TNP1P09430 55 aa4.11□□□□□ -1.75
CS-230ENST00000551968 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.11□□□□□ -1.75
CS-230ENST00000551968 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-230ENST00000551968 MT1AP04731 61 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-230ENST00000551968 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-230ENST00000551968 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4□□□□□ -1.77
CS-230ENST00000551968 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.97□□□□□ -1.77
CS-230ENST00000551968 ROMO1P60602 79 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-230ENST00000551968 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.89□□□□□ -1.79
CS-230ENST00000551968 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-230ENST00000551968 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.8□□□□□ -1.8
CS-230ENST00000551968 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.78□□□□□ -1.8
CS-230ENST00000551968 PRAC1Q96KF2 57 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-230ENST00000551968 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.7□□□□□ -1.82
CS-230ENST00000551968 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-230ENST00000551968 MT3P25713 68 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-230ENST00000551968 H3BS24 57 aa3.62□□□□□ -1.83
CS-230ENST00000551968 LCE1EQ5T753 118 aa3.53□□□□□ -1.84
CS-230ENST00000551968 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.49□□□□□ -1.85
CS-230ENST00000551968 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-230ENST00000551968 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.44□□□□□ -1.86
CS-230ENST00000551968 LUZP6Q538Z0 58 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-230ENST00000551968 LCE1CQ5T751 118 aa3.29□□□□□ -1.88
CS-230ENST00000551968 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.21□□□□□ -1.9
CS-230ENST00000551968 A0A0A0MQY5 61 aa3.19□□□□□ -1.9
CS-230ENST00000551968 PHGR1C9JFL3 82 aa3.18□□□□□ -1.9
CS-230ENST00000551968 LCE1FQ5T754 118 aa3.07□□□□□ -1.92
CS-230ENST00000551968 NDUFAF8A1L188 74 aa3.05□□□□□ -1.92
CS-230ENST00000551968 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
CS-230ENST00000551968 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.71□□□□□ -1.98
CS-230ENST00000551968 INE1O15225 51 aa2.7□□□□□ -1.98
CS-230ENST00000551968 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.69□□□□□ -1.98
CS-230ENST00000551968 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.64□□□□□ -1.99
CS-230ENST00000551968 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-230ENST00000551968 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.46□□□□□ -2.02
CS-230ENST00000551968 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.38□□□□□ -2.03
CS-230ENST00000551968 PRM1P04553 51 aa1.99□□□□□ -2.09
CS-230ENST00000551968 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.86□□□□□ -2.11
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