RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LETMD1-231	ENST00000551931	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP12-1	P59990	96 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LETMD1-231	ENST00000551931	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.32	□□□□□ -1.72
LETMD1-231	ENST00000551931		K7ERU9	68 aa		4.31	□□□□□ -1.72
LETMD1-231	ENST00000551931	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.31	□□□□□ -1.72
LETMD1-231	ENST00000551931	COA5	Q86WW8	74 aa		4.31	□□□□□ -1.72
LETMD1-231	ENST00000551931	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.3	□□□□□ -1.72
LETMD1-231	ENST00000551931	SEC61G	P60059	68 aa		4.29	□□□□□ -1.72
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1B0GU33	70 aa		4.28	□□□□□ -1.72
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A0A0MQY5	61 aa		4.21	□□□□□ -1.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.2	□□□□□ -1.74
LETMD1-231	ENST00000551931	TNP1	P09430	55 aa		4.19	□□□□□ -1.74
LETMD1-231	ENST00000551931		A8MU10	97 aa		4.18	□□□□□ -1.74
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
LETMD1-231	ENST00000551931	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.15	□□□□□ -1.75
LETMD1-231	ENST00000551931	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.14	□□□□□ -1.75
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.12	□□□□□ -1.75
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A1B0GU69	56 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.08	□□□□□ -1.76
LETMD1-231	ENST00000551931	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
LETMD1-231	ENST00000551931		H7BZZ5	65 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LETMD1-231	ENST00000551931	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.02	□□□□□ -1.77
LETMD1-231	ENST00000551931	COX7C	P15954	63 aa		3.99	□□□□□ -1.77
LETMD1-231	ENST00000551931	MT3	P25713	68 aa		3.91	□□□□□ -1.78
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC179	H3BU77	68 aa		3.87	□□□□□ -1.79
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.86	□□□□□ -1.79
LETMD1-231	ENST00000551931	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
LETMD1-231	ENST00000551931	PRR15L	Q9BU68	103 aa		3.84	□□□□□ -1.79
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.81	□□□□□ -1.8
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.8	□□□□□ -1.8
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM258	P61165	79 aa		3.79	□□□□□ -1.8
LETMD1-231	ENST00000551931	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.79	□□□□□ -1.8
LETMD1-231	ENST00000551931	MT1A	P04731	61 aa		3.78	□□□□□ -1.8
LETMD1-231	ENST00000551931	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
LETMD1-231	ENST00000551931	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		3.77	□□□□□ -1.81
LETMD1-231	ENST00000551931	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
LETMD1-231	ENST00000551931	UQCR11	O14957	56 aa		3.72	□□□□□ -1.81
LETMD1-231	ENST00000551931	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.69	□□□□□ -1.82
LETMD1-231	ENST00000551931	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.68	□□□□□ -1.82
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.67	□□□□□ -1.82
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
LETMD1-231	ENST00000551931	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		3.62	□□□□□ -1.83
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.61	□□□□□ -1.83
LETMD1-231	ENST00000551931		V9GYY9	64 aa		3.59	□□□□□ -1.83
LETMD1-231	ENST00000551931		K7ERS5	55 aa		3.57	□□□□□ -1.84
LETMD1-231	ENST00000551931	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.55	□□□□□ -1.84
LETMD1-231	ENST00000551931	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.53	□□□□□ -1.84
LETMD1-231	ENST00000551931	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.51	□□□□□ -1.85
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.51	□□□□□ -1.85
LETMD1-231	ENST00000551931	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.51	□□□□□ -1.85
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.48	□□□□□ -1.85
LETMD1-231	ENST00000551931	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.47	□□□□□ -1.85
LETMD1-231	ENST00000551931		Q1T7F1	81 aa		3.46	□□□□□ -1.86
LETMD1-231	ENST00000551931	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.43	□□□□□ -1.86
LETMD1-231	ENST00000551931	PSPHP1	O15172	72 aa		3.41	□□□□□ -1.86
LETMD1-231	ENST00000551931	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		3.37	□□□□□ -1.87
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
LETMD1-231	ENST00000551931	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.35	□□□□□ -1.87
LETMD1-231	ENST00000551931	ROMO1	P60602	79 aa		3.31	□□□□□ -1.88
LETMD1-231	ENST00000551931		A6NED7	52 aa		3.27	□□□□□ -1.89
LETMD1-231	ENST00000551931	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LETMD1-231	ENST00000551931	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.01	□□□□□ -1.93
LETMD1-231	ENST00000551931	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.96	□□□□□ -1.94
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.8	□□□□□ -1.96
LETMD1-231	ENST00000551931	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.65	□□□□□ -1.99
LETMD1-231	ENST00000551931	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.61	□□□□□ -1.99
LETMD1-231	ENST00000551931	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.58	□□□□□ -2
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.5	□□□□□ -2.01
LETMD1-231	ENST00000551931	INE1	O15225	51 aa		2.29	□□□□□ -2.04
LETMD1-231	ENST00000551931	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.28	□□□□□ -2.04
LETMD1-231	ENST00000551931	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.97	□□□□□ -2.09
LETMD1-231	ENST00000551931	PRM1	P04553	51 aa		1.69	□□□□□ -2.14
LETMD1-231	ENST00000551931	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.6	□□□□□ -2.15

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