RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 TNP1P09430 55 aa3.77□□□□□ -1.81
CS-220ENST00000550700 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-220ENST00000550700 ROMO1P60602 79 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-220ENST00000550700 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-220ENST00000550700 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-220ENST00000550700 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
CS-220ENST00000550700 KRTAP10-12P60413 245 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-220ENST00000550700 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-220ENST00000550700 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.7□□□□□ -1.82
CS-220ENST00000550700 PP632Q6XCG6 107 aa3.62□□□□□ -1.83
CS-220ENST00000550700 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-220ENST00000550700 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
CS-220ENST00000550700 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-220ENST00000550700 LCE3AQ5TA76 89 aa3.53□□□□□ -1.84
CS-220ENST00000550700 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.49□□□□□ -1.85
CS-220ENST00000550700 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
CS-220ENST00000550700 KRTAP12-3P60328 96 aa3.46□□□□□ -1.86
CS-220ENST00000550700 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-220ENST00000550700 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.44□□□□□ -1.86
CS-220ENST00000550700 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.44□□□□□ -1.86
CS-220ENST00000550700 KMT2DO14686 5537 aa3.44□□□□□ -1.86
CS-220ENST00000550700 MT1EP04732 61 aa3.42□□□□□ -1.86
CS-220ENST00000550700 LUZP6Q538Z0 58 aa3.4□□□□□ -1.87
CS-220ENST00000550700 PRAC1Q96KF2 57 aa3.36□□□□□ -1.87
CS-220ENST00000550700 SPRR2EP22531 72 aa3.35□□□□□ -1.87
CS-220ENST00000550700 SPRR2BP35325 72 aa3.35□□□□□ -1.87
CS-220ENST00000550700 SPRR2AP35326 72 aa3.35□□□□□ -1.87
CS-220ENST00000550700 MT1GP13640 62 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-220ENST00000550700 LCE1EQ5T753 118 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-220ENST00000550700 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.34□□□□□ -1.87
CS-220ENST00000550700 MT1LQ93083 61 aa3.32□□□□□ -1.88
CS-220ENST00000550700 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.32□□□□□ -1.88
CS-220ENST00000550700 MT3P25713 68 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-220ENST00000550700 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.26□□□□□ -1.89
CS-220ENST00000550700 NEBP20929 6669 aa3.26□□□□□ -1.89
CS-220ENST00000550700 SPRR2DP22532 72 aa3.25□□□□□ -1.89
CS-220ENST00000550700 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.25□□□□□ -1.89
CS-220ENST00000550700 MT1MQ8N339 61 aa3.23□□□□□ -1.89
CS-220ENST00000550700 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.22□□□□□ -1.89
CS-220ENST00000550700 MDN1Q9NU22 5596 aa3.21□□□□□ -1.9
CS-220ENST00000550700 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.17□□□□□ -1.9
CS-220ENST00000550700 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.17□□□□□ -1.9
CS-220ENST00000550700 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.15□□□□□ -1.91
CS-220ENST00000550700 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.13□□□□□ -1.91
CS-220ENST00000550700 NDUFAF8A1L188 74 aa3.12□□□□□ -1.91
CS-220ENST00000550700 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.09□□□□□ -1.91
CS-220ENST00000550700 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.03□□□□□ -1.92
CS-220ENST00000550700 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
CS-220ENST00000550700 LCE1FQ5T754 118 aa2.96□□□□□ -1.94
CS-220ENST00000550700 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.93□□□□□ -1.94
CS-220ENST00000550700 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
CS-220ENST00000550700 MT1AP04731 61 aa2.86□□□□□ -1.95
CS-220ENST00000550700 KRTAP12-4P60329 112 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-220ENST00000550700 KRTAP5-8O75690 187 aa2.83□□□□□ -1.96
CS-220ENST00000550700 INE1O15225 51 aa2.8□□□□□ -1.96
CS-220ENST00000550700 MT4P47944 62 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-220ENST00000550700 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-220ENST00000550700 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.7□□□□□ -1.98
CS-220ENST00000550700 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
CS-220ENST00000550700 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.67□□□□□ -1.98
CS-220ENST00000550700 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.59□□□□□ -1.99
CS-220ENST00000550700 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.54□□□□□ -2
CS-220ENST00000550700 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.53□□□□□ -2
CS-220ENST00000550700 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.43□□□□□ -2.02
CS-220ENST00000550700 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.41□□□□□ -2.02
CS-220ENST00000550700 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.4□□□□□ -2.03
CS-220ENST00000550700 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.3□□□□□ -2.04
CS-220ENST00000550700 LCE1CQ5T751 118 aa2.16□□□□□ -2.06
CS-220ENST00000550700 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.16□□□□□ -2.06
CS-220ENST00000550700 MUC5ACP98088 5654 aa2.13□□□□□ -2.07
CS-220ENST00000550700 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2□□□□□ -2.09
CS-220ENST00000550700 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.98□□□□□ -2.09
CS-220ENST00000550700 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.97□□□□□ -2.09
CS-220ENST00000550700 PRM1P04553 51 aa1.89□□□□□ -2.11
CS-220ENST00000550700 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.83□□□□□ -2.12
CS-220ENST00000550700 PHGR1C9JFL3 82 aa1.64□□□□□ -2.15
CS-220ENST00000550700 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.14□□□□□ -2.23
CS-220ENST00000550700 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.02□□□□□ -2.25
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