RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 UQCR11O14957 56 aa2.26□□□□□ -2.05
CS-213ENST00000548746 MT3P25713 68 aa2.26□□□□□ -2.05
CS-213ENST00000548746 Q1T7F1 81 aa2.25□□□□□ -2.05
CS-213ENST00000548746 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.25□□□□□ -2.05
CS-213ENST00000548746 V9GYY9 64 aa2.25□□□□□ -2.05
CS-213ENST00000548746 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.24□□□□□ -2.05
CS-213ENST00000548746 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.23□□□□□ -2.05
CS-213ENST00000548746 MT1EP04732 61 aa2.21□□□□□ -2.06
CS-213ENST00000548746 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.21□□□□□ -2.06
CS-213ENST00000548746 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
CS-213ENST00000548746 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.21□□□□□ -2.06
CS-213ENST00000548746 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.2□□□□□ -2.06
CS-213ENST00000548746 TNP1P09430 55 aa2.19□□□□□ -2.06
CS-213ENST00000548746 SPRR2DP22532 72 aa2.19□□□□□ -2.06
CS-213ENST00000548746 PSPHP1O15172 72 aa2.18□□□□□ -2.06
CS-213ENST00000548746 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.17□□□□□ -2.06
CS-213ENST00000548746 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.17□□□□□ -2.06
CS-213ENST00000548746 LCE3AQ5TA76 89 aa2.15□□□□□ -2.07
CS-213ENST00000548746 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.15□□□□□ -2.07
CS-213ENST00000548746 K7ERS5 55 aa2.14□□□□□ -2.07
CS-213ENST00000548746 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.13□□□□□ -2.07
CS-213ENST00000548746 A6NED7 52 aa2.12□□□□□ -2.07
CS-213ENST00000548746 MT1GP13640 62 aa2.12□□□□□ -2.07
CS-213ENST00000548746 MT1LQ93083 61 aa2.12□□□□□ -2.07
CS-213ENST00000548746 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.1□□□□□ -2.07
CS-213ENST00000548746 PP632Q6XCG6 107 aa2.09□□□□□ -2.07
CS-213ENST00000548746 MT1MQ8N339 61 aa2.09□□□□□ -2.07
CS-213ENST00000548746 KRTAP12-3P60328 96 aa2.08□□□□□ -2.08
CS-213ENST00000548746 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
CS-213ENST00000548746 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.07□□□□□ -2.08
CS-213ENST00000548746 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.05□□□□□ -2.08
CS-213ENST00000548746 LCE1EQ5T753 118 aa2.04□□□□□ -2.08
CS-213ENST00000548746 NDUFAF8A1L188 74 aa2.03□□□□□ -2.08
CS-213ENST00000548746 ROMO1P60602 79 aa2.02□□□□□ -2.09
CS-213ENST00000548746 PRAC1Q96KF2 57 aa2.02□□□□□ -2.09
CS-213ENST00000548746 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.01□□□□□ -2.09
CS-213ENST00000548746 PRO0628Q9UI54 55 aa2.01□□□□□ -2.09
CS-213ENST00000548746 LCE1FQ5T754 118 aa1.98□□□□□ -2.09
CS-213ENST00000548746 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.98□□□□□ -2.09
CS-213ENST00000548746 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.98□□□□□ -2.09
CS-213ENST00000548746 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
CS-213ENST00000548746 LCE3CQ5T5A8 94 aa1.93□□□□□ -2.1
CS-213ENST00000548746 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
CS-213ENST00000548746 MT4P47944 62 aa1.89□□□□□ -2.11
CS-213ENST00000548746 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.89□□□□□ -2.11
CS-213ENST00000548746 BRK1Q8WUW1 75 aa1.89□□□□□ -2.11
CS-213ENST00000548746 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.88□□□□□ -2.11
CS-213ENST00000548746 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.85□□□□□ -2.11
CS-213ENST00000548746 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.84□□□□□ -2.11
CS-213ENST00000548746 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa1.83□□□□□ -2.12
CS-213ENST00000548746 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.83□□□□□ -2.12
CS-213ENST00000548746 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.82□□□□□ -2.12
CS-213ENST00000548746 KRTAP12-4P60329 112 aa1.82□□□□□ -2.12
CS-213ENST00000548746 PMAIP1Q13794 54 aa1.82□□□□□ -2.12
CS-213ENST00000548746 MT1AP04731 61 aa1.81□□□□□ -2.12
CS-213ENST00000548746 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
CS-213ENST00000548746 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.78□□□□□ -2.12
CS-213ENST00000548746 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.76□□□□□ -2.13
CS-213ENST00000548746 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
CS-213ENST00000548746 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.68□□□□□ -2.14
CS-213ENST00000548746 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.68□□□□□ -2.14
CS-213ENST00000548746 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.67□□□□□ -2.14
CS-213ENST00000548746 KRTAP5-8O75690 187 aa1.6□□□□□ -2.15
CS-213ENST00000548746 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.58□□□□□ -2.16
CS-213ENST00000548746 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
CS-213ENST00000548746 OBSCNQ5VST9 7968 aa1.57□□□□□ -2.16
CS-213ENST00000548746 MUC5ACP98088 5654 aa1.52□□□□□ -2.17
CS-213ENST00000548746 LUZP6Q538Z0 58 aa1.43□□□□□ -2.18
CS-213ENST00000548746 LCE1CQ5T751 118 aa1.41□□□□□ -2.18
CS-213ENST00000548746 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.41□□□□□ -2.18
CS-213ENST00000548746 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.4□□□□□ -2.19
CS-213ENST00000548746 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.19□□□□□ -2.22
CS-213ENST00000548746 INE1O15225 51 aa1.18□□□□□ -2.22
CS-213ENST00000548746 PHGR1C9JFL3 82 aa1.16□□□□□ -2.22
CS-213ENST00000548746 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.04□□□□□ -2.24
CS-213ENST00000548746 PRM1P04553 51 aa1.03□□□□□ -2.24
CS-213ENST00000548746 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.91□□□□□ -2.26
CS-213ENST00000548746 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.65□□□□□ -2.31
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.9 ms