RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 MT1XP80297 61 aa3.11□□□□□ -1.91
CS-212ENST00000548567 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.11□□□□□ -1.91
CS-212ENST00000548567 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.11□□□□□ -1.91
CS-212ENST00000548567 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-212ENST00000548567 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.05□□□□□ -1.92
CS-212ENST00000548567 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.02□□□□□ -1.93
CS-212ENST00000548567 SPRR2DP22532 72 aa2.99□□□□□ -1.93
CS-212ENST00000548567 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.97□□□□□ -1.93
CS-212ENST00000548567 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.97□□□□□ -1.93
CS-212ENST00000548567 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.94□□□□□ -1.94
CS-212ENST00000548567 INE1O15225 51 aa2.92□□□□□ -1.94
CS-212ENST00000548567 KRTAP5-9P26371 169 aa2.89□□□□□ -1.95
CS-212ENST00000548567 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.89□□□□□ -1.95
CS-212ENST00000548567 TNP1P09430 55 aa2.88□□□□□ -1.95
CS-212ENST00000548567 LCE3BQ5TA77 95 aa2.87□□□□□ -1.95
CS-212ENST00000548567 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.87□□□□□ -1.95
CS-212ENST00000548567 KRTAP10-12P60413 245 aa2.87□□□□□ -1.95
CS-212ENST00000548567 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.87□□□□□ -1.95
CS-212ENST00000548567 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.86□□□□□ -1.95
CS-212ENST00000548567 MT4P47944 62 aa2.84□□□□□ -1.95
CS-212ENST00000548567 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.83□□□□□ -1.96
CS-212ENST00000548567 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.8□□□□□ -1.96
CS-212ENST00000548567 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.8□□□□□ -1.96
CS-212ENST00000548567 LCE3AQ5TA76 89 aa2.79□□□□□ -1.96
CS-212ENST00000548567 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.78□□□□□ -1.96
CS-212ENST00000548567 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-212ENST00000548567 MT1EP04732 61 aa2.72□□□□□ -1.97
CS-212ENST00000548567 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.72□□□□□ -1.97
CS-212ENST00000548567 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.7□□□□□ -1.98
CS-212ENST00000548567 MT1GP13640 62 aa2.65□□□□□ -1.99
CS-212ENST00000548567 LCE1DQ5T752 114 aa2.65□□□□□ -1.99
CS-212ENST00000548567 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.65□□□□□ -1.99
CS-212ENST00000548567 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.63□□□□□ -1.99
CS-212ENST00000548567 KRTAP12-3P60328 96 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-212ENST00000548567 MT1MQ8N339 61 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-212ENST00000548567 MT1LQ93083 61 aa2.62□□□□□ -1.99
CS-212ENST00000548567 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.59□□□□□ -2
CS-212ENST00000548567 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.59□□□□□ -2
CS-212ENST00000548567 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.52□□□□□ -2.01
CS-212ENST00000548567 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.52□□□□□ -2.01
CS-212ENST00000548567 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.51□□□□□ -2.01
CS-212ENST00000548567 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.45□□□□□ -2.02
CS-212ENST00000548567 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.4□□□□□ -2.02
CS-212ENST00000548567 KRTAP12-4P60329 112 aa2.37□□□□□ -2.03
CS-212ENST00000548567 LCE4AQ5TA78 99 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-212ENST00000548567 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-212ENST00000548567 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-212ENST00000548567 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-212ENST00000548567 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.32□□□□□ -2.04
CS-212ENST00000548567 MUC5ACP98088 5654 aa2.31□□□□□ -2.04
CS-212ENST00000548567 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CS-212ENST00000548567 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.26□□□□□ -2.05
CS-212ENST00000548567 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.26□□□□□ -2.05
CS-212ENST00000548567 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.26□□□□□ -2.05
CS-212ENST00000548567 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.22□□□□□ -2.05
CS-212ENST00000548567 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
CS-212ENST00000548567 MT1AP04731 61 aa2.14□□□□□ -2.07
CS-212ENST00000548567 KRTAP5-8O75690 187 aa2.13□□□□□ -2.07
CS-212ENST00000548567 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
CS-212ENST00000548567 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.09□□□□□ -2.07
CS-212ENST00000548567 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.06□□□□□ -2.08
CS-212ENST00000548567 MT3P25713 68 aa2.01□□□□□ -2.09
CS-212ENST00000548567 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.94□□□□□ -2.1
CS-212ENST00000548567 PRM1P04553 51 aa1.94□□□□□ -2.1
CS-212ENST00000548567 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.92□□□□□ -2.1
CS-212ENST00000548567 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
CS-212ENST00000548567 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.89□□□□□ -2.11
CS-212ENST00000548567 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.88□□□□□ -2.11
CS-212ENST00000548567 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.72□□□□□ -2.13
CS-212ENST00000548567 LCE1EQ5T753 118 aa1.68□□□□□ -2.14
CS-212ENST00000548567 LCE1CQ5T751 118 aa1.67□□□□□ -2.14
CS-212ENST00000548567 LCE1FQ5T754 118 aa1.67□□□□□ -2.14
CS-212ENST00000548567 PHGR1C9JFL3 82 aa1.51□□□□□ -2.17
CS-212ENST00000548567 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.49□□□□□ -2.17
CS-212ENST00000548567 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.41□□□□□ -2.18
CS-212ENST00000548567 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.28□□□□□ -2.2
CS-212ENST00000548567 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms