RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541434.5

CADM1-211, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CADM1, Length 1,112 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-211ENST00000541434 SPRR2AP35326 72 aa5.7□□□□□ -1.5
CADM1-211ENST00000541434 PRAC1Q96KF2 57 aa5.7□□□□□ -1.5
CADM1-211ENST00000541434 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.69□□□□□ -1.5
CADM1-211ENST00000541434 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.68□□□□□ -1.5
CADM1-211ENST00000541434 NEBP20929 6669 aa5.67□□□□□ -1.5
CADM1-211ENST00000541434 MDN1Q9NU22 5596 aa5.64□□□□□ -1.51
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.64□□□□□ -1.51
CADM1-211ENST00000541434 MT1LQ93083 61 aa5.63□□□□□ -1.51
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.59□□□□□ -1.51
CADM1-211ENST00000541434 MT1GP13640 62 aa5.58□□□□□ -1.52
CADM1-211ENST00000541434 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.57□□□□□ -1.52
CADM1-211ENST00000541434 SPRR2DP22532 72 aa5.5□□□□□ -1.53
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CADM1-211ENST00000541434 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.33□□□□□ -1.56
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CADM1-211ENST00000541434 H3BS24 57 aa5.29□□□□□ -1.56
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CADM1-211ENST00000541434 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.2□□□□□ -1.58
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.16□□□□□ -1.58
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.07□□□□□ -1.6
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.07□□□□□ -1.6
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.06□□□□□ -1.6
CADM1-211ENST00000541434 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.02□□□□□ -1.61
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CADM1-211ENST00000541434 KRTAP12-4P60329 112 aa4.72□□□□□ -1.65
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CADM1-211ENST00000541434 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.52□□□□□ -1.69
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CADM1-211ENST00000541434 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.43□□□□□ -1.7
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CADM1-211ENST00000541434 NDUFAF8A1L188 74 aa4.35□□□□□ -1.71
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CADM1-211ENST00000541434 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.21□□□□□ -1.74
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CADM1-211ENST00000541434 MUC5ACP98088 5654 aa3.68□□□□□ -1.82
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CADM1-211ENST00000541434 LCE1CQ5T751 118 aa3.6□□□□□ -1.83
CADM1-211ENST00000541434 INE1O15225 51 aa3.59□□□□□ -1.83
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CADM1-211ENST00000541434 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
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CADM1-211ENST00000541434 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.18□□□□□ -1.9
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.12□□□□□ -1.91
CADM1-211ENST00000541434 LCE1FQ5T754 118 aa2.98□□□□□ -1.93
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.8□□□□□ -1.96
CADM1-211ENST00000541434 PHGR1C9JFL3 82 aa2.75□□□□□ -1.97
CADM1-211ENST00000541434 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.43□□□□□ -2.02
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.9□□□□□ -2.11
CADM1-211ENST00000541434 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms