RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.04□□□□□ -1.28
CD27-AS1-208ENST00000538616 TNP1P09430 55 aa6.95□□□□□ -1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 LCE3AQ5TA76 89 aa6.94□□□□□ -1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 MT1GP13640 62 aa6.93□□□□□ -1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 UQCR11O14957 56 aa6.92□□□□□ -1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 PP632Q6XCG6 107 aa6.91□□□□□ -1.3
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.89□□□□□ -1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.88□□□□□ -1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.87□□□□□ -1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 MT1LQ93083 61 aa6.83□□□□□ -1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.8□□□□□ -1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.79□□□□□ -1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 MT1MQ8N339 61 aa6.78□□□□□ -1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 PSPHP1O15172 72 aa6.75□□□□□ -1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.69□□□□□ -1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 V9GYY9 64 aa6.69□□□□□ -1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 Q1T7F1 81 aa6.68□□□□□ -1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP12-3P60328 96 aa6.64□□□□□ -1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 K7ERS5 55 aa6.61□□□□□ -1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.58□□□□□ -1.36
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.56□□□□□ -1.36
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.54□□□□□ -1.36
CD27-AS1-208ENST00000538616 A6NED7 52 aa6.49□□□□□ -1.37
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCP4P48539 62 aa6.38□□□□□ -1.39
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP12-4P60329 112 aa6.36□□□□□ -1.39
CD27-AS1-208ENST00000538616 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.3□□□□□ -1.4
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.29□□□□□ -1.4
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.23□□□□□ -1.41
CD27-AS1-208ENST00000538616 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CD27-AS1-208ENST00000538616 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.21□□□□□ -1.42
CD27-AS1-208ENST00000538616 ROMO1P60602 79 aa6.21□□□□□ -1.42
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.18□□□□□ -1.42
CD27-AS1-208ENST00000538616 MUC5ACP98088 5654 aa6.17□□□□□ -1.42
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.16□□□□□ -1.42
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CD27-AS1-208ENST00000538616 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.13□□□□□ -1.43
CD27-AS1-208ENST00000538616 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP5-8O75690 187 aa5.99□□□□□ -1.45
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.89□□□□□ -1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.85□□□□□ -1.47
CD27-AS1-208ENST00000538616 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.84□□□□□ -1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.83□□□□□ -1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 MT1AP04731 61 aa5.8□□□□□ -1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.8□□□□□ -1.48
CD27-AS1-208ENST00000538616 BRK1Q8WUW1 75 aa5.64□□□□□ -1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.61□□□□□ -1.51
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.52□□□□□ -1.53
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.42□□□□□ -1.54
CD27-AS1-208ENST00000538616 MT3P25713 68 aa5.29□□□□□ -1.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 PMAIP1Q13794 54 aa5.29□□□□□ -1.56
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRAC1Q96KF2 57 aa5.16□□□□□ -1.58
CD27-AS1-208ENST00000538616 LCE1EQ5T753 118 aa4.97□□□□□ -1.61
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRO0628Q9UI54 55 aa4.89□□□□□ -1.63
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.7□□□□□ -1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.69□□□□□ -1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.68□□□□□ -1.66
CD27-AS1-208ENST00000538616 LCE1CQ5T751 118 aa4.61□□□□□ -1.67
CD27-AS1-208ENST00000538616 SVIPQ8NHG7 77 aa4.53□□□□□ -1.68
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.52□□□□□ -1.69
CD27-AS1-208ENST00000538616 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.43□□□□□ -1.7
CD27-AS1-208ENST00000538616 H3BS24 57 aa4.4□□□□□ -1.71
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.35□□□□□ -1.71
CD27-AS1-208ENST00000538616 LCE1FQ5T754 118 aa4.33□□□□□ -1.72
CD27-AS1-208ENST00000538616 LUZP6Q538Z0 58 aa4.26□□□□□ -1.73
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHGR1C9JFL3 82 aa4.25□□□□□ -1.73
CD27-AS1-208ENST00000538616 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.17□□□□□ -1.74
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.81□□□□□ -1.8
CD27-AS1-208ENST00000538616 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.61□□□□□ -1.83
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.53□□□□□ -1.84
CD27-AS1-208ENST00000538616 NDUFAF8A1L188 74 aa3.48□□□□□ -1.85
CD27-AS1-208ENST00000538616 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.27□□□□□ -1.89
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRM1P04553 51 aa3.21□□□□□ -1.9
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A0A0MQY5 61 aa2.84□□□□□ -1.95
CD27-AS1-208ENST00000538616 INE1O15225 51 aa2.71□□□□□ -1.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.55□□□□□ -2
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