RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530756.1

BRMS1-208, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene BRMS1, Length 963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.26□□□□□ -1.57
BRMS1-208ENST00000530756 Q1T7F1 81 aa5.25□□□□□ -1.57
BRMS1-208ENST00000530756 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.25□□□□□ -1.57
BRMS1-208ENST00000530756 MT1MQ8N339 61 aa5.25□□□□□ -1.57
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.25□□□□□ -1.57
BRMS1-208ENST00000530756 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP12-1P59990 96 aa5.23□□□□□ -1.57
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.23□□□□□ -1.57
BRMS1-208ENST00000530756 A8MU10 97 aa5.2□□□□□ -1.58
BRMS1-208ENST00000530756 MT1LQ93083 61 aa5.18□□□□□ -1.58
BRMS1-208ENST00000530756 PP632Q6XCG6 107 aa5.16□□□□□ -1.58
BRMS1-208ENST00000530756 PSPHP1O15172 72 aa5.15□□□□□ -1.59
BRMS1-208ENST00000530756 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.15□□□□□ -1.59
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.13□□□□□ -1.59
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.11□□□□□ -1.59
BRMS1-208ENST00000530756 K7ERS5 55 aa5.07□□□□□ -1.6
BRMS1-208ENST00000530756 A6NED7 52 aa5.04□□□□□ -1.6
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5□□□□□ -1.61
BRMS1-208ENST00000530756 TNP1P09430 55 aa4.98□□□□□ -1.61
BRMS1-208ENST00000530756 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.98□□□□□ -1.61
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.96□□□□□ -1.62
BRMS1-208ENST00000530756 LCE3AQ5TA76 89 aa4.96□□□□□ -1.62
BRMS1-208ENST00000530756 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.9□□□□□ -1.63
BRMS1-208ENST00000530756 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.89□□□□□ -1.63
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.84□□□□□ -1.63
BRMS1-208ENST00000530756 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
BRMS1-208ENST00000530756 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.75□□□□□ -1.65
BRMS1-208ENST00000530756 H3BS24 57 aa4.74□□□□□ -1.65
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP12-4P60329 112 aa4.72□□□□□ -1.65
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.71□□□□□ -1.66
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP12-3P60328 96 aa4.71□□□□□ -1.66
BRMS1-208ENST00000530756 ROMO1P60602 79 aa4.71□□□□□ -1.66
BRMS1-208ENST00000530756 BRK1Q8WUW1 75 aa4.62□□□□□ -1.67
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.61□□□□□ -1.67
BRMS1-208ENST00000530756 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
BRMS1-208ENST00000530756 MUC5ACP98088 5654 aa4.54□□□□□ -1.68
BRMS1-208ENST00000530756 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.52□□□□□ -1.69
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.51□□□□□ -1.69
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP5-8O75690 187 aa4.5□□□□□ -1.69
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.44□□□□□ -1.7
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.43□□□□□ -1.7
BRMS1-208ENST00000530756 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.39□□□□□ -1.71
BRMS1-208ENST00000530756 MT1AP04731 61 aa4.37□□□□□ -1.71
BRMS1-208ENST00000530756 PMAIP1Q13794 54 aa4.37□□□□□ -1.71
BRMS1-208ENST00000530756 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.31□□□□□ -1.72
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.29□□□□□ -1.72
BRMS1-208ENST00000530756 PRO0628Q9UI54 55 aa4.29□□□□□ -1.72
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.26□□□□□ -1.73
BRMS1-208ENST00000530756 SVIPQ8NHG7 77 aa4.24□□□□□ -1.73
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.24□□□□□ -1.73
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.21□□□□□ -1.74
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.14□□□□□ -1.75
BRMS1-208ENST00000530756 PRAC1Q96KF2 57 aa4.06□□□□□ -1.76
BRMS1-208ENST00000530756 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.05□□□□□ -1.76
BRMS1-208ENST00000530756 MT3P25713 68 aa3.97□□□□□ -1.77
BRMS1-208ENST00000530756 LCE1EQ5T753 118 aa3.73□□□□□ -1.81
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.71□□□□□ -1.82
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.66□□□□□ -1.82
BRMS1-208ENST00000530756 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.6□□□□□ -1.83
BRMS1-208ENST00000530756 A0A0A0MQY5 61 aa3.58□□□□□ -1.84
BRMS1-208ENST00000530756 LUZP6Q538Z0 58 aa3.53□□□□□ -1.84
BRMS1-208ENST00000530756 LCE1CQ5T751 118 aa3.48□□□□□ -1.85
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.25□□□□□ -1.89
BRMS1-208ENST00000530756 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.16□□□□□ -1.9
BRMS1-208ENST00000530756 LCE1FQ5T754 118 aa3.14□□□□□ -1.91
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
BRMS1-208ENST00000530756 PHGR1C9JFL3 82 aa3.1□□□□□ -1.91
BRMS1-208ENST00000530756 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.02□□□□□ -1.93
BRMS1-208ENST00000530756 NDUFAF8A1L188 74 aa3.01□□□□□ -1.93
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.93□□□□□ -1.94
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.79□□□□□ -1.96
BRMS1-208ENST00000530756 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.74□□□□□ -1.97
BRMS1-208ENST00000530756 INE1O15225 51 aa2.55□□□□□ -2
BRMS1-208ENST00000530756 PRM1P04553 51 aa2.39□□□□□ -2.03
BRMS1-208ENST00000530756 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.3□□□□□ -2.04
BRMS1-208ENST00000530756 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.7 ms