RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526330.5

APLP2-208, Transcript of amyloid beta precursor like protein 2, human

TSL 3

Gene APLP2, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APLP2-208	ENST00000526330		A0A1B0GU69	56 aa		7.16	□□□□□ -1.26
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		7.16	□□□□□ -1.26
APLP2-208	ENST00000526330	TNP1	P09430	55 aa		7.14	□□□□□ -1.27
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		7.13	□□□□□ -1.27
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.99	□□□□□ -1.29
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.92	□□□□□ -1.3
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.9	□□□□□ -1.3
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.89	□□□□□ -1.31
APLP2-208	ENST00000526330	CCDC179	H3BU77	68 aa		6.83	□□□□□ -1.32
APLP2-208	ENST00000526330	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		6.83	□□□□□ -1.32
APLP2-208	ENST00000526330	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		6.82	□□□□□ -1.32
APLP2-208	ENST00000526330	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.82	□□□□□ -1.32
APLP2-208	ENST00000526330	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.8	□□□□□ -1.32
APLP2-208	ENST00000526330	PRR15L	Q9BU68	103 aa		6.79	□□□□□ -1.32
APLP2-208	ENST00000526330	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.76	□□□□□ -1.33
APLP2-208	ENST00000526330	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.65	□□□□□ -1.34
APLP2-208	ENST00000526330	UQCR11	O14957	56 aa		6.63	□□□□□ -1.35
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.62	□□□□□ -1.35
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.49	□□□□□ -1.37
APLP2-208	ENST00000526330	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		6.47	□□□□□ -1.37
APLP2-208	ENST00000526330	TMEM258	P61165	79 aa		6.45	□□□□□ -1.38
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.43	□□□□□ -1.38
APLP2-208	ENST00000526330	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.42	□□□□□ -1.38
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		6.4	□□□□□ -1.38
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.37	□□□□□ -1.39
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.34	□□□□□ -1.39
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.34	□□□□□ -1.39
APLP2-208	ENST00000526330	MT1A	P04731	61 aa		6.32	□□□□□ -1.4
APLP2-208	ENST00000526330		K7ERS5	55 aa		6.26	□□□□□ -1.41
APLP2-208	ENST00000526330	PSPHP1	O15172	72 aa		6.23	□□□□□ -1.41
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.21	□□□□□ -1.42
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP5-8	O75690	187 aa		6.18	□□□□□ -1.42
APLP2-208	ENST00000526330	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
APLP2-208	ENST00000526330	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
APLP2-208	ENST00000526330		Q1T7F1	81 aa		6.14	□□□□□ -1.43
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.12	□□□□□ -1.43
APLP2-208	ENST00000526330	MUC5AC	P98088	5654 aa		6.09	□□□□□ -1.43
APLP2-208	ENST00000526330	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		6.08	□□□□□ -1.44
APLP2-208	ENST00000526330		V9GYY9	64 aa		6.08	□□□□□ -1.44
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		6.07	□□□□□ -1.44
APLP2-208	ENST00000526330	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.98	□□□□□ -1.45
APLP2-208	ENST00000526330		A6NED7	52 aa		5.93	□□□□□ -1.46
APLP2-208	ENST00000526330	ROMO1	P60602	79 aa		5.92	□□□□□ -1.46
APLP2-208	ENST00000526330	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
APLP2-208	ENST00000526330	PCP4	P48539	62 aa		5.84	□□□□□ -1.47
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.78	□□□□□ -1.48
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.78	□□□□□ -1.48
APLP2-208	ENST00000526330	MT3	P25713	68 aa		5.74	□□□□□ -1.49
APLP2-208	ENST00000526330	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.36	□□□□□ -1.55
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.18	□□□□□ -1.58
APLP2-208	ENST00000526330	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6
APLP2-208	ENST00000526330	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.99	□□□□□ -1.61
APLP2-208	ENST00000526330	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APLP2-208	ENST00000526330		H3BS24	57 aa		4.87	□□□□□ -1.63
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.73	□□□□□ -1.65
APLP2-208	ENST00000526330	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.69	□□□□□ -1.66
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
APLP2-208	ENST00000526330	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.55	□□□□□ -1.68
APLP2-208	ENST00000526330	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APLP2-208	ENST00000526330	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.53	□□□□□ -1.68
APLP2-208	ENST00000526330	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.44	□□□□□ -1.7
APLP2-208	ENST00000526330	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.29	□□□□□ -1.72
APLP2-208	ENST00000526330	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.22	□□□□□ -1.73
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.21	□□□□□ -1.74
APLP2-208	ENST00000526330	PHGR1	C9JFL3	82 aa		4.11	□□□□□ -1.75
APLP2-208	ENST00000526330	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.02	□□□□□ -1.77
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.86	□□□□□ -1.79
APLP2-208	ENST00000526330	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.76	□□□□□ -1.81
APLP2-208	ENST00000526330	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.67	□□□□□ -1.82
APLP2-208	ENST00000526330		A0A0A0MQY5	61 aa		3.47	□□□□□ -1.85
APLP2-208	ENST00000526330	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.21	□□□□□ -1.9
APLP2-208	ENST00000526330	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.1	□□□□□ -1.91
APLP2-208	ENST00000526330	PRM1	P04553	51 aa		3.04	□□□□□ -1.92
APLP2-208	ENST00000526330	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.69	□□□□□ -1.98
APLP2-208	ENST00000526330	INE1	O15225	51 aa		2.59	□□□□□ -1.99

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