RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525939.1

ABCA7-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 7, human

TSL 3

Gene ABCA7, Length 374 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA7-208	ENST00000525939	MT1L	Q93083	61 aa		7.93	□□□□□ -1.14
ABCA7-208	ENST00000525939		K7ERS5	55 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ABCA7-208	ENST00000525939	PP632	Q6XCG6	107 aa		7.92	□□□□□ -1.14
ABCA7-208	ENST00000525939	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		7.85	□□□□□ -1.15
ABCA7-208	ENST00000525939	MT1M	Q8N339	61 aa		7.85	□□□□□ -1.15
ABCA7-208	ENST00000525939	PCP4	P48539	62 aa		7.84	□□□□□ -1.15
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP12-3	P60328	96 aa		7.78	□□□□□ -1.16
ABCA7-208	ENST00000525939		A6NED7	52 aa		7.76	□□□□□ -1.17
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		7.64	□□□□□ -1.19
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		7.6	□□□□□ -1.19
ABCA7-208	ENST00000525939	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ABCA7-208	ENST00000525939	LCE4A	Q5TA78	99 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		7.48	□□□□□ -1.21
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		7.43	□□□□□ -1.22
ABCA7-208	ENST00000525939	ROMO1	P60602	79 aa		7.42	□□□□□ -1.22
ABCA7-208	ENST00000525939	LCE1D	Q5T752	114 aa		7.4	□□□□□ -1.22
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		7.34	□□□□□ -1.23
ABCA7-208	ENST00000525939	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ABCA7-208	ENST00000525939	MT4	P47944	62 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
ABCA7-208	ENST00000525939	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		7.19	□□□□□ -1.26
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ABCA7-208	ENST00000525939	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		7.11	□□□□□ -1.27
ABCA7-208	ENST00000525939	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.09	□□□□□ -1.27
ABCA7-208	ENST00000525939	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCA7-208	ENST00000525939	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCA7-208	ENST00000525939	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
ABCA7-208	ENST00000525939	BRK1	Q8WUW1	75 aa		6.83	□□□□□ -1.32
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.81	□□□□□ -1.32
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.77	□□□□□ -1.33
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.77	□□□□□ -1.33
ABCA7-208	ENST00000525939	MT1A	P04731	61 aa		6.76	□□□□□ -1.33
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.68	□□□□□ -1.34
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		6.54	□□□□□ -1.36
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.53	□□□□□ -1.36
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.52	□□□□□ -1.37
ABCA7-208	ENST00000525939	PMAIP1	Q13794	54 aa		6.45	□□□□□ -1.38
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		6.34	□□□□□ -1.39
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ABCA7-208	ENST00000525939	MT3	P25713	68 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ABCA7-208	ENST00000525939	PRAC1	Q96KF2	57 aa		6.14	□□□□□ -1.43
ABCA7-208	ENST00000525939	PRO0628	Q9UI54	55 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP5-8	O75690	187 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ABCA7-208	ENST00000525939	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ABCA7-208	ENST00000525939	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.72	□□□□□ -1.49
ABCA7-208	ENST00000525939	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
ABCA7-208	ENST00000525939	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.68	□□□□□ -1.5
ABCA7-208	ENST00000525939	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.67	□□□□□ -1.5
ABCA7-208	ENST00000525939	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
ABCA7-208	ENST00000525939	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.48	□□□□□ -1.53
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.3	□□□□□ -1.56
ABCA7-208	ENST00000525939	LCE1C	Q5T751	118 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ABCA7-208	ENST00000525939	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		5.26	□□□□□ -1.57
ABCA7-208	ENST00000525939	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ABCA7-208	ENST00000525939	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5.21	□□□□□ -1.58
ABCA7-208	ENST00000525939	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ABCA7-208	ENST00000525939	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ABCA7-208	ENST00000525939	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ABCA7-208	ENST00000525939	PHGR1	C9JFL3	82 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.93	□□□□□ -1.78
ABCA7-208	ENST00000525939	PRM1	P04553	51 aa		3.78	□□□□□ -1.8
ABCA7-208	ENST00000525939	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ABCA7-208	ENST00000525939	INE1	O15225	51 aa		3.51	□□□□□ -1.85
ABCA7-208	ENST00000525939		A0A0A0MQY5	61 aa		3.42	□□□□□ -1.86
ABCA7-208	ENST00000525939	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3	□□□□□ -1.93
ABCA7-208	ENST00000525939		H3BS24	57 aa		2.87	□□□□□ -1.95
ABCA7-208	ENST00000525939	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.61	□□□□□ -1.99

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.8 ms