RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518848.5

HOXA-AS3-201, HOXA cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXA-AS3, Length 562 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.95□□□□□ -1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LCE3AQ5TA76 89 aa5.94□□□□□ -1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.93□□□□□ -1.46
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CCDC179H3BU77 68 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.77□□□□□ -1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.74□□□□□ -1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 UQCR11O14957 56 aa5.73□□□□□ -1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP12-3P60328 96 aa5.72□□□□□ -1.49
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.68□□□□□ -1.5
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXA-AS3-201ENST00000518848 TMEM258P61165 79 aa5.66□□□□□ -1.5
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PCP4P48539 62 aa5.65□□□□□ -1.5
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP12-4P60329 112 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.58□□□□□ -1.52
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.58□□□□□ -1.52
HOXA-AS3-201ENST00000518848 K7ERS5 55 aa5.55□□□□□ -1.52
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
HOXA-AS3-201ENST00000518848 V9GYY9 64 aa5.43□□□□□ -1.54
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PSPHP1O15172 72 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.36□□□□□ -1.55
HOXA-AS3-201ENST00000518848 Q1T7F1 81 aa5.33□□□□□ -1.56
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.32□□□□□ -1.56
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXA-AS3-201ENST00000518848 A6NED7 52 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXA-AS3-201ENST00000518848 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MT1AP04731 61 aa5.16□□□□□ -1.58
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXA-AS3-201ENST00000518848 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
HOXA-AS3-201ENST00000518848 ROMO1P60602 79 aa5.09□□□□□ -1.59
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
HOXA-AS3-201ENST00000518848 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP5-8O75690 187 aa5.08□□□□□ -1.6
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MUC5ACP98088 5654 aa5.08□□□□□ -1.6
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXA-AS3-201ENST00000518848 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.94□□□□□ -1.62
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.9□□□□□ -1.63
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.88□□□□□ -1.63
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MT3P25713 68 aa4.76□□□□□ -1.65
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXA-AS3-201ENST00000518848 SVIPQ8NHG7 77 aa4.6□□□□□ -1.67
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PRO0628Q9UI54 55 aa4.57□□□□□ -1.68
HOXA-AS3-201ENST00000518848 BRK1Q8WUW1 75 aa4.55□□□□□ -1.68
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LCE1EQ5T753 118 aa4.49□□□□□ -1.69
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PMAIP1Q13794 54 aa4.34□□□□□ -1.71
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.2□□□□□ -1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.19□□□□□ -1.74
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LCE1CQ5T751 118 aa4.15□□□□□ -1.75
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.15□□□□□ -1.75
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PRAC1Q96KF2 57 aa3.98□□□□□ -1.77
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.83□□□□□ -1.8
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LCE1FQ5T754 118 aa3.78□□□□□ -1.8
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.78□□□□□ -1.8
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.77□□□□□ -1.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.76□□□□□ -1.81
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.54□□□□□ -1.84
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PHGR1C9JFL3 82 aa3.45□□□□□ -1.86
HOXA-AS3-201ENST00000518848 LUZP6Q538Z0 58 aa3.41□□□□□ -1.86
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.4□□□□□ -1.87
HOXA-AS3-201ENST00000518848 NDUFAF8A1L188 74 aa3.28□□□□□ -1.88
HOXA-AS3-201ENST00000518848 H3BS24 57 aa3.18□□□□□ -1.9
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.08□□□□□ -1.92
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.06□□□□□ -1.92
HOXA-AS3-201ENST00000518848 A0A0A0MQY5 61 aa3.01□□□□□ -1.93
HOXA-AS3-201ENST00000518848 INE1O15225 51 aa2.79□□□□□ -1.96
HOXA-AS3-201ENST00000518848 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.67□□□□□ -1.98
HOXA-AS3-201ENST00000518848 PRM1P04553 51 aa2.59□□□□□ -1.99
HOXA-AS3-201ENST00000518848 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.9 ms