RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513678.5

MATR3-222, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-222	ENST00000513678	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.95	□□□□□ -1.46
MATR3-222	ENST00000513678	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.92	□□□□□ -1.46
MATR3-222	ENST00000513678	TMEM258	P61165	79 aa		5.87	□□□□□ -1.47
MATR3-222	ENST00000513678	MT4	P47944	62 aa		5.84	□□□□□ -1.47
MATR3-222	ENST00000513678	UQCR11	O14957	56 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.83	□□□□□ -1.48
MATR3-222	ENST00000513678	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.75	□□□□□ -1.49
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.7	□□□□□ -1.5
MATR3-222	ENST00000513678	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.67	□□□□□ -1.5
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.66	□□□□□ -1.5
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.65	□□□□□ -1.5
MATR3-222	ENST00000513678		K7ERS5	55 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MATR3-222	ENST00000513678		V9GYY9	64 aa		5.58	□□□□□ -1.52
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
MATR3-222	ENST00000513678		Q1T7F1	81 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.54	□□□□□ -1.52
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5.5	□□□□□ -1.53
MATR3-222	ENST00000513678	PSPHP1	O15172	72 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.49	□□□□□ -1.53
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.47	□□□□□ -1.53
MATR3-222	ENST00000513678	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.45	□□□□□ -1.54
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.44	□□□□□ -1.54
MATR3-222	ENST00000513678	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		5.37	□□□□□ -1.55
MATR3-222	ENST00000513678	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
MATR3-222	ENST00000513678		A6NED7	52 aa		5.32	□□□□□ -1.56
MATR3-222	ENST00000513678	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.3	□□□□□ -1.56
MATR3-222	ENST00000513678	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.28	□□□□□ -1.56
MATR3-222	ENST00000513678	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MATR3-222	ENST00000513678	ROMO1	P60602	79 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MATR3-222	ENST00000513678	MT1A	P04731	61 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MATR3-222	ENST00000513678	PCP4	P48539	62 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MATR3-222	ENST00000513678	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
MATR3-222	ENST00000513678	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-222	ENST00000513678	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MATR3-222	ENST00000513678	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.74	□□□□□ -1.65
MATR3-222	ENST00000513678	MT3	P25713	68 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MATR3-222	ENST00000513678	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.46	□□□□□ -1.7
MATR3-222	ENST00000513678	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.34	□□□□□ -1.71
MATR3-222	ENST00000513678	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.2	□□□□□ -1.74
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MATR3-222	ENST00000513678	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MATR3-222	ENST00000513678	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.02	□□□□□ -1.77
MATR3-222	ENST00000513678	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.84	□□□□□ -1.79
MATR3-222	ENST00000513678	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.83	□□□□□ -1.8
MATR3-222	ENST00000513678	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.81	□□□□□ -1.8
MATR3-222	ENST00000513678	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.67	□□□□□ -1.82
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.67	□□□□□ -1.82
MATR3-222	ENST00000513678	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MATR3-222	ENST00000513678	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MATR3-222	ENST00000513678	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.48	□□□□□ -1.85
MATR3-222	ENST00000513678	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.46	□□□□□ -1.86
MATR3-222	ENST00000513678		H3BS24	57 aa		3.44	□□□□□ -1.86
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.35	□□□□□ -1.87
MATR3-222	ENST00000513678	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.26	□□□□□ -1.89
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.04	□□□□□ -1.92
MATR3-222	ENST00000513678	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.95	□□□□□ -1.94
MATR3-222	ENST00000513678	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MATR3-222	ENST00000513678	PRM1	P04553	51 aa		2.62	□□□□□ -1.99
MATR3-222	ENST00000513678		A0A0A0MQY5	61 aa		2.58	□□□□□ -2
MATR3-222	ENST00000513678	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.49	□□□□□ -2.01
MATR3-222	ENST00000513678	INE1	O15225	51 aa		2.14	□□□□□ -2.07
MATR3-222	ENST00000513678	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.08	□□□□□ -2.08

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