RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-211ENST00000513325 A8MU10 97 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC3-211ENST00000513325 COX7CP15954 63 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GU69 56 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-211ENST00000513325 H7BZZ5 65 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-211ENST00000513325 TNP1P09430 55 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-211ENST00000513325 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP12-3P60328 96 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC3-211ENST00000513325 PRR15LQ9BU68 103 aa5.58□□□□□ -1.52
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
HERC3-211ENST00000513325 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-211ENST00000513325 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-211ENST00000513325 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.47□□□□□ -1.53
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP12-4P60329 112 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-211ENST00000513325 CCDC179H3BU77 68 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-211ENST00000513325 PCP4P48539 62 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-211ENST00000513325 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
HERC3-211ENST00000513325 UQCR11O14957 56 aa5.39□□□□□ -1.55
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC3-211ENST00000513325 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
HERC3-211ENST00000513325 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.25□□□□□ -1.57
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.2□□□□□ -1.58
HERC3-211ENST00000513325 K7ERS5 55 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC3-211ENST00000513325 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC3-211ENST00000513325 TMEM258P61165 79 aa5.18□□□□□ -1.58
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.11□□□□□ -1.59
HERC3-211ENST00000513325 MT1AP04731 61 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.1□□□□□ -1.59
HERC3-211ENST00000513325 PSPHP1O15172 72 aa5.03□□□□□ -1.6
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP5-8O75690 187 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC3-211ENST00000513325 V9GYY9 64 aa4.96□□□□□ -1.62
HERC3-211ENST00000513325 H3BS24 57 aa4.94□□□□□ -1.62
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-211ENST00000513325 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
HERC3-211ENST00000513325 Q1T7F1 81 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-211ENST00000513325 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.89□□□□□ -1.63
HERC3-211ENST00000513325 A6NED7 52 aa4.83□□□□□ -1.64
HERC3-211ENST00000513325 ROMO1P60602 79 aa4.8□□□□□ -1.64
HERC3-211ENST00000513325 MUC5ACP98088 5654 aa4.79□□□□□ -1.64
HERC3-211ENST00000513325 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HERC3-211ENST00000513325 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
HERC3-211ENST00000513325 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.71□□□□□ -1.65
HERC3-211ENST00000513325 MT3P25713 68 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.63□□□□□ -1.67
HERC3-211ENST00000513325 BRK1Q8WUW1 75 aa4.41□□□□□ -1.7
HERC3-211ENST00000513325 PRO0628Q9UI54 55 aa4.35□□□□□ -1.71
HERC3-211ENST00000513325 LCE1EQ5T753 118 aa4.34□□□□□ -1.71
HERC3-211ENST00000513325 PMAIP1Q13794 54 aa4.19□□□□□ -1.74
HERC3-211ENST00000513325 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.14□□□□□ -1.75
HERC3-211ENST00000513325 SVIPQ8NHG7 77 aa4.08□□□□□ -1.76
HERC3-211ENST00000513325 LCE1CQ5T751 118 aa4.02□□□□□ -1.77
HERC3-211ENST00000513325 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.02□□□□□ -1.77
HERC3-211ENST00000513325 PRAC1Q96KF2 57 aa3.92□□□□□ -1.78
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.8□□□□□ -1.8
HERC3-211ENST00000513325 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.69□□□□□ -1.82
HERC3-211ENST00000513325 LCE1FQ5T754 118 aa3.62□□□□□ -1.83
HERC3-211ENST00000513325 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-211ENST00000513325 PHGR1C9JFL3 82 aa3.39□□□□□ -1.87
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.36□□□□□ -1.87
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.24□□□□□ -1.89
HERC3-211ENST00000513325 LUZP6Q538Z0 58 aa3.18□□□□□ -1.9
HERC3-211ENST00000513325 NDUFAF8A1L188 74 aa3.13□□□□□ -1.91
HERC3-211ENST00000513325 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.94□□□□□ -1.94
HERC3-211ENST00000513325 A0A0A0MQY5 61 aa2.9□□□□□ -1.95
HERC3-211ENST00000513325 INE1O15225 51 aa2.59□□□□□ -1.99
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.56□□□□□ -2
HERC3-211ENST00000513325 PRM1P04553 51 aa2.45□□□□□ -2.02
HERC3-211ENST00000513325 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.08□□□□□ -2.08
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