RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512716.1

RASGEF1B-210, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-210ENST00000512716 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RASGEF1B-210ENST00000512716 MT1LQ93083 61 aa8.55□□□□□ -1.04
RASGEF1B-210ENST00000512716 K7ERS5 55 aa8.51□□□□□ -1.05
RASGEF1B-210ENST00000512716 MT1MQ8N339 61 aa8.49□□□□□ -1.05
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.39□□□□□ -1.07
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP12-3P60328 96 aa8.38□□□□□ -1.07
RASGEF1B-210ENST00000512716 A6NED7 52 aa8.32□□□□□ -1.08
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.32□□□□□ -1.08
RASGEF1B-210ENST00000512716 GPR98Q8WXG9 6306 aa8.3□□□□□ -1.08
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.28□□□□□ -1.08
RASGEF1B-210ENST00000512716 PCP4P48539 62 aa8.24□□□□□ -1.09
RASGEF1B-210ENST00000512716 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
RASGEF1B-210ENST00000512716 LCE4AQ5TA78 99 aa8.14□□□□□ -1.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.14□□□□□ -1.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 LCE1DQ5T752 114 aa8.09□□□□□ -1.11
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.06□□□□□ -1.12
RASGEF1B-210ENST00000512716 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.06□□□□□ -1.12
RASGEF1B-210ENST00000512716 MT4P47944 62 aa8.04□□□□□ -1.12
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.98□□□□□ -1.13
RASGEF1B-210ENST00000512716 ROMO1P60602 79 aa7.93□□□□□ -1.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.9□□□□□ -1.14
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.88□□□□□ -1.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.85□□□□□ -1.15
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.8□□□□□ -1.16
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RASGEF1B-210ENST00000512716 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.72□□□□□ -1.17
RASGEF1B-210ENST00000512716 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.71□□□□□ -1.18
RASGEF1B-210ENST00000512716 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.67□□□□□ -1.18
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.63□□□□□ -1.19
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP12-4P60329 112 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.55□□□□□ -1.2
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.51□□□□□ -1.21
RASGEF1B-210ENST00000512716 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.38□□□□□ -1.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.37□□□□□ -1.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 MT1AP04731 61 aa7.29□□□□□ -1.24
RASGEF1B-210ENST00000512716 BRK1Q8WUW1 75 aa7.28□□□□□ -1.24
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa7.26□□□□□ -1.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.23□□□□□ -1.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP5-2Q701N4 177 aa7.02□□□□□ -1.29
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.02□□□□□ -1.29
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.88□□□□□ -1.31
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.85□□□□□ -1.31
RASGEF1B-210ENST00000512716 PMAIP1Q13794 54 aa6.83□□□□□ -1.32
RASGEF1B-210ENST00000512716 MT3P25713 68 aa6.66□□□□□ -1.34
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP5-8O75690 187 aa6.61□□□□□ -1.35
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRAC1Q96KF2 57 aa6.56□□□□□ -1.36
RASGEF1B-210ENST00000512716 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.52□□□□□ -1.37
RASGEF1B-210ENST00000512716 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRO0628Q9UI54 55 aa6.37□□□□□ -1.39
RASGEF1B-210ENST00000512716 MUC5ACP98088 5654 aa6.37□□□□□ -1.39
RASGEF1B-210ENST00000512716 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.27□□□□□ -1.41
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.27□□□□□ -1.41
RASGEF1B-210ENST00000512716 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.1□□□□□ -1.43
RASGEF1B-210ENST00000512716 LCE1EQ5T753 118 aa6.06□□□□□ -1.44
RASGEF1B-210ENST00000512716 SVIPQ8NHG7 77 aa5.9□□□□□ -1.46
RASGEF1B-210ENST00000512716 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.74□□□□□ -1.49
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.72□□□□□ -1.49
RASGEF1B-210ENST00000512716 LCE1CQ5T751 118 aa5.63□□□□□ -1.51
RASGEF1B-210ENST00000512716 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.6□□□□□ -1.51
RASGEF1B-210ENST00000512716 LUZP6Q538Z0 58 aa5.56□□□□□ -1.52
RASGEF1B-210ENST00000512716 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.3□□□□□ -1.56
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.09□□□□□ -1.59
RASGEF1B-210ENST00000512716 LCE1FQ5T754 118 aa4.91□□□□□ -1.62
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.75□□□□□ -1.65
RASGEF1B-210ENST00000512716 NDUFAF8A1L188 74 aa4.5□□□□□ -1.69
RASGEF1B-210ENST00000512716 PHGR1C9JFL3 82 aa4.48□□□□□ -1.69
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.35□□□□□ -1.71
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRM1P04553 51 aa4.07□□□□□ -1.76
RASGEF1B-210ENST00000512716 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.01□□□□□ -1.77
RASGEF1B-210ENST00000512716 H3BS24 57 aa3.87□□□□□ -1.79
RASGEF1B-210ENST00000512716 INE1O15225 51 aa3.62□□□□□ -1.83
RASGEF1B-210ENST00000512716 A0A0A0MQY5 61 aa3.58□□□□□ -1.84
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.35□□□□□ -1.87
RASGEF1B-210ENST00000512716 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.89□□□□□ -1.95
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