RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512553.5

ITGA3-213, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-213ENST00000512553 UQCR11O14957 56 aa3.29□□□□□ -1.88
ITGA3-213ENST00000512553 TMEM258P61165 79 aa3.29□□□□□ -1.88
ITGA3-213ENST00000512553 LCE1DQ5T752 114 aa3.28□□□□□ -1.88
ITGA3-213ENST00000512553 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.26□□□□□ -1.89
ITGA3-213ENST00000512553 K7ERS5 55 aa3.23□□□□□ -1.89
ITGA3-213ENST00000512553 MT4P47944 62 aa3.23□□□□□ -1.89
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP12-3P60328 96 aa3.23□□□□□ -1.89
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.22□□□□□ -1.89
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.21□□□□□ -1.9
ITGA3-213ENST00000512553 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.19□□□□□ -1.9
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.18□□□□□ -1.9
ITGA3-213ENST00000512553 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.17□□□□□ -1.9
ITGA3-213ENST00000512553 V9GYY9 64 aa3.17□□□□□ -1.9
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.16□□□□□ -1.9
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.1□□□□□ -1.91
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.1□□□□□ -1.91
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.09□□□□□ -1.91
ITGA3-213ENST00000512553 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.07□□□□□ -1.92
ITGA3-213ENST00000512553 Q1T7F1 81 aa3.07□□□□□ -1.92
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.07□□□□□ -1.92
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ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP12-4P60329 112 aa3.06□□□□□ -1.92
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
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ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.01□□□□□ -1.93
ITGA3-213ENST00000512553 A6NED7 52 aa3□□□□□ -1.93
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3□□□□□ -1.93
ITGA3-213ENST00000512553 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3□□□□□ -1.93
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.99□□□□□ -1.93
ITGA3-213ENST00000512553 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.97□□□□□ -1.93
ITGA3-213ENST00000512553 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.94□□□□□ -1.94
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ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.7□□□□□ -1.98
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP5-8O75690 187 aa2.67□□□□□ -1.98
ITGA3-213ENST00000512553 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
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ITGA3-213ENST00000512553 MUC5ACP98088 5654 aa2.62□□□□□ -1.99
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.6□□□□□ -1.99
ITGA3-213ENST00000512553 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.53□□□□□ -2
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.51□□□□□ -2.01
ITGA3-213ENST00000512553 BRK1Q8WUW1 75 aa2.5□□□□□ -2.01
ITGA3-213ENST00000512553 LCE1EQ5T753 118 aa2.44□□□□□ -2.02
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ITGA3-213ENST00000512553 LCE1CQ5T751 118 aa2.26□□□□□ -2.05
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ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.06□□□□□ -2.08
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
ITGA3-213ENST00000512553 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.05□□□□□ -2.08
ITGA3-213ENST00000512553 LCE1FQ5T754 118 aa2.04□□□□□ -2.08
ITGA3-213ENST00000512553 LUZP6Q538Z0 58 aa2.02□□□□□ -2.09
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.02□□□□□ -2.09
ITGA3-213ENST00000512553 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.01□□□□□ -2.09
ITGA3-213ENST00000512553 SVIPQ8NHG7 77 aa2□□□□□ -2.09
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.84□□□□□ -2.11
ITGA3-213ENST00000512553 PHGR1C9JFL3 82 aa1.81□□□□□ -2.12
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.66□□□□□ -2.14
ITGA3-213ENST00000512553 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.57□□□□□ -2.16
ITGA3-213ENST00000512553 NDUFAF8A1L188 74 aa1.55□□□□□ -2.16
ITGA3-213ENST00000512553 PRM1P04553 51 aa1.46□□□□□ -2.18
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.41□□□□□ -2.18
ITGA3-213ENST00000512553 A0A0A0MQY5 61 aa1.37□□□□□ -2.19
ITGA3-213ENST00000512553 INE1O15225 51 aa1.25□□□□□ -2.21
ITGA3-213ENST00000512553 H3BS24 57 aa1.19□□□□□ -2.22
ITGA3-213ENST00000512553 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.17□□□□□ -2.22
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