RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.73□□□□□ -1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 LCE3AQ5TA76 89 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 A8MU10 97 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.65□□□□□ -1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 V9GYY9 64 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 Q1T7F1 81 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 PRR15LQ9BU68 103 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP12-3P60328 96 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.36□□□□□ -1.39
SH3BP2-220ENST00000511663 PSPHP1O15172 72 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP12-4P60329 112 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 UQCR11O14957 56 aa6.29□□□□□ -1.4
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.22□□□□□ -1.41
SH3BP2-220ENST00000511663 A6NED7 52 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 BRK1Q8WUW1 75 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 PRO0628Q9UI54 55 aa6.15□□□□□ -1.42
SH3BP2-220ENST00000511663 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 K7ERS5 55 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.12□□□□□ -1.43
SH3BP2-220ENST00000511663 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.98□□□□□ -1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP2-220ENST00000511663 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.94□□□□□ -1.46
SH3BP2-220ENST00000511663 SVIPQ8NHG7 77 aa5.88□□□□□ -1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.85□□□□□ -1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 PMAIP1Q13794 54 aa5.84□□□□□ -1.47
SH3BP2-220ENST00000511663 MT1AP04731 61 aa5.81□□□□□ -1.48
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.77□□□□□ -1.49
SH3BP2-220ENST00000511663 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP5-8O75690 187 aa5.63□□□□□ -1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 ROMO1P60602 79 aa5.6□□□□□ -1.51
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.58□□□□□ -1.52
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.52□□□□□ -1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.47□□□□□ -1.53
SH3BP2-220ENST00000511663 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.43□□□□□ -1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 MUC5ACP98088 5654 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 PRAC1Q96KF2 57 aa5.4□□□□□ -1.54
SH3BP2-220ENST00000511663 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 MT3P25713 68 aa5.38□□□□□ -1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.22□□□□□ -1.57
SH3BP2-220ENST00000511663 LCE1EQ5T753 118 aa4.97□□□□□ -1.61
SH3BP2-220ENST00000511663 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.73□□□□□ -1.65
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.66□□□□□ -1.66
SH3BP2-220ENST00000511663 LCE1CQ5T751 118 aa4.6□□□□□ -1.67
SH3BP2-220ENST00000511663 LUZP6Q538Z0 58 aa4.46□□□□□ -1.7
SH3BP2-220ENST00000511663 NDUFAF8A1L188 74 aa4.36□□□□□ -1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.36□□□□□ -1.71
SH3BP2-220ENST00000511663 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.26□□□□□ -1.73
SH3BP2-220ENST00000511663 LCE1FQ5T754 118 aa4.16□□□□□ -1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.16□□□□□ -1.74
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
SH3BP2-220ENST00000511663 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.97□□□□□ -1.77
SH3BP2-220ENST00000511663 H3BS24 57 aa3.95□□□□□ -1.78
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0A0MQY5 61 aa3.93□□□□□ -1.78
SH3BP2-220ENST00000511663 PHGR1C9JFL3 82 aa3.87□□□□□ -1.79
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.79□□□□□ -1.8
SH3BP2-220ENST00000511663 INE1O15225 51 aa3.72□□□□□ -1.81
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.54□□□□□ -1.84
SH3BP2-220ENST00000511663 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.37□□□□□ -1.87
SH3BP2-220ENST00000511663 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.95□□□□□ -1.94
SH3BP2-220ENST00000511663 PRM1P04553 51 aa2.9□□□□□ -1.95
SH3BP2-220ENST00000511663 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.35□□□□□ -2.03
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