RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.34□□□□□ -1.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRO0628Q9UI54 55 aa5.31□□□□□ -1.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.3□□□□□ -1.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCE4AQ5TA78 99 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCE1DQ5T752 114 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UQCR11O14957 56 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MT4P47944 62 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 V9GYY9 64 aa5.2□□□□□ -1.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP12-3P60328 96 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 Q1T7F1 81 aa5.18□□□□□ -1.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BRK1Q8WUW1 75 aa5.18□□□□□ -1.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.17□□□□□ -1.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.15□□□□□ -1.59
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.08□□□□□ -1.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 K7ERS5 55 aa5.07□□□□□ -1.6
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.05□□□□□ -1.6
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.95□□□□□ -1.62
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A6NED7 52 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.9□□□□□ -1.63
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.88□□□□□ -1.63
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP12-4P60329 112 aa4.87□□□□□ -1.63
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.87□□□□□ -1.63
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.87□□□□□ -1.63
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.84□□□□□ -1.63
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.81□□□□□ -1.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.8□□□□□ -1.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ROMO1P60602 79 aa4.67□□□□□ -1.66
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MT1AP04731 61 aa4.59□□□□□ -1.67
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.54□□□□□ -1.68
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRAC1Q96KF2 57 aa4.5□□□□□ -1.69
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.48□□□□□ -1.69
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.45□□□□□ -1.7
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP5-8O75690 187 aa4.31□□□□□ -1.72
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MT3P25713 68 aa4.22□□□□□ -1.73
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.2□□□□□ -1.74
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 H3BS24 57 aa4.15□□□□□ -1.75
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.13□□□□□ -1.75
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 NDUFAF8A1L188 74 aa3.84□□□□□ -1.79
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.65□□□□□ -1.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.64□□□□□ -1.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCE1CQ5T751 118 aa3.62□□□□□ -1.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 A0A0A0MQY5 61 aa3.59□□□□□ -1.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.44□□□□□ -1.86
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.23□□□□□ -1.89
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LCE1FQ5T754 118 aa3.22□□□□□ -1.89
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.99□□□□□ -1.93
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PHGR1C9JFL3 82 aa2.88□□□□□ -1.95
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.73□□□□□ -1.97
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.57□□□□□ -2
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRM1P04553 51 aa2.35□□□□□ -2.03
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.23□□□□□ -2.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.83□□□□□ -2.12
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