RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504927.5

DDR1-255, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, human

TSL 4

Gene DDR1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		7.56	□□□□□ -1.2
DDR1-255	ENST00000504927		A6NED7	52 aa		7.53	□□□□□ -1.2
DDR1-255	ENST00000504927	MT1G	P13640	62 aa		7.46	□□□□□ -1.22
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		7.45	□□□□□ -1.22
DDR1-255	ENST00000504927	PP632	Q6XCG6	107 aa		7.4	□□□□□ -1.22
DDR1-255	ENST00000504927	MT1L	Q93083	61 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDR1-255	ENST00000504927	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP12-3	P60328	96 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDR1-255	ENST00000504927	MT1M	Q8N339	61 aa		7.27	□□□□□ -1.25
DDR1-255	ENST00000504927	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		7.24	□□□□□ -1.25
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		7.23	□□□□□ -1.25
DDR1-255	ENST00000504927	ROMO1	P60602	79 aa		7.14	□□□□□ -1.27
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		7.08	□□□□□ -1.28
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		7.06	□□□□□ -1.28
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		7.04	□□□□□ -1.28
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.97	□□□□□ -1.29
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.94	□□□□□ -1.3
DDR1-255	ENST00000504927	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.91	□□□□□ -1.3
DDR1-255	ENST00000504927	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.89	□□□□□ -1.31
DDR1-255	ENST00000504927	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.86	□□□□□ -1.31
DDR1-255	ENST00000504927	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		6.84	□□□□□ -1.31
DDR1-255	ENST00000504927	MT4	P47944	62 aa		6.82	□□□□□ -1.32
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.8	□□□□□ -1.32
DDR1-255	ENST00000504927	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.77	□□□□□ -1.33
DDR1-255	ENST00000504927	BRK1	Q8WUW1	75 aa		6.72	□□□□□ -1.33
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.67	□□□□□ -1.34
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
DDR1-255	ENST00000504927	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.6	□□□□□ -1.35
DDR1-255	ENST00000504927	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.57	□□□□□ -1.36
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.47	□□□□□ -1.37
DDR1-255	ENST00000504927	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.44	□□□□□ -1.38
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.41	□□□□□ -1.38
DDR1-255	ENST00000504927	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.39	□□□□□ -1.39
DDR1-255	ENST00000504927	PMAIP1	Q13794	54 aa		6.37	□□□□□ -1.39
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.35	□□□□□ -1.39
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.32	□□□□□ -1.4
DDR1-255	ENST00000504927	MT1A	P04731	61 aa		6.29	□□□□□ -1.4
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.22	□□□□□ -1.41
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.2	□□□□□ -1.42
DDR1-255	ENST00000504927	PRO0628	Q9UI54	55 aa		6.08	□□□□□ -1.44
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.07	□□□□□ -1.44
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.06	□□□□□ -1.44
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		6	□□□□□ -1.45
DDR1-255	ENST00000504927	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.99	□□□□□ -1.45
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.89	□□□□□ -1.47
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.81	□□□□□ -1.48
DDR1-255	ENST00000504927	MT3	P25713	68 aa		5.78	□□□□□ -1.48
DDR1-255	ENST00000504927	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DDR1-255	ENST00000504927	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.75	□□□□□ -1.49
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.64	□□□□□ -1.51
DDR1-255	ENST00000504927	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.61	□□□□□ -1.51
DDR1-255	ENST00000504927	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.4	□□□□□ -1.55
DDR1-255	ENST00000504927	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
DDR1-255	ENST00000504927	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.36	□□□□□ -1.55
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.35	□□□□□ -1.55
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.28	□□□□□ -1.56
DDR1-255	ENST00000504927	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.25	□□□□□ -1.57
DDR1-255	ENST00000504927	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5.14	□□□□□ -1.59
DDR1-255	ENST00000504927	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DDR1-255	ENST00000504927	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDR1-255	ENST00000504927	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DDR1-255	ENST00000504927	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.7
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.4	□□□□□ -1.71
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.36	□□□□□ -1.71
DDR1-255	ENST00000504927	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.26	□□□□□ -1.73
DDR1-255	ENST00000504927	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.23	□□□□□ -1.73
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.1	□□□□□ -1.75
DDR1-255	ENST00000504927		H3BS24	57 aa		3.95	□□□□□ -1.78
DDR1-255	ENST00000504927		A0A0A0MQY5	61 aa		3.82	□□□□□ -1.8
DDR1-255	ENST00000504927	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.76	□□□□□ -1.81
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.72	□□□□□ -1.81
DDR1-255	ENST00000504927	PRM1	P04553	51 aa		3.63	□□□□□ -1.83
DDR1-255	ENST00000504927	INE1	O15225	51 aa		3.54	□□□□□ -1.84
DDR1-255	ENST00000504927	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.46	□□□□□ -1.86
DDR1-255	ENST00000504927	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.75	□□□□□ -1.97
DDR1-255	ENST00000504927	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.5	□□□□□ -2.01

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 102 ms