RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 SPRR2FQ96RM1 72 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa9.12□□□□□ -0.95
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HOXB3-212ENST00000498678 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa9.03□□□□□ -0.96
HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa9.02□□□□□ -0.97
HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP5-9P26371 169 aa9□□□□□ -0.97
HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
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HOXB3-212ENST00000498678 MT1MQ8N339 61 aa8.86□□□□□ -0.99
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HOXB3-212ENST00000498678 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.47□□□□□ -1.05
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HOXB3-212ENST00000498678 SPRR2DP22532 72 aa8.31□□□□□ -1.08
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HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.2□□□□□ -1.1
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HOXB3-212ENST00000498678 LCE3BQ5TA77 95 aa7.98□□□□□ -1.13
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HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.49□□□□□ -1.21
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HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa7.17□□□□□ -1.26
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HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXB3-212ENST00000498678 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.74□□□□□ -1.33
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HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.1□□□□□ -1.43
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HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.94□□□□□ -1.46
HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP5-8O75690 187 aa5.87□□□□□ -1.47
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HOXB3-212ENST00000498678 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.79□□□□□ -1.48
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HOXB3-212ENST00000498678 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.36□□□□□ -1.55
HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.23□□□□□ -1.57
HOXB3-212ENST00000498678 LCE1FQ5T754 118 aa5.22□□□□□ -1.57
HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXB3-212ENST00000498678 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.77□□□□□ -1.65
HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.56□□□□□ -1.68
HOXB3-212ENST00000498678 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
HOXB3-212ENST00000498678 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.46□□□□□ -1.7
HOXB3-212ENST00000498678 PHGR1C9JFL3 82 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXB3-212ENST00000498678 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.88□□□□□ -1.79
HOXB3-212ENST00000498678 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.82□□□□□ -1.96
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