RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.37□□□□□ -1.39
SYP-208ENST00000494396 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SYP-208ENST00000494396 SSPOA2VEC9 5147 aa6.23□□□□□ -1.41
SYP-208ENST00000494396 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.21□□□□□ -1.41
SYP-208ENST00000494396 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.15□□□□□ -1.42
SYP-208ENST00000494396 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.13□□□□□ -1.43
SYP-208ENST00000494396 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.02□□□□□ -1.45
SYP-208ENST00000494396 KMT2DO14686 5537 aa6□□□□□ -1.45
SYP-208ENST00000494396 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6□□□□□ -1.45
SYP-208ENST00000494396 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SYP-208ENST00000494396 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.92□□□□□ -1.46
SYP-208ENST00000494396 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.92□□□□□ -1.46
SYP-208ENST00000494396 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.92□□□□□ -1.46
SYP-208ENST00000494396 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.85□□□□□ -1.47
SYP-208ENST00000494396 LCE4AQ5TA78 99 aa5.82□□□□□ -1.48
SYP-208ENST00000494396 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.81□□□□□ -1.48
SYP-208ENST00000494396 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.8□□□□□ -1.48
SYP-208ENST00000494396 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.77□□□□□ -1.49
SYP-208ENST00000494396 MT1EP04732 61 aa5.73□□□□□ -1.49
SYP-208ENST00000494396 MT1LQ93083 61 aa5.65□□□□□ -1.5
SYP-208ENST00000494396 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
SYP-208ENST00000494396 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.55□□□□□ -1.52
SYP-208ENST00000494396 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.51□□□□□ -1.53
SYP-208ENST00000494396 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.49□□□□□ -1.53
SYP-208ENST00000494396 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.49□□□□□ -1.53
SYP-208ENST00000494396 MT1GP13640 62 aa5.46□□□□□ -1.54
SYP-208ENST00000494396 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
SYP-208ENST00000494396 KRTAP5-9P26371 169 aa5.43□□□□□ -1.54
SYP-208ENST00000494396 MT1MQ8N339 61 aa5.39□□□□□ -1.55
SYP-208ENST00000494396 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.32□□□□□ -1.56
SYP-208ENST00000494396 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.28□□□□□ -1.56
SYP-208ENST00000494396 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.28□□□□□ -1.56
SYP-208ENST00000494396 MDN1Q9NU22 5596 aa5.26□□□□□ -1.57
SYP-208ENST00000494396 KRTAP12-4P60329 112 aa5.24□□□□□ -1.57
SYP-208ENST00000494396 SPRR2EP22531 72 aa5.23□□□□□ -1.57
SYP-208ENST00000494396 SPRR2BP35325 72 aa5.23□□□□□ -1.57
SYP-208ENST00000494396 SPRR2AP35326 72 aa5.23□□□□□ -1.57
SYP-208ENST00000494396 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SYP-208ENST00000494396 SPRR2DP22532 72 aa5.03□□□□□ -1.6
SYP-208ENST00000494396 MT1AP04731 61 aa5□□□□□ -1.61
SYP-208ENST00000494396 NEBP20929 6669 aa4.88□□□□□ -1.63
SYP-208ENST00000494396 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SYP-208ENST00000494396 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.79□□□□□ -1.64
SYP-208ENST00000494396 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.78□□□□□ -1.64
SYP-208ENST00000494396 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.77□□□□□ -1.65
SYP-208ENST00000494396 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
SYP-208ENST00000494396 PRM1P04553 51 aa4.65□□□□□ -1.67
SYP-208ENST00000494396 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SYP-208ENST00000494396 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.56□□□□□ -1.68
SYP-208ENST00000494396 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.5□□□□□ -1.69
SYP-208ENST00000494396 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.47□□□□□ -1.69
SYP-208ENST00000494396 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.4□□□□□ -1.71
SYP-208ENST00000494396 MT4P47944 62 aa4.37□□□□□ -1.71
SYP-208ENST00000494396 MT3P25713 68 aa4.34□□□□□ -1.71
SYP-208ENST00000494396 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.29□□□□□ -1.72
SYP-208ENST00000494396 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.27□□□□□ -1.73
SYP-208ENST00000494396 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.25□□□□□ -1.73
SYP-208ENST00000494396 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.16□□□□□ -1.74
SYP-208ENST00000494396 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.02□□□□□ -1.77
SYP-208ENST00000494396 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.96□□□□□ -1.78
SYP-208ENST00000494396 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.94□□□□□ -1.78
SYP-208ENST00000494396 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.85□□□□□ -1.79
SYP-208ENST00000494396 LCE1FQ5T754 118 aa3.77□□□□□ -1.81
SYP-208ENST00000494396 LCE1EQ5T753 118 aa3.74□□□□□ -1.81
SYP-208ENST00000494396 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.67□□□□□ -1.82
SYP-208ENST00000494396 MUC5ACP98088 5654 aa3.55□□□□□ -1.84
SYP-208ENST00000494396 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.53□□□□□ -1.84
SYP-208ENST00000494396 KRTAP5-8O75690 187 aa3.52□□□□□ -1.85
SYP-208ENST00000494396 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.51□□□□□ -1.85
SYP-208ENST00000494396 LCE1CQ5T751 118 aa3.48□□□□□ -1.85
SYP-208ENST00000494396 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.43□□□□□ -1.86
SYP-208ENST00000494396 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.12□□□□□ -1.91
SYP-208ENST00000494396 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.06□□□□□ -1.92
SYP-208ENST00000494396 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SYP-208ENST00000494396 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
SYP-208ENST00000494396 PHGR1C9JFL3 82 aa2.63□□□□□ -1.99
SYP-208ENST00000494396 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.5□□□□□ -2.01
SYP-208ENST00000494396 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.72□□□□□ -2.13
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