RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492979.2

SSC4D-202, Transcript of scavenger receptor cysteine rich family member with 4 domains, humanhuman

TSL 5

Gene SSC4D, Length 1,224 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4D-202ENST00000492979 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.8□□□□□ -1.32
SSC4D-202ENST00000492979 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.8□□□□□ -1.32
SSC4D-202ENST00000492979 TNP1P09430 55 aa6.79□□□□□ -1.32
SSC4D-202ENST00000492979 PP632Q6XCG6 107 aa6.78□□□□□ -1.32
SSC4D-202ENST00000492979 A6NED7 52 aa6.76□□□□□ -1.33
SSC4D-202ENST00000492979 MT1LQ93083 61 aa6.73□□□□□ -1.33
SSC4D-202ENST00000492979 LCE3AQ5TA76 89 aa6.7□□□□□ -1.34
SSC4D-202ENST00000492979 MT1MQ8N339 61 aa6.69□□□□□ -1.34
SSC4D-202ENST00000492979 LCE4AQ5TA78 99 aa6.56□□□□□ -1.36
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.56□□□□□ -1.36
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.55□□□□□ -1.36
SSC4D-202ENST00000492979 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.54□□□□□ -1.36
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP12-3P60328 96 aa6.49□□□□□ -1.37
SSC4D-202ENST00000492979 LCE1DQ5T752 114 aa6.48□□□□□ -1.37
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.48□□□□□ -1.37
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.43□□□□□ -1.38
SSC4D-202ENST00000492979 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.39□□□□□ -1.39
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.38□□□□□ -1.39
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.38□□□□□ -1.39
SSC4D-202ENST00000492979 ROMO1P60602 79 aa6.35□□□□□ -1.39
SSC4D-202ENST00000492979 MT4P47944 62 aa6.32□□□□□ -1.4
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.29□□□□□ -1.4
SSC4D-202ENST00000492979 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.25□□□□□ -1.41
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.21□□□□□ -1.42
SSC4D-202ENST00000492979 BRK1Q8WUW1 75 aa6.15□□□□□ -1.42
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.1□□□□□ -1.43
SSC4D-202ENST00000492979 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.09□□□□□ -1.43
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.09□□□□□ -1.43
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.04□□□□□ -1.44
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP12-4P60329 112 aa6□□□□□ -1.45
SSC4D-202ENST00000492979 LCE3CQ5T5A8 94 aa6□□□□□ -1.45
SSC4D-202ENST00000492979 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.96□□□□□ -1.46
SSC4D-202ENST00000492979 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.92□□□□□ -1.46
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.9□□□□□ -1.46
SSC4D-202ENST00000492979 PMAIP1Q13794 54 aa5.85□□□□□ -1.47
SSC4D-202ENST00000492979 MT1AP04731 61 aa5.74□□□□□ -1.49
SSC4D-202ENST00000492979 PRO0628Q9UI54 55 aa5.69□□□□□ -1.5
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.67□□□□□ -1.5
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.66□□□□□ -1.5
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.63□□□□□ -1.51
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.56□□□□□ -1.52
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.52□□□□□ -1.53
SSC4D-202ENST00000492979 PRAC1Q96KF2 57 aa5.41□□□□□ -1.54
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.39□□□□□ -1.55
SSC4D-202ENST00000492979 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.36□□□□□ -1.55
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP5-8O75690 187 aa5.34□□□□□ -1.55
SSC4D-202ENST00000492979 MT3P25713 68 aa5.27□□□□□ -1.57
SSC4D-202ENST00000492979 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.26□□□□□ -1.57
SSC4D-202ENST00000492979 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SSC4D-202ENST00000492979 MUC5ACP98088 5654 aa5.18□□□□□ -1.58
SSC4D-202ENST00000492979 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.07□□□□□ -1.6
SSC4D-202ENST00000492979 SVIPQ8NHG7 77 aa5.06□□□□□ -1.6
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.03□□□□□ -1.6
SSC4D-202ENST00000492979 LCE1EQ5T753 118 aa4.92□□□□□ -1.62
SSC4D-202ENST00000492979 LUZP6Q538Z0 58 aa4.72□□□□□ -1.65
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.57□□□□□ -1.68
SSC4D-202ENST00000492979 LCE1CQ5T751 118 aa4.55□□□□□ -1.68
SSC4D-202ENST00000492979 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.55□□□□□ -1.68
SSC4D-202ENST00000492979 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.32□□□□□ -1.72
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
SSC4D-202ENST00000492979 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.11□□□□□ -1.75
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.11□□□□□ -1.75
SSC4D-202ENST00000492979 LCE1FQ5T754 118 aa4.05□□□□□ -1.76
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4□□□□□ -1.77
SSC4D-202ENST00000492979 NDUFAF8A1L188 74 aa3.98□□□□□ -1.77
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.78□□□□□ -1.8
SSC4D-202ENST00000492979 PHGR1C9JFL3 82 aa3.58□□□□□ -1.84
SSC4D-202ENST00000492979 A0A0A0MQY5 61 aa3.43□□□□□ -1.86
SSC4D-202ENST00000492979 INE1O15225 51 aa3.37□□□□□ -1.87
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.31□□□□□ -1.88
SSC4D-202ENST00000492979 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.24□□□□□ -1.89
SSC4D-202ENST00000492979 PRM1P04553 51 aa3.21□□□□□ -1.9
SSC4D-202ENST00000492979 H3BS24 57 aa3.13□□□□□ -1.91
SSC4D-202ENST00000492979 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.7□□□□□ -1.98
SSC4D-202ENST00000492979 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.29□□□□□ -2.04
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