RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491712.2

SPTAN1-208, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-208	ENST00000491712	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPTAN1-208	ENST00000491712	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPTAN1-208	ENST00000491712	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPTAN1-208	ENST00000491712	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPTAN1-208	ENST00000491712	UQCR11	O14957	56 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPTAN1-208	ENST00000491712	MT4	P47944	62 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPTAN1-208	ENST00000491712	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SPTAN1-208	ENST00000491712		V9GYY9	64 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPTAN1-208	ENST00000491712		Q1T7F1	81 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SPTAN1-208	ENST00000491712		K7ERS5	55 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SPTAN1-208	ENST00000491712	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SPTAN1-208	ENST00000491712	PSPHP1	O15172	72 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SPTAN1-208	ENST00000491712	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.46	□□□□□ -1.7
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.43	□□□□□ -1.7
SPTAN1-208	ENST00000491712		A6NED7	52 aa		4.42	□□□□□ -1.7
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SPTAN1-208	ENST00000491712	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.3	□□□□□ -1.72
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.3	□□□□□ -1.72
SPTAN1-208	ENST00000491712	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SPTAN1-208	ENST00000491712	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.27	□□□□□ -1.73
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.26	□□□□□ -1.73
SPTAN1-208	ENST00000491712	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.24	□□□□□ -1.73
SPTAN1-208	ENST00000491712	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPTAN1-208	ENST00000491712	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.19	□□□□□ -1.74
SPTAN1-208	ENST00000491712	ROMO1	P60602	79 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SPTAN1-208	ENST00000491712	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SPTAN1-208	ENST00000491712	MT1A	P04731	61 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SPTAN1-208	ENST00000491712	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.03	□□□□□ -1.76
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4	□□□□□ -1.77
SPTAN1-208	ENST00000491712	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.95	□□□□□ -1.78
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.92	□□□□□ -1.78
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.88	□□□□□ -1.79
SPTAN1-208	ENST00000491712	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.86	□□□□□ -1.79
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SPTAN1-208	ENST00000491712	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.83	□□□□□ -1.8
SPTAN1-208	ENST00000491712	MT3	P25713	68 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SPTAN1-208	ENST00000491712		H3BS24	57 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SPTAN1-208	ENST00000491712	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.72	□□□□□ -1.81
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-208	ENST00000491712	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.71	□□□□□ -1.82
SPTAN1-208	ENST00000491712	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SPTAN1-208	ENST00000491712	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SPTAN1-208	ENST00000491712	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.47	□□□□□ -1.85
SPTAN1-208	ENST00000491712	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.26	□□□□□ -1.89
SPTAN1-208	ENST00000491712		A0A0A0MQY5	61 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SPTAN1-208	ENST00000491712	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SPTAN1-208	ENST00000491712	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SPTAN1-208	ENST00000491712	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.04	□□□□□ -1.92
SPTAN1-208	ENST00000491712	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.91	□□□□□ -1.94
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
SPTAN1-208	ENST00000491712	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SPTAN1-208	ENST00000491712	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SPTAN1-208	ENST00000491712	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.6	□□□□□ -1.99
SPTAN1-208	ENST00000491712	INE1	O15225	51 aa		2.51	□□□□□ -2.01
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.42	□□□□□ -2.02
SPTAN1-208	ENST00000491712	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.32	□□□□□ -2.04
SPTAN1-208	ENST00000491712	PRM1	P04553	51 aa		2.12	□□□□□ -2.07
SPTAN1-208	ENST00000491712	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2	□□□□□ -2.09
SPTAN1-208	ENST00000491712	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.58	□□□□□ -2.16

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.3 ms