RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490088.2

HOXD10-202, Transcript of homeobox D10, humanhuman

TSL 2

Gene HOXD10, Length 1,010 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP12-3P60328 96 aa7.79□□□□□ -1.16
HOXD10-202ENST00000490088 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.74□□□□□ -1.17
HOXD10-202ENST00000490088 MT1LQ93083 61 aa7.73□□□□□ -1.17
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.72□□□□□ -1.17
HOXD10-202ENST00000490088 MT1GP13640 62 aa7.66□□□□□ -1.18
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXD10-202ENST00000490088 PP632Q6XCG6 107 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.64□□□□□ -1.19
HOXD10-202ENST00000490088 PMAIP1Q13794 54 aa7.56□□□□□ -1.2
HOXD10-202ENST00000490088 MT1MQ8N339 61 aa7.56□□□□□ -1.2
HOXD10-202ENST00000490088 LCE3BQ5TA77 95 aa7.54□□□□□ -1.2
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.46□□□□□ -1.22
HOXD10-202ENST00000490088 PRO0628Q9UI54 55 aa7.45□□□□□ -1.22
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.43□□□□□ -1.22
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.43□□□□□ -1.22
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.41□□□□□ -1.22
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.41□□□□□ -1.22
HOXD10-202ENST00000490088 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXD10-202ENST00000490088 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXD10-202ENST00000490088 PRAC1Q96KF2 57 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXD10-202ENST00000490088 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.01□□□□□ -1.29
HOXD10-202ENST00000490088 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXD10-202ENST00000490088 LCE4AQ5TA78 99 aa6.9□□□□□ -1.3
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.89□□□□□ -1.31
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.88□□□□□ -1.31
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.83□□□□□ -1.32
HOXD10-202ENST00000490088 MT4P47944 62 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD10-202ENST00000490088 LCE1DQ5T752 114 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXD10-202ENST00000490088 SVIPQ8NHG7 77 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXD10-202ENST00000490088 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXD10-202ENST00000490088 MT1AP04731 61 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP12-4P60329 112 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXD10-202ENST00000490088 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
HOXD10-202ENST00000490088 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.25□□□□□ -1.41
HOXD10-202ENST00000490088 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.14□□□□□ -1.43
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.12□□□□□ -1.43
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.12□□□□□ -1.43
HOXD10-202ENST00000490088 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.01□□□□□ -1.45
HOXD10-202ENST00000490088 MT3P25713 68 aa5.98□□□□□ -1.45
HOXD10-202ENST00000490088 LUZP6Q538Z0 58 aa5.93□□□□□ -1.46
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.76□□□□□ -1.49
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.68□□□□□ -1.5
HOXD10-202ENST00000490088 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.59□□□□□ -1.52
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP5-8O75690 187 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.4□□□□□ -1.54
HOXD10-202ENST00000490088 LCE1EQ5T753 118 aa5.33□□□□□ -1.56
HOXD10-202ENST00000490088 NDUFAF8A1L188 74 aa5.32□□□□□ -1.56
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HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.17□□□□□ -1.58
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HOXD10-202ENST00000490088 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.04□□□□□ -1.6
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.03□□□□□ -1.6
HOXD10-202ENST00000490088 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
HOXD10-202ENST00000490088 LCE1CQ5T751 118 aa4.96□□□□□ -1.62
HOXD10-202ENST00000490088 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
HOXD10-202ENST00000490088 H3BS24 57 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
HOXD10-202ENST00000490088 A0A0A0MQY5 61 aa4.45□□□□□ -1.7
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.45□□□□□ -1.7
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXD10-202ENST00000490088 INE1O15225 51 aa4.33□□□□□ -1.72
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.27□□□□□ -1.73
HOXD10-202ENST00000490088 LCE1FQ5T754 118 aa4.17□□□□□ -1.74
HOXD10-202ENST00000490088 PRM1P04553 51 aa4.15□□□□□ -1.75
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.87□□□□□ -1.79
HOXD10-202ENST00000490088 PHGR1C9JFL3 82 aa3.83□□□□□ -1.8
HOXD10-202ENST00000490088 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.39□□□□□ -1.87
HOXD10-202ENST00000490088 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.61□□□□□ -1.99
HOXD10-202ENST00000490088 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.47□□□□□ -2.01
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