RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa0.92□□□□□ -2.26
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RABGGTB-211ENST00000489450 K7EQZ3 153 aa0.92□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 KLKP1Q107X0 134 aa0.92□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 PMAIP1Q13794 54 aa0.92□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 SERP2Q8N6R1 65 aa0.92□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV7A0A075B6U4 112 aa0.91□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV22A0A0B4J277 110 aa0.91□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa0.91□□□□□ -2.26
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RABGGTB-211ENST00000489450 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GV72 72 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-211ENST00000489450 COX7CP15954 63 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-211ENST00000489450 C7orf65Q6ZTY9 151 aa0.9□□□□□ -2.27
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RABGGTB-211ENST00000489450 H0Y9P7 68 aa0.87□□□□□ -2.27
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RABGGTB-211ENST00000489450 Q5VV11 94 aa0.86□□□□□ -2.27
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RABGGTB-211ENST00000489450 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa0.85□□□□□ -2.27
RABGGTB-211ENST00000489450 C20orf197Q8N268 126 aa0.85□□□□□ -2.27
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.84□□□□□ -2.27
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RABGGTB-211ENST00000489450 SERP1Q9Y6X1 66 aa0.84□□□□□ -2.27
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC179H3BU77 68 aa0.83□□□□□ -2.28
RABGGTB-211ENST00000489450 CSAG1Q6PB30 78 aa0.83□□□□□ -2.28
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RABGGTB-211ENST00000489450 PRR15LQ9BU68 103 aa0.82□□□□□ -2.28
RABGGTB-211ENST00000489450 S4R3F8 94 aa0.82□□□□□ -2.28
RABGGTB-211ENST00000489450 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa0.81□□□□□ -2.28
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RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa0.81□□□□□ -2.28
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RABGGTB-211ENST00000489450 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa0.81□□□□□ -2.28
RABGGTB-211ENST00000489450 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC01554Q52M75 96 aa0.8□□□□□ -2.28
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.8□□□□□ -2.28
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RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GU69 56 aa0.78□□□□□ -2.28
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RABGGTB-211ENST00000489450 MIR22HGQ0VDD5 57 aa0.74□□□□□ -2.29
RABGGTB-211ENST00000489450 MT1LQ93083 61 aa0.74□□□□□ -2.29
RABGGTB-211ENST00000489450 MT1GP13640 62 aa0.72□□□□□ -2.29
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.72□□□□□ -2.29
RABGGTB-211ENST00000489450 PLAC4Q8WY50 150 aa0.72□□□□□ -2.29
RABGGTB-211ENST00000489450 ROMO1P60602 79 aa0.71□□□□□ -2.3
RABGGTB-211ENST00000489450 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.71□□□□□ -2.3
RABGGTB-211ENST00000489450 TNP1P09430 55 aa0.7□□□□□ -2.3
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0D9SG42 100 aa0.67□□□□□ -2.3
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.66□□□□□ -2.3
RABGGTB-211ENST00000489450 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.65□□□□□ -2.31
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.63□□□□□ -2.31
RABGGTB-211ENST00000489450 MT1AP04731 61 aa0.6□□□□□ -2.31
RABGGTB-211ENST00000489450 INE1O15225 51 aa0.58□□□□□ -2.32
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.57□□□□□ -2.32
RABGGTB-211ENST00000489450 PRM1P04553 51 aa0.32□□□□□ -2.36
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.3 ms