RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 TNP1P09430 55 aa7.67□□□□□ -1.18
POLR2F-211ENST00000488684 A0A1B0GU69 56 aa7.66□□□□□ -1.18
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.59□□□□□ -1.19
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP12-3P60328 96 aa7.47□□□□□ -1.21
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.43□□□□□ -1.22
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.41□□□□□ -1.22
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.38□□□□□ -1.23
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
POLR2F-211ENST00000488684 PRR15LQ9BU68 103 aa7.3□□□□□ -1.24
POLR2F-211ENST00000488684 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.29□□□□□ -1.24
POLR2F-211ENST00000488684 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
POLR2F-211ENST00000488684 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.23□□□□□ -1.25
POLR2F-211ENST00000488684 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP12-4P60329 112 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR2F-211ENST00000488684 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.21□□□□□ -1.26
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC179H3BU77 68 aa7.16□□□□□ -1.26
POLR2F-211ENST00000488684 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
POLR2F-211ENST00000488684 UQCR11O14957 56 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.08□□□□□ -1.28
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.98□□□□□ -1.29
POLR2F-211ENST00000488684 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.9□□□□□ -1.3
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.87□□□□□ -1.31
POLR2F-211ENST00000488684 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.86□□□□□ -1.31
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.82□□□□□ -1.32
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM258P61165 79 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR2F-211ENST00000488684 K7ERS5 55 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR2F-211ENST00000488684 MT1AP04731 61 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP5-8O75690 187 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR2F-211ENST00000488684 PSPHP1O15172 72 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR2F-211ENST00000488684 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR2F-211ENST00000488684 V9GYY9 64 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR2F-211ENST00000488684 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
POLR2F-211ENST00000488684 Q1T7F1 81 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR2F-211ENST00000488684 MUC5ACP98088 5654 aa6.48□□□□□ -1.37
POLR2F-211ENST00000488684 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
POLR2F-211ENST00000488684 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.4□□□□□ -1.38
POLR2F-211ENST00000488684 PCP4P48539 62 aa6.39□□□□□ -1.39
POLR2F-211ENST00000488684 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
POLR2F-211ENST00000488684 A6NED7 52 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR2F-211ENST00000488684 ROMO1P60602 79 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR2F-211ENST00000488684 MT3P25713 68 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.15□□□□□ -1.42
POLR2F-211ENST00000488684 LCE1EQ5T753 118 aa5.74□□□□□ -1.49
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.49□□□□□ -1.53
POLR2F-211ENST00000488684 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.45□□□□□ -1.54
POLR2F-211ENST00000488684 BRK1Q8WUW1 75 aa5.41□□□□□ -1.54
POLR2F-211ENST00000488684 LCE1CQ5T751 118 aa5.34□□□□□ -1.55
POLR2F-211ENST00000488684 PMAIP1Q13794 54 aa5.15□□□□□ -1.59
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR2F-211ENST00000488684 PRO0628Q9UI54 55 aa5.11□□□□□ -1.59
POLR2F-211ENST00000488684 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.87□□□□□ -1.63
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.86□□□□□ -1.63
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
POLR2F-211ENST00000488684 LCE1FQ5T754 118 aa4.79□□□□□ -1.64
POLR2F-211ENST00000488684 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.78□□□□□ -1.64
POLR2F-211ENST00000488684 PRAC1Q96KF2 57 aa4.74□□□□□ -1.65
POLR2F-211ENST00000488684 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.52□□□□□ -1.69
POLR2F-211ENST00000488684 SVIPQ8NHG7 77 aa4.51□□□□□ -1.69
POLR2F-211ENST00000488684 PHGR1C9JFL3 82 aa4.47□□□□□ -1.69
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.47□□□□□ -1.69
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.15□□□□□ -1.75
POLR2F-211ENST00000488684 LUZP6Q538Z0 58 aa4.13□□□□□ -1.75
POLR2F-211ENST00000488684 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.06□□□□□ -1.76
POLR2F-211ENST00000488684 NDUFAF8A1L188 74 aa3.59□□□□□ -1.83
POLR2F-211ENST00000488684 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.38□□□□□ -1.87
POLR2F-211ENST00000488684 PRM1P04553 51 aa3.22□□□□□ -1.89
POLR2F-211ENST00000488684 A0A0A0MQY5 61 aa3.16□□□□□ -1.9
POLR2F-211ENST00000488684 INE1O15225 51 aa3.06□□□□□ -1.92
POLR2F-211ENST00000488684 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.83□□□□□ -1.96
POLR2F-211ENST00000488684 H3BS24 57 aa2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.3 ms