RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 FAT1Q14517 4588 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-210ENST00000485459 M0QZ58 72 aa1.78□□□□□ -2.12
RABGGTB-210ENST00000485459 RPS29P62273 56 aaKnown RBP1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-210ENST00000485459 HMCN2Q8NDA2 5059 aa1.77□□□□□ -2.13
RABGGTB-210ENST00000485459 FAT3Q8TDW7 4589 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-210ENST00000485459 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa1.74□□□□□ -2.13
RABGGTB-210ENST00000485459 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa1.72□□□□□ -2.13
RABGGTB-210ENST00000485459 CRCT1Q9UGL9 99 aa1.72□□□□□ -2.13
RABGGTB-210ENST00000485459 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP1.71□□□□□ -2.14
RABGGTB-210ENST00000485459 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.7□□□□□ -2.14
RABGGTB-210ENST00000485459 FAT4Q6V0I7 4981 aa1.69□□□□□ -2.14
RABGGTB-210ENST00000485459 FSIP2Q5CZC0 6907 aa1.68□□□□□ -2.14
RABGGTB-210ENST00000485459 TNXBP22105 4242 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-210ENST00000485459 Q5VSD8 79 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF213Q63HN8 5207 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-210ENST00000485459 LRP2P98164 4655 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-210ENST00000485459 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-210ENST00000485459 NEBP20929 6669 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-210ENST00000485459 LPAP08519 4548 aa1.6□□□□□ -2.15
RABGGTB-210ENST00000485459 TNP1P09430 55 aa1.6□□□□□ -2.15
RABGGTB-210ENST00000485459 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP1.59□□□□□ -2.15
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.59□□□□□ -2.15
RABGGTB-210ENST00000485459 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-210ENST00000485459 SSPOA2VEC9 5147 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-210ENST00000485459 MUC17Q685J3 4493 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-210ENST00000485459 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-210ENST00000485459 MT1HL1P0DM35 61 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-210ENST00000485459 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.48□□□□□ -2.17
RABGGTB-210ENST00000485459 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-210ENST00000485459 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.44□□□□□ -2.18
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa1.43□□□□□ -2.18
RABGGTB-210ENST00000485459 KMT2DO14686 5537 aa1.4□□□□□ -2.19
RABGGTB-210ENST00000485459 USH2AO75445 5202 aa1.36□□□□□ -2.19
RABGGTB-210ENST00000485459 M0R2T5 61 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-210ENST00000485459 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-210ENST00000485459 SPRR2GQ9BYE4 73 aa1.33□□□□□ -2.2
RABGGTB-210ENST00000485459 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.3□□□□□ -2.2
RABGGTB-210ENST00000485459 MT1HP80294 61 aa1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-210ENST00000485459 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RABGGTB-210ENST00000485459 MT1XP80297 61 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa1.26□□□□□ -2.21
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa1.25□□□□□ -2.21
RABGGTB-210ENST00000485459 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
RABGGTB-210ENST00000485459 MT1BP07438 61 aa1.21□□□□□ -2.22
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.2□□□□□ -2.22
RABGGTB-210ENST00000485459 MT2AP02795 61 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-210ENST00000485459 MT1FP04733 61 aa1.19□□□□□ -2.22
RABGGTB-210ENST00000485459 MDN1Q9NU22 5596 aa1.18□□□□□ -2.22
RABGGTB-210ENST00000485459 PRM1P04553 51 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 MUC5ACP98088 5654 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 SPRR2EP22531 72 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 SPRR2BP35325 72 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 SPRR2AP35326 72 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 MT1LQ93083 61 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa1.11□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 MT1AP04731 61 aa1.09□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 MT1EP04732 61 aa1.09□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 SPRR2DP22532 72 aa1.09□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 SPRR2FQ96RM1 72 aa1.09□□□□□ -2.23
RABGGTB-210ENST00000485459 MT1GP13640 62 aa1.07□□□□□ -2.24
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-210ENST00000485459 MT4P47944 62 aa0.99□□□□□ -2.25
RABGGTB-210ENST00000485459 MT1MQ8N339 61 aa0.99□□□□□ -2.25
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.94□□□□□ -2.26
RABGGTB-210ENST00000485459 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.89□□□□□ -2.27
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa0.81□□□□□ -2.28
RABGGTB-210ENST00000485459 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.8□□□□□ -2.28
RABGGTB-210ENST00000485459 PHGR1C9JFL3 82 aa0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms