RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 MT1LQ93083 61 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRN-215ENST00000484986 PCP4P48539 62 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRN-215ENST00000484986 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRN-215ENST00000484986 UQCR11O14957 56 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRN-215ENST00000484986 V9GYY9 64 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRN-215ENST00000484986 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRN-215ENST00000484986 PSPHP1O15172 72 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRN-215ENST00000484986 Q1T7F1 81 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRN-215ENST00000484986 TNP1P09430 55 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRN-215ENST00000484986 LCE3AQ5TA76 89 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRN-215ENST00000484986 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRN-215ENST00000484986 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PTPRN-215ENST00000484986 K7ERS5 55 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRN-215ENST00000484986 A6NED7 52 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP12-3P60328 96 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRN-215ENST00000484986 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP12-4P60329 112 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRN-215ENST00000484986 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRN-215ENST00000484986 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRN-215ENST00000484986 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRN-215ENST00000484986 ROMO1P60602 79 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRN-215ENST00000484986 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRN-215ENST00000484986 BRK1Q8WUW1 75 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRN-215ENST00000484986 MT1AP04731 61 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRN-215ENST00000484986 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP5-8O75690 187 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRN-215ENST00000484986 MUC5ACP98088 5654 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRN-215ENST00000484986 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRN-215ENST00000484986 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRN-215ENST00000484986 PMAIP1Q13794 54 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRN-215ENST00000484986 MT3P25713 68 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRN-215ENST00000484986 PRO0628Q9UI54 55 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRN-215ENST00000484986 PRAC1Q96KF2 57 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRN-215ENST00000484986 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRN-215ENST00000484986 LCE1EQ5T753 118 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRN-215ENST00000484986 SVIPQ8NHG7 77 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRN-215ENST00000484986 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRN-215ENST00000484986 LCE1CQ5T751 118 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRN-215ENST00000484986 LUZP6Q538Z0 58 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5□□□□□ -1.61
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRN-215ENST00000484986 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRN-215ENST00000484986 LCE1FQ5T754 118 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRN-215ENST00000484986 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRN-215ENST00000484986 PHGR1C9JFL3 82 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRN-215ENST00000484986 NDUFAF8A1L188 74 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRN-215ENST00000484986 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRN-215ENST00000484986 A0A0A0MQY5 61 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRN-215ENST00000484986 PRM1P04553 51 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRN-215ENST00000484986 INE1O15225 51 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRN-215ENST00000484986 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRN-215ENST00000484986 H3BS24 57 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRN-215ENST00000484986 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.77□□□□□ -1.97
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