RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481414.5

KCNS3-205, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, human

TSL 4

Gene KCNS3, Length 560 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP12-3	P60328	96 aa		8.79	□□□□□ -1
KCNS3-205	ENST00000481414	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		8.78	□□□□□ -1
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		8.75	□□□□□ -1.01
KCNS3-205	ENST00000481414	MT1L	Q93083	61 aa		8.72	□□□□□ -1.01
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		8.7	□□□□□ -1.02
KCNS3-205	ENST00000481414	MT1G	P13640	62 aa		8.7	□□□□□ -1.02
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		8.7	□□□□□ -1.02
KCNS3-205	ENST00000481414	PP632	Q6XCG6	107 aa		8.65	□□□□□ -1.02
KCNS3-205	ENST00000481414	MT1M	Q8N339	61 aa		8.53	□□□□□ -1.04
KCNS3-205	ENST00000481414	LCE3B	Q5TA77	95 aa		8.52	□□□□□ -1.05
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		8.47	□□□□□ -1.05
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		8.47	□□□□□ -1.05
KCNS3-205	ENST00000481414	PMAIP1	Q13794	54 aa		8.44	□□□□□ -1.06
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		8.42	□□□□□ -1.06
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		8.39	□□□□□ -1.07
KCNS3-205	ENST00000481414	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	8.35	□□□□□ -1.07
KCNS3-205	ENST00000481414	PRO0628	Q9UI54	55 aa		8.33	□□□□□ -1.08
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		8.29	□□□□□ -1.08
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		8.29	□□□□□ -1.08
KCNS3-205	ENST00000481414	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		8.15	□□□□□ -1.1
KCNS3-205	ENST00000481414	PRAC1	Q96KF2	57 aa		7.96	□□□□□ -1.14
KCNS3-205	ENST00000481414	LCE4A	Q5TA78	99 aa		7.85	□□□□□ -1.15
KCNS3-205	ENST00000481414	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.82	□□□□□ -1.16
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		7.82	□□□□□ -1.16
KCNS3-205	ENST00000481414	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		7.82	□□□□□ -1.16
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	7.79	□□□□□ -1.16
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		7.75	□□□□□ -1.17
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		7.67	□□□□□ -1.18
KCNS3-205	ENST00000481414	LCE1D	Q5T752	114 aa		7.66	□□□□□ -1.18
KCNS3-205	ENST00000481414	MT4	P47944	62 aa		7.63	□□□□□ -1.19
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		7.51	□□□□□ -1.21
KCNS3-205	ENST00000481414	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		7.5	□□□□□ -1.21
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP12-4	P60329	112 aa		7.44	□□□□□ -1.22
KCNS3-205	ENST00000481414	MT1A	P04731	61 aa		7.43	□□□□□ -1.22
KCNS3-205	ENST00000481414	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
KCNS3-205	ENST00000481414	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KCNS3-205	ENST00000481414	SVIP	Q8NHG7	77 aa		7.38	□□□□□ -1.23
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		7.33	□□□□□ -1.24
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		7.32	□□□□□ -1.24
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		7.12	□□□□□ -1.27
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		7.1	□□□□□ -1.27
KCNS3-205	ENST00000481414	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		7.03	□□□□□ -1.28
KCNS3-205	ENST00000481414	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		7.01	□□□□□ -1.29
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		6.96	□□□□□ -1.3
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		6.89	□□□□□ -1.31
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.84	□□□□□ -1.31
KCNS3-205	ENST00000481414	MT3	P25713	68 aa		6.77	□□□□□ -1.33
KCNS3-205	ENST00000481414	LUZP6	Q538Z0	58 aa		6.67	□□□□□ -1.34
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		6.55	□□□□□ -1.36
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.49	□□□□□ -1.37
KCNS3-205	ENST00000481414	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		6.35	□□□□□ -1.39
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP5-8	O75690	187 aa		6.32	□□□□□ -1.4
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		6.12	□□□□□ -1.43
KCNS3-205	ENST00000481414	LCE1E	Q5T753	118 aa		6.1	□□□□□ -1.43
KCNS3-205	ENST00000481414	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		6	□□□□□ -1.45
KCNS3-205	ENST00000481414	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.96	□□□□□ -1.46
KCNS3-205	ENST00000481414	NDUFAF8	A1L188	74 aa		5.89	□□□□□ -1.47
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.88	□□□□□ -1.47
KCNS3-205	ENST00000481414	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		5.74	□□□□□ -1.49
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.69	□□□□□ -1.5
KCNS3-205	ENST00000481414	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
KCNS3-205	ENST00000481414	LCE1C	Q5T751	118 aa		5.65	□□□□□ -1.5
KCNS3-205	ENST00000481414	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		5.65	□□□□□ -1.5
KCNS3-205	ENST00000481414	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.61	□□□□□ -1.51
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		5.07	□□□□□ -1.6
KCNS3-205	ENST00000481414		A0A0A0MQY5	61 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KCNS3-205	ENST00000481414	INE1	O15225	51 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KCNS3-205	ENST00000481414	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
KCNS3-205	ENST00000481414	PRM1	P04553	51 aa		4.62	□□□□□ -1.67
KCNS3-205	ENST00000481414	PHGR1	C9JFL3	82 aa		4.35	□□□□□ -1.71
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		4.3	□□□□□ -1.72
KCNS3-205	ENST00000481414	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.89	□□□□□ -1.79
KCNS3-205	ENST00000481414		H3BS24	57 aa		3.68	□□□□□ -1.82
KCNS3-205	ENST00000481414	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.99	□□□□□ -1.93
KCNS3-205	ENST00000481414	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.76	□□□□□ -1.97

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms