RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481204.5

SKAP2-204, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SKAP2, Length 513 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2-204ENST00000481204 CRIPTQ9P021 101 aa2.69□□□□□ -1.98
SKAP2-204ENST00000481204 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.67□□□□□ -1.98
SKAP2-204ENST00000481204 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.65□□□□□ -1.99
SKAP2-204ENST00000481204 ROMO1P60602 79 aa2.64□□□□□ -1.99
SKAP2-204ENST00000481204 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.63□□□□□ -1.99
SKAP2-204ENST00000481204 MT1BP07438 61 aa2.61□□□□□ -1.99
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.61□□□□□ -1.99
SKAP2-204ENST00000481204 PLAC4Q8WY50 150 aa2.59□□□□□ -1.99
SKAP2-204ENST00000481204 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.57□□□□□ -2
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.54□□□□□ -2
SKAP2-204ENST00000481204 MT1XP80297 61 aa2.53□□□□□ -2
SKAP2-204ENST00000481204 USH2AO75445 5202 aa2.48□□□□□ -2.01
SKAP2-204ENST00000481204 TNP1P09430 55 aa2.47□□□□□ -2.01
SKAP2-204ENST00000481204 SSPOA2VEC9 5147 aa2.43□□□□□ -2.02
SKAP2-204ENST00000481204 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.42□□□□□ -2.02
SKAP2-204ENST00000481204 LCE3AQ5TA76 89 aa2.42□□□□□ -2.02
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.41□□□□□ -2.02
SKAP2-204ENST00000481204 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.41□□□□□ -2.02
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.38□□□□□ -2.03
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.38□□□□□ -2.03
SKAP2-204ENST00000481204 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.37□□□□□ -2.03
SKAP2-204ENST00000481204 PP632Q6XCG6 107 aa2.37□□□□□ -2.03
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.32□□□□□ -2.04
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.31□□□□□ -2.04
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP12-3P60328 96 aa2.29□□□□□ -2.04
SKAP2-204ENST00000481204 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
SKAP2-204ENST00000481204 KMT2DO14686 5537 aa2.27□□□□□ -2.05
SKAP2-204ENST00000481204 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.26□□□□□ -2.05
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.25□□□□□ -2.05
SKAP2-204ENST00000481204 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.23□□□□□ -2.05
SKAP2-204ENST00000481204 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.22□□□□□ -2.05
SKAP2-204ENST00000481204 MT1EP04732 61 aa2.2□□□□□ -2.06
SKAP2-204ENST00000481204 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
SKAP2-204ENST00000481204 MT1LQ93083 61 aa2.17□□□□□ -2.06
SKAP2-204ENST00000481204 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.14□□□□□ -2.07
SKAP2-204ENST00000481204 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.11□□□□□ -2.07
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.09□□□□□ -2.07
SKAP2-204ENST00000481204 MT1MQ8N339 61 aa2.08□□□□□ -2.08
SKAP2-204ENST00000481204 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.08□□□□□ -2.08
SKAP2-204ENST00000481204 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.07□□□□□ -2.08
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP5-8O75690 187 aa2.06□□□□□ -2.08
SKAP2-204ENST00000481204 MT1GP13640 62 aa2.06□□□□□ -2.08
SKAP2-204ENST00000481204 SPRR2EP22531 72 aa2.03□□□□□ -2.08
SKAP2-204ENST00000481204 SPRR2BP35325 72 aa2.03□□□□□ -2.08
SKAP2-204ENST00000481204 SPRR2AP35326 72 aa2.03□□□□□ -2.08
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.03□□□□□ -2.08
SKAP2-204ENST00000481204 LCE1CQ5T751 118 aa1.99□□□□□ -2.09
SKAP2-204ENST00000481204 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.99□□□□□ -2.09
SKAP2-204ENST00000481204 SPRR2DP22532 72 aa1.95□□□□□ -2.1
SKAP2-204ENST00000481204 MDN1Q9NU22 5596 aa1.94□□□□□ -2.1
SKAP2-204ENST00000481204 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
SKAP2-204ENST00000481204 NEBP20929 6669 aa1.9□□□□□ -2.11
SKAP2-204ENST00000481204 INE1O15225 51 aa1.89□□□□□ -2.11
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.89□□□□□ -2.11
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.89□□□□□ -2.11
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.89□□□□□ -2.11
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.85□□□□□ -2.11
SKAP2-204ENST00000481204 MT1AP04731 61 aa1.83□□□□□ -2.12
SKAP2-204ENST00000481204 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.82□□□□□ -2.12
SKAP2-204ENST00000481204 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
SKAP2-204ENST00000481204 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.75□□□□□ -2.13
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.74□□□□□ -2.13
SKAP2-204ENST00000481204 MT4P47944 62 aa1.72□□□□□ -2.13
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.7□□□□□ -2.14
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP12-4P60329 112 aa1.68□□□□□ -2.14
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.68□□□□□ -2.14
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.65□□□□□ -2.15
SKAP2-204ENST00000481204 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.63□□□□□ -2.15
SKAP2-204ENST00000481204 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.62□□□□□ -2.15
SKAP2-204ENST00000481204 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.56□□□□□ -2.16
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.45□□□□□ -2.18
SKAP2-204ENST00000481204 PRM1P04553 51 aa1.41□□□□□ -2.18
SKAP2-204ENST00000481204 MUC5ACP98088 5654 aa1.4□□□□□ -2.19
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.34□□□□□ -2.19
SKAP2-204ENST00000481204 PHGR1C9JFL3 82 aa1□□□□□ -2.25
SKAP2-204ENST00000481204 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.85□□□□□ -2.27
SKAP2-204ENST00000481204 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms