RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 MT1GP13640 62 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-208ENST00000481121 PCP4P48539 62 aa7.47□□□□□ -1.21
NELFE-208ENST00000481121 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
NELFE-208ENST00000481121 PP632Q6XCG6 107 aa7.43□□□□□ -1.22
NELFE-208ENST00000481121 MT1LQ93083 61 aa7.42□□□□□ -1.22
NELFE-208ENST00000481121 A6NED7 52 aa7.4□□□□□ -1.22
NELFE-208ENST00000481121 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.37□□□□□ -1.23
NELFE-208ENST00000481121 MT1MQ8N339 61 aa7.35□□□□□ -1.23
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP12-3P60328 96 aa7.31□□□□□ -1.24
NELFE-208ENST00000481121 H3BS24 57 aa7.27□□□□□ -1.25
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.16□□□□□ -1.26
NELFE-208ENST00000481121 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.14□□□□□ -1.27
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.07□□□□□ -1.28
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.06□□□□□ -1.28
NELFE-208ENST00000481121 ROMO1P60602 79 aa7.01□□□□□ -1.29
NELFE-208ENST00000481121 LCE4AQ5TA78 99 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-208ENST00000481121 LCE1DQ5T752 114 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-208ENST00000481121 MT4P47944 62 aa6.9□□□□□ -1.31
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-208ENST00000481121 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.83□□□□□ -1.32
NELFE-208ENST00000481121 A0A0A0MQY5 61 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFE-208ENST00000481121 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.7□□□□□ -1.34
NELFE-208ENST00000481121 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.68□□□□□ -1.34
NELFE-208ENST00000481121 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-208ENST00000481121 BRK1Q8WUW1 75 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP12-4P60329 112 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-208ENST00000481121 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-208ENST00000481121 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-208ENST00000481121 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.34□□□□□ -1.39
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.33□□□□□ -1.4
NELFE-208ENST00000481121 MT1AP04731 61 aa6.32□□□□□ -1.4
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.28□□□□□ -1.4
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.27□□□□□ -1.41
NELFE-208ENST00000481121 PMAIP1Q13794 54 aa6.15□□□□□ -1.43
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.07□□□□□ -1.44
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.06□□□□□ -1.44
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.05□□□□□ -1.44
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.95□□□□□ -1.46
NELFE-208ENST00000481121 PRAC1Q96KF2 57 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFE-208ENST00000481121 PRO0628Q9UI54 55 aa5.81□□□□□ -1.48
NELFE-208ENST00000481121 MT3P25713 68 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.72□□□□□ -1.49
NELFE-208ENST00000481121 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.7□□□□□ -1.5
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP5-8O75690 187 aa5.67□□□□□ -1.5
NELFE-208ENST00000481121 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.55□□□□□ -1.52
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.43□□□□□ -1.54
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.39□□□□□ -1.55
NELFE-208ENST00000481121 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
NELFE-208ENST00000481121 MUC5ACP98088 5654 aa5.3□□□□□ -1.56
NELFE-208ENST00000481121 LCE1EQ5T753 118 aa5.24□□□□□ -1.57
NELFE-208ENST00000481121 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.99□□□□□ -1.61
NELFE-208ENST00000481121 LUZP6Q538Z0 58 aa4.97□□□□□ -1.61
NELFE-208ENST00000481121 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.94□□□□□ -1.62
NELFE-208ENST00000481121 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.9□□□□□ -1.63
NELFE-208ENST00000481121 LCE1CQ5T751 118 aa4.87□□□□□ -1.63
NELFE-208ENST00000481121 NDUFAF8A1L188 74 aa4.81□□□□□ -1.64
NELFE-208ENST00000481121 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.64□□□□□ -1.67
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.41□□□□□ -1.7
NELFE-208ENST00000481121 LCE1FQ5T754 118 aa4.23□□□□□ -1.73
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.11□□□□□ -1.75
NELFE-208ENST00000481121 PHGR1C9JFL3 82 aa3.8□□□□□ -1.8
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.75□□□□□ -1.81
NELFE-208ENST00000481121 PRM1P04553 51 aa3.6□□□□□ -1.83
NELFE-208ENST00000481121 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.47□□□□□ -1.85
NELFE-208ENST00000481121 INE1O15225 51 aa3.46□□□□□ -1.86
NELFE-208ENST00000481121 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.79□□□□□ -1.96
NELFE-208ENST00000481121 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.43□□□□□ -2.02
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