RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477447.6

TARDBP-208, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-208	ENST00000477447	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		0.11	□□□□□ -2.39
TARDBP-208	ENST00000477447	USH2A	O75445	5202 aa		0.11	□□□□□ -2.39
TARDBP-208	ENST00000477447	DNHD1	Q96M86	4753 aa		0.11	□□□□□ -2.39
TARDBP-208	ENST00000477447	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		0.11	□□□□□ -2.39
TARDBP-208	ENST00000477447	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		0.11	□□□□□ -2.39
TARDBP-208	ENST00000477447	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		0.1	□□□□□ -2.39
TARDBP-208	ENST00000477447	MT1E	P04732	61 aa		0.1	□□□□□ -2.39
TARDBP-208	ENST00000477447	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		0.1	□□□□□ -2.39
TARDBP-208	ENST00000477447	HTN1	P15515	57 aa		0.09	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	MT1H	P80294	61 aa		0.09	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		0.09	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		0.08	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		0.08	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	MUC2	Q02817	5179 aa		0.08	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	MT1L	Q93083	61 aa		0.08	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	0.08	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	PCNT	O95613	3336 aa		0.08	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	CENPE	Q02224	2701 aa		0.07	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	RYR1	P21817	5038 aa		0.07	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	HERC2	O95714	4834 aa		0.07	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		0.07	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		0.07	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	UTRN	P46939	3433 aa		0.07	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	RNF213	Q63HN8	5207 aa		0.07	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	0.07	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		0.06	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		0.06	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		0.06	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		0.06	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	STATH	P02808	62 aa		0.05	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	MT1X	P80297	61 aa		0.05	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		0.05	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	0.05	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	EYS	Q5T1H1	3165 aa		0.04	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	BRCA2	P51587	3418 aa		0.04	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		0.04	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447		A0A096LPF7	62 aa		0.04	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	DEFB4A	O15263	64 aa		0.04	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	VCAN	P13611	3396 aa		0.04	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		0.03	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	CEP350	Q5VT06	3117 aa		0.03	□□□□□ -2.4
TARDBP-208	ENST00000477447	SPEG	Q15772	3267 aa		0.03	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		0.02	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	EP400	Q96L91	3159 aa		0.02	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		0.02	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		0.02	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	COX14	Q96I36	57 aa		0.02	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	CDH23	Q9H251	3354 aa		0.02	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	0.01	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	MT1G	P13640	62 aa		0.01	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		0.01	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		0.01	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	RYR3	Q15413	4870 aa		0.01	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	CD52	P31358	61 aa		0	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		0	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		0	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447		Q9Y3F1	56 aa		-0.01	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	MT2A	P02795	61 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	MT1M	Q8N339	61 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
TARDBP-208	ENST00000477447	CENPF	P49454	3210 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
TARDBP-208	ENST00000477447	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
TARDBP-208	ENST00000477447	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
TARDBP-208	ENST00000477447	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
TARDBP-208	ENST00000477447	MT1B	P07438	61 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
TARDBP-208	ENST00000477447	RYR2	Q92736	4967 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
TARDBP-208	ENST00000477447	MT1HL1	P0DM35	61 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
TARDBP-208	ENST00000477447	HTN3	P15516	51 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
TARDBP-208	ENST00000477447	MT4	P47944	62 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
TARDBP-208	ENST00000477447	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
TARDBP-208	ENST00000477447	NEB	P20929	6669 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
TARDBP-208	ENST00000477447	MT1F	P04733	61 aa		-0.1	□□□□□ -2.43
TARDBP-208	ENST00000477447	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		-0.25	□□□□□ -2.45
TARDBP-208	ENST00000477447	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		-0.27	□□□□□ -2.45

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