RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 MT1GP13640 62 aa4.84□□□□□ -1.63
C9orf3-212ENST00000468164 TNP1P09430 55 aa4.83□□□□□ -1.64
C9orf3-212ENST00000468164 PP632Q6XCG6 107 aa4.83□□□□□ -1.64
C9orf3-212ENST00000468164 K7ERS5 55 aa4.81□□□□□ -1.64
C9orf3-212ENST00000468164 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.8□□□□□ -1.64
C9orf3-212ENST00000468164 MT1MQ8N339 61 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf3-212ENST00000468164 LCE3AQ5TA76 89 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf3-212ENST00000468164 MT1LQ93083 61 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-212ENST00000468164 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-212ENST00000468164 LCE1DQ5T752 114 aa4.75□□□□□ -1.65
C9orf3-212ENST00000468164 MT4P47944 62 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf3-212ENST00000468164 A6NED7 52 aa4.73□□□□□ -1.65
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.71□□□□□ -1.66
C9orf3-212ENST00000468164 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf3-212ENST00000468164 LCE4AQ5TA78 99 aa4.69□□□□□ -1.66
C9orf3-212ENST00000468164 H3BS24 57 aa4.67□□□□□ -1.66
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.63□□□□□ -1.67
C9orf3-212ENST00000468164 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.57□□□□□ -1.68
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP12-3P60328 96 aa4.57□□□□□ -1.68
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.57□□□□□ -1.68
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.55□□□□□ -1.68
C9orf3-212ENST00000468164 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf3-212ENST00000468164 ROMO1P60602 79 aa4.46□□□□□ -1.7
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.44□□□□□ -1.7
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.42□□□□□ -1.7
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.35□□□□□ -1.71
C9orf3-212ENST00000468164 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.34□□□□□ -1.71
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.33□□□□□ -1.72
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.31□□□□□ -1.72
C9orf3-212ENST00000468164 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP12-4P60329 112 aa4.3□□□□□ -1.72
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.29□□□□□ -1.72
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.25□□□□□ -1.73
C9orf3-212ENST00000468164 BRK1Q8WUW1 75 aa4.24□□□□□ -1.73
C9orf3-212ENST00000468164 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.19□□□□□ -1.74
C9orf3-212ENST00000468164 MT1AP04731 61 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.05□□□□□ -1.76
C9orf3-212ENST00000468164 PMAIP1Q13794 54 aa4□□□□□ -1.77
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.99□□□□□ -1.77
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.97□□□□□ -1.77
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.95□□□□□ -1.78
C9orf3-212ENST00000468164 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.93□□□□□ -1.78
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.92□□□□□ -1.78
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.9□□□□□ -1.79
C9orf3-212ENST00000468164 A0A0A0MQY5 61 aa3.87□□□□□ -1.79
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP5-8O75690 187 aa3.85□□□□□ -1.79
C9orf3-212ENST00000468164 PRO0628Q9UI54 55 aa3.8□□□□□ -1.8
C9orf3-212ENST00000468164 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
C9orf3-212ENST00000468164 PRAC1Q96KF2 57 aa3.77□□□□□ -1.81
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.77□□□□□ -1.81
C9orf3-212ENST00000468164 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
C9orf3-212ENST00000468164 MUC5ACP98088 5654 aa3.75□□□□□ -1.81
C9orf3-212ENST00000468164 MT3P25713 68 aa3.71□□□□□ -1.82
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.7□□□□□ -1.82
C9orf3-212ENST00000468164 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.61□□□□□ -1.83
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.59□□□□□ -1.83
C9orf3-212ENST00000468164 LCE1EQ5T753 118 aa3.38□□□□□ -1.87
C9orf3-212ENST00000468164 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.3□□□□□ -1.88
C9orf3-212ENST00000468164 LUZP6Q538Z0 58 aa3.26□□□□□ -1.89
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.23□□□□□ -1.89
C9orf3-212ENST00000468164 LCE1CQ5T751 118 aa3.15□□□□□ -1.91
C9orf3-212ENST00000468164 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.07□□□□□ -1.92
C9orf3-212ENST00000468164 NDUFAF8A1L188 74 aa2.96□□□□□ -1.94
C9orf3-212ENST00000468164 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.91□□□□□ -1.94
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.86□□□□□ -1.95
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
C9orf3-212ENST00000468164 LCE1FQ5T754 118 aa2.79□□□□□ -1.96
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.64□□□□□ -1.99
C9orf3-212ENST00000468164 PHGR1C9JFL3 82 aa2.63□□□□□ -1.99
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.52□□□□□ -2.01
C9orf3-212ENST00000468164 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.43□□□□□ -2.02
C9orf3-212ENST00000468164 PRM1P04553 51 aa2.27□□□□□ -2.05
C9orf3-212ENST00000468164 INE1O15225 51 aa2.22□□□□□ -2.05
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.96□□□□□ -2.1
C9orf3-212ENST00000468164 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.63□□□□□ -2.15
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