RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465846.6

HOXB-AS3-203, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 434 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A1B0GU33 70 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP12-1P59990 96 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-203ENST00000465846 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.65□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-203ENST00000465846 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.6□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A0A1B0GU69 56 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MT1GP13640 62 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.57□□□□□ -1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A8MU10 97 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PP632Q6XCG6 107 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MT3P25713 68 aa6.5□□□□□ -1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MT1MQ8N339 61 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MT1LQ93083 61 aa6.48□□□□□ -1.37
HOXB-AS3-203ENST00000465846 V9GYY9 64 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LCE3AQ5TA76 89 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.43□□□□□ -1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 TNP1P09430 55 aa6.42□□□□□ -1.38
HOXB-AS3-203ENST00000465846 Q1T7F1 81 aa6.36□□□□□ -1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MT4P47944 62 aa6.34□□□□□ -1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRR15LQ9BU68 103 aa6.34□□□□□ -1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.34□□□□□ -1.39
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa6.3□□□□□ -1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.29□□□□□ -1.4
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.25□□□□□ -1.41
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LCE1EQ5T753 118 aa6.23□□□□□ -1.41
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP12-3P60328 96 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HOXB-AS3-203ENST00000465846 UQCR11O14957 56 aa6.12□□□□□ -1.43
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PSPHP1O15172 72 aa6.08□□□□□ -1.44
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.04□□□□□ -1.44
HOXB-AS3-203ENST00000465846 A6NED7 52 aa5.99□□□□□ -1.45
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.99□□□□□ -1.45
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.97□□□□□ -1.45
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
HOXB-AS3-203ENST00000465846 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.95□□□□□ -1.46
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LCE1FQ5T754 118 aa5.93□□□□□ -1.46
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.92□□□□□ -1.46
HOXB-AS3-203ENST00000465846 K7ERS5 55 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXB-AS3-203ENST00000465846 BRK1Q8WUW1 75 aa5.88□□□□□ -1.47
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRO0628Q9UI54 55 aa5.87□□□□□ -1.47
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.86□□□□□ -1.47
HOXB-AS3-203ENST00000465846 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP12-4P60329 112 aa5.82□□□□□ -1.48
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.68□□□□□ -1.5
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PMAIP1Q13794 54 aa5.62□□□□□ -1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRAC1Q96KF2 57 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.58□□□□□ -1.52
HOXB-AS3-203ENST00000465846 NDUFAF8A1L188 74 aa5.56□□□□□ -1.52
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MT1AP04731 61 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.5□□□□□ -1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXB-AS3-203ENST00000465846 ROMO1P60602 79 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.42□□□□□ -1.54
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.37□□□□□ -1.55
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.27□□□□□ -1.57
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP5-8O75690 187 aa5.25□□□□□ -1.57
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
HOXB-AS3-203ENST00000465846 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXB-AS3-203ENST00000465846 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MUC5ACP98088 5654 aa5.12□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa5.11□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LUZP6Q538Z0 58 aa4.41□□□□□ -1.7
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.4□□□□□ -1.71
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LCE1CQ5T751 118 aa4.32□□□□□ -1.72
HOXB-AS3-203ENST00000465846 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.12□□□□□ -1.75
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.62□□□□□ -1.83
HOXB-AS3-203ENST00000465846 INE1O15225 51 aa3.61□□□□□ -1.83
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PHGR1C9JFL3 82 aa3.52□□□□□ -1.85
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.38□□□□□ -1.87
HOXB-AS3-203ENST00000465846 PRM1P04553 51 aa2.8□□□□□ -1.96
HOXB-AS3-203ENST00000465846 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.67□□□□□ -1.98
HOXB-AS3-203ENST00000465846 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms