RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463190.1

ITGB1BP1-208, Transcript of integrin subunit beta 1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB1BP1, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1BP1-208ENST00000463190 TNP1P09430 55 aa5.71□□□□□ -1.5
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CCDC179H3BU77 68 aa5.66□□□□□ -1.5
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MT1LQ93083 61 aa5.66□□□□□ -1.5
ITGB1BP1-208ENST00000463190 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.66□□□□□ -1.5
ITGB1BP1-208ENST00000463190 LCE3AQ5TA76 89 aa5.65□□□□□ -1.5
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MT1MQ8N339 61 aa5.65□□□□□ -1.5
ITGB1BP1-208ENST00000463190 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.6□□□□□ -1.51
ITGB1BP1-208ENST00000463190 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.6□□□□□ -1.51
ITGB1BP1-208ENST00000463190 LCE4AQ5TA78 99 aa5.57□□□□□ -1.52
ITGB1BP1-208ENST00000463190 UQCR11O14957 56 aa5.51□□□□□ -1.53
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MT4P47944 62 aa5.49□□□□□ -1.53
ITGB1BP1-208ENST00000463190 TMEM258P61165 79 aa5.49□□□□□ -1.53
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.49□□□□□ -1.53
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.49□□□□□ -1.53
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP12-3P60328 96 aa5.46□□□□□ -1.54
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.43□□□□□ -1.54
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.39□□□□□ -1.55
ITGB1BP1-208ENST00000463190 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.38□□□□□ -1.55
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.36□□□□□ -1.55
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.35□□□□□ -1.55
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.35□□□□□ -1.55
ITGB1BP1-208ENST00000463190 K7ERS5 55 aa5.33□□□□□ -1.56
ITGB1BP1-208ENST00000463190 V9GYY9 64 aa5.25□□□□□ -1.57
ITGB1BP1-208ENST00000463190 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.21□□□□□ -1.58
ITGB1BP1-208ENST00000463190 PSPHP1O15172 72 aa5.2□□□□□ -1.58
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.19□□□□□ -1.58
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
ITGB1BP1-208ENST00000463190 Q1T7F1 81 aa5.17□□□□□ -1.58
ITGB1BP1-208ENST00000463190 PCP4P48539 62 aa5.16□□□□□ -1.58
ITGB1BP1-208ENST00000463190 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP12-4P60329 112 aa5.12□□□□□ -1.59
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.08□□□□□ -1.6
ITGB1BP1-208ENST00000463190 A6NED7 52 aa5.04□□□□□ -1.6
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.02□□□□□ -1.61
ITGB1BP1-208ENST00000463190 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.01□□□□□ -1.61
ITGB1BP1-208ENST00000463190 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5□□□□□ -1.61
ITGB1BP1-208ENST00000463190 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ITGB1BP1-208ENST00000463190 A0A0A0MQY5 61 aa4.9□□□□□ -1.63
ITGB1BP1-208ENST00000463190 ROMO1P60602 79 aa4.9□□□□□ -1.63
ITGB1BP1-208ENST00000463190 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MT1AP04731 61 aa4.83□□□□□ -1.64
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.78□□□□□ -1.64
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.74□□□□□ -1.65
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.68□□□□□ -1.66
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.59□□□□□ -1.67
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP5-8O75690 187 aa4.54□□□□□ -1.68
ITGB1BP1-208ENST00000463190 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.46□□□□□ -1.7
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MT3P25713 68 aa4.44□□□□□ -1.7
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MUC5ACP98088 5654 aa4.31□□□□□ -1.72
ITGB1BP1-208ENST00000463190 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.26□□□□□ -1.73
ITGB1BP1-208ENST00000463190 BRK1Q8WUW1 75 aa4.2□□□□□ -1.74
ITGB1BP1-208ENST00000463190 LCE1EQ5T753 118 aa4.1□□□□□ -1.75
ITGB1BP1-208ENST00000463190 PRAC1Q96KF2 57 aa4.06□□□□□ -1.76
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
ITGB1BP1-208ENST00000463190 PMAIP1Q13794 54 aa3.95□□□□□ -1.78
ITGB1BP1-208ENST00000463190 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.84□□□□□ -1.79
ITGB1BP1-208ENST00000463190 NDUFAF8A1L188 74 aa3.79□□□□□ -1.8
ITGB1BP1-208ENST00000463190 LCE1CQ5T751 118 aa3.79□□□□□ -1.8
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.71□□□□□ -1.82
ITGB1BP1-208ENST00000463190 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.61□□□□□ -1.83
ITGB1BP1-208ENST00000463190 PRO0628Q9UI54 55 aa3.54□□□□□ -1.84
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.42□□□□□ -1.86
ITGB1BP1-208ENST00000463190 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.39□□□□□ -1.87
ITGB1BP1-208ENST00000463190 LCE1FQ5T754 118 aa3.39□□□□□ -1.87
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.36□□□□□ -1.87
ITGB1BP1-208ENST00000463190 LUZP6Q538Z0 58 aa3.32□□□□□ -1.88
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.15□□□□□ -1.91
ITGB1BP1-208ENST00000463190 PHGR1C9JFL3 82 aa3.04□□□□□ -1.92
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.74□□□□□ -1.97
ITGB1BP1-208ENST00000463190 PRM1P04553 51 aa2.49□□□□□ -2.01
ITGB1BP1-208ENST00000463190 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.32□□□□□ -2.04
ITGB1BP1-208ENST00000463190 INE1O15225 51 aa1.98□□□□□ -2.09
ITGB1BP1-208ENST00000463190 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 80 ms