RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP10-12P60413 245 aa6.23□□□□□ -1.41
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP12-3P60328 96 aa6.13□□□□□ -1.43
SUCLG2-202ENST00000460567 A0A0A0MQY5 61 aa6.11□□□□□ -1.43
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.84□□□□□ -1.48
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.77□□□□□ -1.49
SUCLG2-202ENST00000460567 INE1O15225 51 aa5.64□□□□□ -1.51
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.63□□□□□ -1.51
SUCLG2-202ENST00000460567 USH2AO75445 5202 aa5.63□□□□□ -1.51
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.63□□□□□ -1.51
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.54□□□□□ -1.52
SUCLG2-202ENST00000460567 MT1EP04732 61 aa5.52□□□□□ -1.53
SUCLG2-202ENST00000460567 MT1LQ93083 61 aa5.49□□□□□ -1.53
SUCLG2-202ENST00000460567 SSPOA2VEC9 5147 aa5.48□□□□□ -1.53
SUCLG2-202ENST00000460567 KMT2DO14686 5537 aa5.36□□□□□ -1.55
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.36□□□□□ -1.55
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.32□□□□□ -1.56
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.32□□□□□ -1.56
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.32□□□□□ -1.56
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
SUCLG2-202ENST00000460567 MT1GP13640 62 aa5.26□□□□□ -1.57
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.22□□□□□ -1.57
SUCLG2-202ENST00000460567 MT1MQ8N339 61 aa5.16□□□□□ -1.58
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.09□□□□□ -1.59
SUCLG2-202ENST00000460567 MT3P25713 68 aa5.04□□□□□ -1.6
SUCLG2-202ENST00000460567 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
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SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.98□□□□□ -1.61
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.97□□□□□ -1.61
SUCLG2-202ENST00000460567 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.93□□□□□ -1.62
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP5-9P26371 169 aa4.83□□□□□ -1.64
SUCLG2-202ENST00000460567 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.8□□□□□ -1.64
SUCLG2-202ENST00000460567 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.78□□□□□ -1.64
SUCLG2-202ENST00000460567 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
SUCLG2-202ENST00000460567 MT1AP04731 61 aa4.7□□□□□ -1.66
SUCLG2-202ENST00000460567 SPRR2EP22531 72 aa4.63□□□□□ -1.67
SUCLG2-202ENST00000460567 SPRR2BP35325 72 aa4.63□□□□□ -1.67
SUCLG2-202ENST00000460567 SPRR2AP35326 72 aa4.63□□□□□ -1.67
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP12-4P60329 112 aa4.6□□□□□ -1.67
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.57□□□□□ -1.68
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE1EQ5T753 118 aa4.57□□□□□ -1.68
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.52□□□□□ -1.69
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE1FQ5T754 118 aa4.52□□□□□ -1.69
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.5□□□□□ -1.69
SUCLG2-202ENST00000460567 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SUCLG2-202ENST00000460567 SPRR2DP22532 72 aa4.46□□□□□ -1.7
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.44□□□□□ -1.7
SUCLG2-202ENST00000460567 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.44□□□□□ -1.7
SUCLG2-202ENST00000460567 MDN1Q9NU22 5596 aa4.42□□□□□ -1.7
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.39□□□□□ -1.71
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.36□□□□□ -1.71
SUCLG2-202ENST00000460567 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.14□□□□□ -1.75
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SUCLG2-202ENST00000460567 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.88□□□□□ -1.79
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.87□□□□□ -1.79
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.85□□□□□ -1.79
SUCLG2-202ENST00000460567 MT4P47944 62 aa3.79□□□□□ -1.8
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.77□□□□□ -1.81
SUCLG2-202ENST00000460567 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.54□□□□□ -1.84
SUCLG2-202ENST00000460567 MUC5ACP98088 5654 aa3.34□□□□□ -1.87
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE1CQ5T751 118 aa3.34□□□□□ -1.88
SUCLG2-202ENST00000460567 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.34□□□□□ -1.88
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.34□□□□□ -1.88
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP5-8O75690 187 aa3.22□□□□□ -1.89
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SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.14□□□□□ -1.91
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3□□□□□ -1.93
SUCLG2-202ENST00000460567 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.92□□□□□ -1.94
SUCLG2-202ENST00000460567 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.59□□□□□ -1.99
SUCLG2-202ENST00000460567 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
SUCLG2-202ENST00000460567 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.51□□□□□ -2.01
SUCLG2-202ENST00000460567 PHGR1C9JFL3 82 aa2.45□□□□□ -2.02
SUCLG2-202ENST00000460567 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
SUCLG2-202ENST00000460567 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.62□□□□□ -2.15
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